Job Description Q46829 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 308 % Identity 15% Template c2depA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:thermostable celloxylanase; PDBTitle: crystal structure of xylanase b from clostridium2 stercorarium f9 Resolution 1.80 Å

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		3	.	.	.	.			.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure							.	.
Query SS confidence							.	.
Query Sequence		V	K	K	L	T	.	.	L	P	K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F
Query Conservation							.	.
Alig confidence							.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	S	L	A	E	A	F	R	D	Y	F	P	I	G	A	A	I	E	P	G	Y	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	I	A	E	L
Template Known Secondary structure									T	T	T	T									G	G	G	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	70	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90			.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.																																								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.																																								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	.	.	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	.	.	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.																																								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.										.	.									.	.	.																		.	.																.			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.									.	.	.																																			.
Template Sequence		Y	K	K	H	V	N	M	L	V	A	E	N	A	M	K	P	A	S	L	Q	P	.	.	T	E	G	N	F	Q	W	A	.	.	.	D	A	D	R	I	V	Q	F	A	K	E	N	G	M	E	L	R	F	H	T	L	V	W	H	N	Q	T	P	D	W	F	F	L	D	.	K	E	G	K	P	M	V	E	E	T	D
Template Known Secondary structure							S					S	S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B					.	.	.												T	T											S	S	S			G	G	G	G	B		.	T	T	S	S	B	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																							.	.									.	.	.																																			.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.			.	.	.	.	.	100	.	.				.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.		.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
							148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	K	R	E	E	N	R	K	L	L	L	Q	R	L	E	N	Y	I	R	A	V	V	L	R	Y	K	D	D	I	K	S	W	D	V	V	N	E	V	I	E	P	N	D	P	G	G	M	R	N	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Y	Q	I	T	G	T	E	Y	I
Template Known Secondary structure																												T	T	T											B		T	T	S	G	G	G	B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	A	F	R	A	T	R	E	A	G	G	S	D	I	K	L	Y	I	N	D	Y	N	T	D	D	P	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	I	L	Y	E	L	V	K	N	L	L	E	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S	S	S							S		T	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		.	.	.	.	V	P	I	D	G	V	G	H	Q	T	H	I	D	I	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	P	V	E	R	I	I	E	S	I	K	K	F	.	A	G	L	G	L	D	N	I	I	T	E	L	D	M	S	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.														S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S													.		T	T	T												S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
						254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.		.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.							.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.					.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	.	.	.	.	.	.	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	.	.	.	.	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D
Query Conservation													.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.													.	.	.	.																												.					.	.	.	.										.	.
Template Conservation																															.	.	.	.																												.																		.	.
Template Sequence		Y	S	W	N	D	R	S	D	Y	G	D	S	I	P	D	Y	I	L	T	L	Q	A	K	R	Y	Q	E	L	F	.	.	.	.	D	A	L	K	E	N	K	D	I	V	S	A	V	V	F	W	G	I	S	D	K	Y	S	W	L	N	G	.	F	P	V	K	R	T	N	A	P	L	L	F	D	R	N	F	M	.	.
Template Known Secondary structure		S		T	T							S																			.	.	.	.					T	T	G	G	G							S		S	B	T	T	S		G	G	G	T	.	S	S	S	S	S					S	S	B		T	T	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.																												.																		.	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.					.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	A	F	W	A	I	V	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										372	.	.	.	.	.	.	.	380	.