Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 45 Aligned Residues 329 % Identity 15% Template c2jepB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:xyloglucanase; PDBTitle: native family 5 xyloglucanase from paenibacillus pabuli Resolution 1.4 Å

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		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	N	E	T	A	W	G	N	P	T	V	T	P	E	L	I	K	K	V	K	A	A	G	F	K	S	I	R	I	P	V	S	Y	L	N	N	I	G	S	A	P	N	Y	T	I	N	A	A	W	L	N	R	I	Q	Q	V	V	D	Y	A	Y	N	E	G	L	Y	V	I	I	N	I	H	G	D	G	Y	N	S	V	Q
Template Known Secondary structure				T	T	T	T	S															T	T											G	G	G	B			T	T	T			B																	T	T	T									G	G	G		T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		142	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170			.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.																									.	.
Query SS confidence							.	.																									.	.
Query Sequence		V	Q	Q	Y	G	.	.	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	.	.	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H
Query Conservation							.	.																									.	.
Alig confidence							.	.																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	W	L	L	V	N	G	G	N	Q	T	A	I	K	E	K	Y	K	K	V	W	Q	Q	I	A	T	K	F	S	N	Y	N	D	R	L	I	F	E	S	M	N	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	G	N	Y	G	N	P	N	S	A	Y	Y	T	N	L	N	A
Template Known Secondary structure		T					T	T		S																				T	T	T			T	T							S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S			S	S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	Q	I	F	V	D	T	V	R	Q	T	G	G	N	N	N	A	R	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	V	P	G	W	N	T	N	I	D	Y	T	V	G	N	Y	G	F	T	L	P	T	D	N
Template Known Secondary structure													S	S	G	G	G	G	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G							S	S	S	S							T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.
Template Sequence		Y	R	S	S	A	I	P	S	S	Q	K	R	I	M	I	S	A	H	Y	Y	S	P	W	D	F	A	G	E	E	N	G	N	I	T	.	.	.	Q	W	G	A	T	S	T	N	P	A	K	K	S	T	W	G	Q	E	D	Y	L	E	S	Q	F	K	S	M	Y	D	K	F	V	T	Q	G	Y	P	V	V	I	G	E
Template Known Secondary structure		T	S		T	T	S		T	T													S					T		S	S	S	S			.	.	.	B		S	T	T		S		G	G	G	B		S	S		S															T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280				.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.																			.	.	.	.									.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.		.															.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.																			.	.	.	.									.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.		.															.	.	.	.
Template Sequence		F	G	S	I	D	K	T	.	.	.	S	Y	D	S	S	N	N	V	Y	R	A	A	Y	A	K	A	V	T	.	.	.	.	A	K	A	K	K	Y	K	M	.	.	.	V	P	V	Y	W	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	H	N	G	Q	H	G	F	A	L	F	N	R	S	N	.	.	.	.	N	T
Template Known Secondary structure								T	.	.	.	T	T		T	T														.	.	.	.						T	T		.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	S	.			S	T	T				S			T	T	T	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.																			.	.	.	.									.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.		.															.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330				.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.					.	350	.	.	.	.	.	.				.	.	.	360	.	.	.									.		.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.					.	380
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.
Template Sequence		V	T	Q	Q	.	.	.	.	N	I	I	N	A	I	M	Q
Template Known Secondary structure			S			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.
Template SS confidence
		381	.	.	.					.	.	.	.	.	390	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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