Job Description P37751 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:28 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 364 % Identity 14% Template d1rzua_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.				.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	V	V	V	S	A	V	N	F	T	.	.	.	T	G	G	P	F	T	I	L	K	K	F	L	A	A	T	N	N	K	E	N	V	S	F	I	A	L	V	H	S	A	K	E	L	K	E	S	Y	P	W	V	K	F	I	E	F	P	E	V	K	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	V	L	S	V	S	S	E	I	Y	P	L	I	K	T	G	G	L	A	D	V	V	G	A	L	P	I	A	L	E	A	H	G	V	R	T	R	T	L	I	P	G	Y	P	A	V	K	A	A	V	T	D	P	V	K	C	F	E	F	T	D	L	L	G	E	K	A	D	L	L	E	V	Q	H	E	R	L	D	L	L
Template Known Secondary structure								S		B	T	T	T	B		S	S															T	T	T																			S								S		S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
																															66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.		.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	K	R	L	H	F	E	Y	V	V	C	K	K	L	S	K	E	L	N	A	T	H	W	I	C	L	H	D	I	T	A	N	V	V	T	K	K	R	Y	V	Y	C	.	H	N	P	A	P	F	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	D	A	P	A	Y	Y	E	R	S	G	G	P	Y	L	G	Q	T	G	K	D	Y	P	D	N	W	K	R	F	A	A	L	S	L	A	A	A	R	I	G	A	G	V	L	P	G	W	R	P	D	M	V	H	A	H	D	W	Q	A	A	M	T	P	V	Y	M	R	Y	A	E	T	P	E	I	P	S	L	L	T
Template Known Secondary structure											S	S	S		S	S	B		T	T	S	S	B		T	T																	T	T		S	S	S				S										T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.															140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.												.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	I	L	F	R	E	I	L	M	E	P	S	F	F	L	F	K	M	L	Y	G	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	I	N	I	K	K	N	T	A	V	F	V	Q	Q	F	W	M	K	E	K	F	I	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	I	N	N	I
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	H	N	I	A	F	Q	G	Q	F	G	A	N	I	F	S	K	L	A	L	P	A	H	A	F	G	M	E	G	I	E	Y	Y	N	D	V	S	F	L	K	G	G	L	Q	T	A	T	A	L	S	T	V	S	P	S	Y	A	E	E	I	L	T	A	E	F	G	M	G	L	E	G	V	I	G	S	R	A	H	V	L
Template Known Secondary structure			S		T	T							G	G	G	G	G	G	S				G	G	G	S	S	T	T	T	T			T	T													S					S								T	T	S					T	T							T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	S	R	P	E	I	K	L	S	D	K	S	Q	L	T	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	Q	F	K	N	N	P	S	E	L	T	I	F	Y	P	A	V	P	R	V	F	K	N	Y	E	L	I	I	S	A	A	R	K	L	K	E	Q	S	N
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		H	G	I	V	N	G	I	D	A	D	V	W	N	P	A	T	D	H	L	I	H	D	N	Y	S	A	A	N	L	K	N	R	A	L	N	K	K	A	V	A	E	H	F	R	I	D	D	D	G	S	P	L	F	C	V	I	S	R	L	T	W	Q	K	G	I	D	L	M	A	E	A	V	D	E	I	V	S	L	.	G
Template Known Secondary structure								B		T	T	T	S		T	T	T		T	T	S	S	S			B	T	T	B		T	T													T				S	S	S							S		B	S	T	T	T	T						T	T							T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.		320
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	F	L	L	T	I	S	G	T	E	N	A	Y	A	K	Y	I	I	S	L	A	E	G	L	D	N	V	H	F	L	G	Y	L	D	K	E	K	I	D	H	C	Y	N	I	S	D	I	V	C	F	P	S	R	L	E	T	W	G	L	P	L	S	E	A	K	E	R	G	K	W	V	L	A	S	D	F	P	F	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	R	L	V	V	L	G	A	G	D	V	A	L	E	G	A	L	L	A	A	A	S	R	H	H	G	R	V	G	V	A	I	G	Y	N	E	P	L	S	H	L	M	Q	A	G	C	D	A	I	I	I	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	A	L	R	Y	G	C	I	P	V	V	A	R	T	G	G	L
Template Known Secondary structure										B															T	T	T	T						S														S							S			S	S		S									T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		309	310	.	.	.	.										.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.					.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.			.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.															.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.															.	.
Query Sequence		R	E	T	L	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	K	K	A	F	F	D	S	N	N	D	D	M	L	V	K	L	I	I	D	F	K	.	.	.	.	K	G	N	L	K	K	D	I	S	D	A	N	F	I	.	.	Y	R	N	E	N	V	L	V	G	F	D	E	L	V	N	F	I
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.															.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.															.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	T	V	I	D	A	N	H	A	A	L	A	S	K	A	A	T	G	V	Q	F	S	P	V	T	L	D	G	L	K	Q	A	I	R	R	T	V	R	Y	Y	H	D	P	K	L	W	T	Q	M	Q	K	L	G	M	K	S	D	V	S	W	E	K	S	A	G	L	Y	A	A	L	Y	S	Q	L
Template Known Secondary structure							B								T	T				B				S	S		S																T														T				B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.