Job Description P75712 Confidence 99.73% Date Thu Jan 5 12:13:21 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 412 % Identity 12% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

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		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.		.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
Predicted Secondary structure																															.																																					.
Query SS confidence																															.																																					.
Query Sequence		R	T	W	K	T	F	N	Y	F	T	L	W	M	G	S	V	H	N	V	P	N	Y	V	M	V	G	G	F	F	.	I	L	G	L	S	T	F	S	I	M	L	A	I	I	L	S	A	F	F	I	A	A	V	M	V	L	N	G	A	A	G	S	K	Y	G	V	.	P	F	A	M	I	L	R	A	S	Y	G	V	R
Query Conservation																															.																																					.
Alig confidence																															.																														.	.	.					.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		V	S	L	P	W	W	A	V	G	A	S	L	I	A	A	N	I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	S	G	Y	S	I	G	L	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	I	F	I	.	.	.	E	K	G	I	Y	T	I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K
Template Known Secondary structure															G	G	G	S	S														T		G	G	G	G																T							.	.	.		T	T			S									T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.				.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure																																																																												.
Query SS confidence																																																																												.
Query Sequence		G	A	L	F	P	G	L	L	R	G	G	I	A	A	I	M	W	F	G	L	Q	C	Y	A	G	S	L	A	C	L	I	L	I	G	K	I	W	P	G	F	L	T	L	G	G	D	F	T	L	L	G	L	S	L	P	G	L	I	T	F	L	I	F	W	L	V	N	V	G	I	G	F	G	G	.	G	K	V	L	N
Query Conservation																																																																												.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	T	I	L	A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D
Template Known Secondary structure																	T																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.														.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	F	T	A	I	L	N	P	C	I	Y	I	V	F	G	G	M	A	I	W	A	I	S	L	V	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	I	F	D	Y	I	P	S	G	I	Q	K	A	E	N	G	G	F	L	F	L	V	V	I	N	A	V	V	A	V	W	A	A	P	A	V	S	A	S
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F	I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y
Template Known Secondary structure																									G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		249	250	.	.	.			.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.														.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	T	Q	N	.	.	A	H	S	F	R	E	Q	A	L	G	Q	T	L	G	L	V	V	A	Y	I	L	F	A	V	A	G	V	C	I	I	A	G	A	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	G	A	D	T	W	N	V	L	D	I	V	Q	R	W	D	S	L	F	A	S	F	F	A
Query Conservation							.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F	A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V
Template Known Secondary structure								T	T	S																T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.												.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	V	I	L	M	T	T	I	S	T	N	A	T	G	N	I	I	P	A	G	Y	Q	I	A	A	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	K	L	T	Y	K	N	G	V	L	I	A	S	I	I	S	L	L	I	C	P	W	K	L	M	E	N	Q	D	S	I	Y	L	F	L	D	I	I	G	G
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	.	M	L	N	S	T	A	T	I	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L
Template Known Secondary structure																.													T					T		S																										G	G	G	G	G	G		B											T	T
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	G	P	V	I	G	V	M	M	A	H	Y	F	V	V	M	R	G	Q	I	N	L	D	E	L	Y	T	A	P	G	D	Y	K	Y	Y	D	N	G	F	N	L	T	A	F	S	V	T	L	V	A	V	I	L	S	L	G	G	K	F	I	H	F	M	E	P	L	S	R	V	S	W	F	V	G	V	I	V	A	F
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Sequence		V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	W	K	K	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	M	P	L	S	M	P	F	M	D	.	Q	M	L	Y	T	L	L	F	T	M
Template Known Secondary structure		T															T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				S	S								.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.		.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	Y	A	L	L	K	K	R	T	T	A	E	K	T	G	E	Q	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	V	I	A	F	T	S	L	S	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G
Template Known Secondary structure													S	S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510