Job Description Q46829 Confidence 99.88% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 65 Aligned Residues 311 % Identity 22% Template c2fglA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline thermostable endoxylanase; PDBTitle: an alkali thermostable f/10 xylanase from alkalophilic2 bacillus sp. ng-27 Resolution 2.20 Å

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		Y	E	E	S	F	D	I	G	A	A	V	E	P	H	Q	L	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	G	K	V	L	K	.	.	H	H	Y	N	S	I	V
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									G	G	G	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.				S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.			40	.	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.														.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	.	.	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	T	N	R	K
Query Conservation																																												.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.												.	.	.															.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.												.	.	.
Template Sequence		A	E	N	A	M	K	P	I	S	L	Q	P	.	.	E	E	G	V	F	T	W	D	G	A	D	.	.	.	A	I	V	E	F	A	R	K	N	N	M	N	L	R	F	H	T	L	V	W	H	N	Q	V	P	D	W	F	F	L	D	E	E	G	N	P	M	V	E	E	T	N	E	A	K	R	Q	A	N	K	E	L
Template Known Secondary structure			S	S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B								.	.	.									T	T								S			S	S	S			G	G	G	G	B		T	T	S	S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure														.	.												.	.	.
Template SS confidence
		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.			.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.				70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.													.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Sequence		L	L	E	R	L	E	T	H	I	K	T	V	V	E	R	Y	K	D	D	V	T	A	W	D	V	V	N	E	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	G	T	P	N	E	R	G	L	R	E	S	V	W	Y	Q	I	T	G	D	.	.	E	Y	I	R	V	A	F	E	T	A	R	K	Y
Template Known Secondary structure																		T	T	T		S							S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		S	S	T	T		B			S							T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.															.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.			.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	E	D	A	K	L	F	I	N	D	Y	N	T	.	.	.	.	.	.	E	V	T	P	K	R	D	H	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	V	Q	D	L	L	A	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	I	D	G
Template Known Secondary structure				T	T	S							S		T	.	.	.	.	.	.	T	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.							200	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					210	.	.	.	.	.	.	.	.	.																220	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		V	G	H	Q	A	H	I	Q	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	T	I	D	E	I	R	T	S	M	E	M	F	.	A	G	L	G	L	D	N	Q	V	T	E	L	D	V	S	L	Y	G	W	P	P	R	P	A	F
Template Known Secondary structure										S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S													.		T	T	T												S	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.		.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		392	.	.					.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.										.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	N	D	.	.	.	.	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S
Query Conservation					.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.																																											.		.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	Y	D	A	I	P	Q	E	R	F	Q	A	Q	A	D	R	Y	N	Q	L	F	E	L	Y	E	E	L	D	A	D	L	S	S	V	T	F	W	G	I	A	D	N	H	T	W	L	D	D	.	R	A	R	E	Y	N	D	G	V	G	K	D	A	P	F	V	F	D	P	N	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	S	T	T	S																						T	T	T	T							S	S	S	S	T	T	S		T				.						T	T	T							S	S	B		T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	V	K	P	A	F	W	R	I	I	D
Template Known Secondary structure		.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				345	.	.	.	.	350	.	.	.	.