Job Description P37751 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:28 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 368 % Identity 14% Template c3s29C_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:sucrose synthase 1; PDBTitle: the crystal structure of sucrose synthase-1 from arabidopsis thaliana2 and its functional implications. Resolution 2.85 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.											.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.												.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	K	S	I	V	V	V	S	A	V	N	F	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	P	F	T	I	L	K	K	F	L	A	A	T	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	N	V	S	F	I	A	L	V	H	S	A	K	E	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	V	F	N	V	V	I	L	S	P	H	G	Y	F	A	Q	D	N	V	L	G	Y	P	D	T	G	G	Q	V	V	Y	I	L	D	Q	V	R	A	L	E	I	E	M	L	Q	R	I	K	Q	Q	G	L	N	I	K	P	R	I	L	I	L	T	R	L	L	P	D	A	V	G	T	T	C	G	E	R	L	E	R	V
Template Known Secondary structure				S								S	S				S	S	S		T	T	S	T	T		S																								T	T															T	T			S	S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.															.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	S	Y	P	W	V	K	F	I	E	F	P	E	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	W	L	K	R	L	H	F	E	Y	V	V	C	K	K	L	S	K	E	L	N	A	T	H	W	I	C	L	H	D	I	T	A	N	V	V	T	K	K	R	Y	V	Y	C	H	N	P	A	P	F
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		Y	D	S	E	Y	C	D	I	L	R	V	P	F	R	T	E	K	G	I	V	R	K	W	I	S	R	F	E	V	W	P	Y	L	E	T	Y	T	E	D	A	A	V	E	L	S	K	E	L	N	G	K	P	D	L	I	I	G	N	.	Y	S	D	G	N	L	V	A	S	L	L	A	H	K	L	G	V	T	Q	C	T
Template Known Secondary structure		T	T		S	S											T	T					S				G	G	G		G	G	G																	S	S			S						.																T
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.		.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.								.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	G	I	L	F	R	E	I	L	M	E	P	S	.	.	.	.	.	.	.	F	F	L	F	K	M	L	Y	G	L	I	Y	K	I	N	I	K	K	N	T	A	V	F	V	Q	Q	F	W	M	K	E	K	F	I	K	K	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	A	H	A	L	E	K	T	K	Y	P	D	S	D	I	Y	W	K	K	L	D	D	K	Y	H	F	S	C	Q	F	T	A	D	I	F	A	M	N	H	T	D	F	I	I	T	S	T	F	Q	E	I	A	G	S	K	E	T	V	G	Q	Y	E	S	H	T	A	F	T	L	P	G	L	Y	R	V	V	H	G	I	D
Template Known Secondary structure				S							S	T	T	T	T	T	T																								S	S					S		S							S	S	S			T	T	G	G	G	S	S				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
				167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure		.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	I	N	N	I	I	V	S	R	P	E	I	K	L	S	D	K	S	Q	L	T	D	D	D	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	N	N	P	S	E	L	T	I	F	Y	P	A	V	P	R	V	F	K	N	Y	E	L	I	I	S	A	A	R
Query Conservation		.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	F	D	P	K	F	N	I	V	S	P	G	A	D	M	S	I	Y	F	P	Y	T	E	E	K	R	R	L	T	K	F	H	S	E	I	E	E	L	L	Y	S	D	V	E	N	K	E	H	L	C	V	L	K	D	K	K	K	P	I	L	F	T	M	A	R	L	D	R	V	K	N	L	S	G	L	V	E	W	Y	G
Template Known Secondary structure		T	T		T	T										T	T	T				T	T		T	T	T	S		G	G	G											S			S	S	S			S		B	S		T	T	S										S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240													.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260		.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.					.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.															.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.															.	.	.	.
Query Sequence		K	L	K	E	Q	S	N	I	K	F	L	L	T	I	S	G	T	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	A	K	Y	I	I	S	L	A	E	G	L	D	N	V	H	F	L	G	.	Y	L	D	K	E	K	I	D	H	C	Y	N	I	S	.	.	.	.	D	I	V	C	F	P	S	R	L	E
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.															.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	N	T	R	L	R	E	L	A	N	L	V	V	V	G	G	D	R	R	K	E	S	K	D	N	E	E	K	A	E	M	K	K	M	Y	D	L	I	E	E	Y	K	L	N	G	Q	F	R	W	I	S	S	Q	M	D	R	V	R	N	G	E	L	Y	R	Y	I	C	D	T	K	G	A	F	V	Q	P	A	L	Y	E
Template Known Secondary structure																			T	T	S																					T	T		T	B	T																							T	T								S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.						.	.	340	.	.	.	.	.			.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.									.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.									.	.
Query Sequence		T	W	G	L	P	L	S	E	A	K	E	R	G	K	W	V	L	A	S	D	F	P	F	T	R	E	T	L	G	S	Y	E	K	K	A	F	F	D	S	N	N	D	D	M	L	V	K	L	I	I	D	F	K	.	.	.	.	.	K	G	N	L	K	K	D	I	.	.	S	D	A	N	F	I	Y	R	N	E	N	V
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.									.	.
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	G	L	T	V	V	E	A	M	T	C	G	L	P	T	F	A	T	C	K	G	G	P	A	E	I	I	V	H	G	K	S	G	F	H	I	D	P	Y	H	G	D	Q	A	A	D	T	L	A	D	F	F	T	K	C	K	E	D	P	S	H	W	D	E	I	S	K	G	G	L	Q	R	I	E	E	K	Y	T	W
Template Known Secondary structure		S	S											T							S	S	B	T							B	T	T	T	B					T	T	S																			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		676	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	G	F	D	E	L	V	N	F	I	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	Y	S	Q	R	L	L	T	L	T	G
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		756	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.