Job Description Q46829 Confidence 99.49% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 96 Aligned Residues 260 % Identity 17% Template c2cksB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:endoglucanase e-5; PDBTitle: x-ray crystal structure of the catalytic domain of2 thermobifida fusca endoglucanase cel5a (e5) Resolution 1.6 Å

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		74	.	.	.	.		.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		K	E	D	I	K	.	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K
Query Conservation							.
Alig confidence							.																						.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	S	S	L	D	A	L	A	Y	D	W	K	A	D	I	I	R	L	S	M	Y	I	Q	E	D	G	Y	.	.	.	.	E	T	N	P	R	G	F	T	D	R	M	H	Q	L	I	D	M	A	T	A	R	G	L	Y	V	I	V	D	W	H	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	G	D	P	H	Y
Template Known Secondary structure											T	S			S								S	S	T	T	S	G	.	.	.	.	G	G																		T	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.					.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.											.	.	230	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.		.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	H	K	V	K	Y	.	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	L	D	R	A	K	T	F	F	A	E	I	A	Q	R	H	A	S	K	T	N	V	L	Y	E	I	A	N	E	P	N	G	V	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	I	K	S	Y	A	E	E	V	I	P	V	I	R	Q
Template Known Secondary structure		G															T	T	T		S	S							S				S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	P	D	S	V	I	I	V	G	T	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	S	L	G	V	S	E	G	S	G	P	A	E	I	A	A	N	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	S	N	I	M
Template Known Secondary structure				T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	T	T	G	G	G	T			T						S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	320	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Sequence		Y	A	F	H	F	Y	A	A	S	H	R	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	N	A	L	R	E	A	S	E	L	F	.	.	P	V	F	V	T	E	F	G	T	E	T	Y	T	G	D	G	A	N	D	F
Template Known Secondary structure								T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	.	.									S	S		T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.			350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.														.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	A	D	R	Y	I	D	L	M	A	E	R	K	I	.	.	.	G	W	T	K	W	N	Y	S	D	D	F	R	S	G	A	V	.	F	Q	P	G	.	.	.	.	.	.	T	C	A	S	G	G	P	W	S	G	S	S	L	.	K	A	S	G	Q	W	V	R	S	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T		.	.	.								S			S	S	T	T	S	S	.	B		T	T	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T			S	S	G	G	G	B	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																	.					.	.	.	.	.	.														.
Template SS confidence
													370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.				.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400		.	.	.	.							.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.		.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		472	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	S
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		428	.	430

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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