Job Description Q46829 Confidence 99.65% Date Thu Jan 5 12:34:51 GMT 2012 Rank 84 Aligned Residues 292 % Identity 20% Template c1iszA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endo-1,4-beta-d-xylanase; PDBTitle: crystal structure of xylanase from streptomyces2 olivaceoviridis e-86 complexed with galactose Resolution 2.00 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	F	L	W	G	G	A	V	A	A	H	Q	V	E	G	G	W	N	K	G	G	K	G	P	S	I	C	D	V	L	T	G	G	A	H	G	V	P	R	E	I	T	K	E	V	L	P	G	K	Y	Y	P	N	H	E	A	V	D	F	Y	G	H	Y	K	E	D	I	K	L	F	A	E	M	G	F	K	C	F	R
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template Sequence		S	G	R	Y	F	G	T	A	I	A	S	G	K	L	G	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	T	T	I	A	S	.	.	R	E	F	N	M	V	T	A	E
Template Known Secondary structure		T	T									G	G	G	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.				S					S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	30	.	.	.	.	.			.	.	.	.	40	.	.	.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.
Query SS confidence																																									.	.
Query Sequence		T	S	I	A	W	T	R	I	F	P	K	G	D	E	A	Q	P	N	E	E	G	L	K	F	Y	D	D	M	F	D	E	L	L	K	Y	N	I	E	P	.	.	V	I	T	L	S	H	F	E	M	P	L	H	L	V	Q	Q	Y	G	S	W	T	N	R	K	V	V	D	F	F	V	R	F	A	E	V	V	F	E	R
Query Conservation																																									.	.
Alig confidence												.	.												.	.	.														.	.																.	.	.	.
Template Conservation												.	.												.	.	.																															.	.	.	.
Template Sequence		N	E	M	K	I	D	A	T	E	P	.	.	Q	R	G	Q	F	N	F	S	A	G	D	.	.	.	R	V	Y	N	W	A	V	Q	N	G	K	Q	V	R	G	H	T	L	A	W	H	S	Q	Q	P	G	W	M	Q	S	.	.	.	.	L	S	G	S	T	L	R	Q	A	M	I	D	H	I	N	G	V	M	G	H
Template Known Secondary structure		S	T	T	S						S	.	.	B	T	T	B								.	.	.									T	T											S	S	S								.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.												.	.	.																															.	.	.	.
Template SS confidence
		45	.	.	.	.	50	.	.	.	.			.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.				.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.					.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	H	K	V	K	Y	W	M	T	F	N	E	I	N	N	Q	R	N	W	R	A	P	L	F	G	Y	C	C	S	G	V	V	Y	T	E	H	E	N	P	E	E	T	M	Y	Q	V	L	H	H	Q	F	V	A	S	A	L	A	V	K	A	A	R	R	I	N	P	E	M	K	V	G	C	M	L	A	M	V	P	L
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		Y	K	G	K	I	A	Q	W	D	V	V	N	E	A	F	S	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	G	G	R	R	D	S	N	L	Q	R	T	G	N	D	W	I	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	F	R	T	A	R	A	A	D	P	A	A	K	L	C	Y	N	D	Y	N	I	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		S									B		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			B			S	T	T	G	G	G		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	S							S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.											.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.										.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	Y	S	C	N	P	D	D	V	M	F	A	Q	E	S	M	R	E	R	Y	V	F	T	D	V	Q	L	R	G	Y	Y	P	S	Y	V	L	N	E	W	E	R	R	G	F	N	I	K	M	E	D	G	D	L	D	V	L	R	E	G	T	C	D	Y	L	G	F	S	Y	Y	M	T	N	A	V	K	A	E	G	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	E	N	W	T	W	A	K	T	Q	G	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	V	R	D	F	K	Q	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	I	D	C	V	G	F	Q	S	H	F	N	S	G	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.		S	T	T	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													B	T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	190	.	.	.	.	.	.																.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	D	A	I	S	G	F	E	G	S	V	P	N	P	Y	V	K	A	S	D	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	Y	A	L	C	E	L	Y	E	R	Y	Q	R	P	L	F	I	V	E	N	G	F	G	A	Y	D	K	V	E	E	D	G	S	I	N	D	D	Y	R	I	D	Y	L	R	A	H	I	E	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	Y	N	S	N	F	R	T	T	L	Q	N	F	.	A	A	L	G	V	D	V	A	I	T	E	L	D	I	Q	G	A	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	Y	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B				T	T									.		T	T	T											T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.		.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	K	K	A	V	T	Y	D	G	V	D	L	M	G	Y	T	P	W	G	C	I	D	C	V	S	F	T	T	G	Q	Y	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	N	K	H	D	D	G	T	G	D	M	S	R	S	R	K	K	S	F	N	W	Y	K	E	V	I	A	S	N	G	E
Query Conservation
Alig confidence								.																										.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.																										.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	N	D	C	L	.	A	V	S	R	C	L	G	I	T	V	W	G	V	R	D	T	D	S	W	R	S	G	D	T	P	.	.	.	L	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	D	G	S	K	K	A	A	Y	T	A	V	L	N	A	L	N	G	G	G	Q
Template Known Secondary structure								.	T		T	T							S		S	B	G	G	G	S	T	T	G	G	G			.	.	.	S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B												T
Template Predicted Secondary structure								.																										.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280				.	.	.											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.