Job Description Q46829 Confidence 98.13% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 123 Aligned Residues 276 % Identity 16% Template c2c8nD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:alpha-l-arabinofuranosidase; PDBTitle: the structure of a family 51 arabinofuranosidase, araf51,2 from clostridium thermocellum in complex with 1,3-linked3 arabinoside of xylobiose. Resolution 2.9 Å

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	V	I	E	L	V	K	E	L	N	V	P	I	I	R	Y	P	G	G	N	F	V	S	N	Y	F	W	E	D	G	V	G	P	V	E	D	R	P	R	R	L	D	L	A	W	K	S	I	E	P	N	Q	.	V	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	F	A	K	W	C	K	K	V	N	A	E	I
Template Known Secondary structure												T							S		S	G	G	G	G	G			G	G	G	G	S	S		T	T	T							T	T	T	T							.	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.		.	.	.										.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.																170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	M	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	G	T	R	G	I	S	D	A	C	N	L	L	E	Y	C	N	H	P	G	G	S	K	Y	S	D	M	R	I	K	H	G	V	K	E	P	H	N	I	K	V	W	C	L	G	N	A	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S																	S	S	S									T	T			S										S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.																.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L	Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	P	W	Q	V	G	H	K	T	M	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	R	I	A	E	E	T	A	R	A	M	K	M	I	D	P	S	I	E	L	V	A	C	G	S	S	S	K	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S	T	T	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T									S		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.									.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G	T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	P	T	F	P	Q	W	E	A	T	V	L	D	Y	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	V	D	Y	I	S	L	H	Q	Y	Y	G	N	K	E	N	D	T	A	D	F	L	A	K	S	D	D	L	D	D	F	I	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T	T	T											G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G													T	T								T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.																.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370					.	.	.	.	.	.	.	.	.	380															.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	.	.	.	.	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E	M	K	K	A	V	T	Y	D
Query Conservation																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.														.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																																								.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	V	I	A	T	C	D	Y	I	K	A	K	K	R	S	K	K	D	I	Y	L	S	F	D	E	W	N	V	W	Y	H	S	N	N	E	D	A	N	I	Q	N	E	P	W	R	I	A	P	P	L	L	E	D	I	Y	T	F	E	D	A	L	L	V	G	L	M	L	I	T	L	M	K	.	.	.	.	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.													T		S															T	T										S				S	S				S					B																	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
						269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.					340
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	R	I	K	I	A	C	L	A	Q	L	I	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	P	I	V	T	E	R	N	.	.	.	.	.	G	G	A	A	W	R	Q	T	I	F	Y	P	F	M	H	A	S	K	Y	G	R
Template Known Secondary structure		T	T	T									S	B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S					S	S	.	.	.	.	.	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.												.	.	.	360	.	.	.	.	.						.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.