Job Description P37751 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:28 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 369 % Identity 12% Template c2r60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1; PDBTitle: structure of apo sucrose phosphate synthase (sps) of2 halothermothrix orenii Resolution 1.80 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.													.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.											.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	S	I	V	V	V	S	A	V	N	F	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	P	F	T	I	L	K	K	F	L	A	A	T	N	N	K	E	N	V	S	F	I	A	L	V	H	S	A	K	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	S	Y	P	W	V	K	F	I	E	F	P
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	H	V	A	F	L	N	P	Q	G	N	F	D	P	A	D	S	Y	W	T	E	H	P	D	F	G	G	Q	L	V	Y	V	K	E	V	S	L	A	L	A	E	M	G	V	Q	V	D	I	I	T	R	R	I	K	D	E	N	W	P	E	F	S	G	E	I	D	Y	Y	Q	E	T	N	K	V	R	I	V	R	I	P
Template Known Secondary structure										S	S				T	T		T	T	T	T	S	B	T	T	B	S																T	T												B	T	T	B	G	G	G			S					T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		61	.	.	.	.	.	.							.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.			.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.										.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.																			.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.																			.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	V	K	G	S	W	L	.	.	.	.	.	.	K	R	L	H	F	E	Y	V	V	C	K	K	L	S	K	E	L	N	.	.	A	T	H	W	I	C	L	H	D	I	T	A	N	V	V	T	K	K	R	Y	V	Y	C	H	N	P	A	P	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	I	L	F	R	E	I
Query Conservation									.	.	.	.	.	.																			.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																			.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	G	D	K	F	L	P	K	E	E	L	W	P	Y	L	H	E	Y	V	N	K	I	I	N	F	Y	R	E	E	G	K	F	P	Q	V	V	T	T	H	Y	G	D	G	G	L	A	G	V	L	L	K	N	I	K	G	L	P	F	T	F	T	G	H	S	L	G	A	Q	K	M	E	K	L	N	V	N	T	S	N
Template Known Secondary structure			S		S	S				G	G	G		G	G	G																T				S																													S	S								T	T				S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.										.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query Sequence		L	M	E	P	S	F	F	L	F	K	M	L	Y	G	L	I	Y	K	I	N	I	K	K	N	T	A	V	F	V	Q	Q	F	W	M	K	E	K	F	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	S	I	N	N	I	I	V	S	R	P	E	I	K	L	S	D	K	S	Q	L	T	D	D	D	S	Q	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	E	M	D	E	R	F	K	F	H	R	R	I	I	A	E	R	L	T	M	S	Y	A	D	K	I	I	V	S	T	S	Q	E	R	F	G	Q	Y	S	H	D	L	Y	R	G	A	V	N	V	E	D	D	D	K	F	S	V	I	P	P	G	V	N	T	R	V	F	D	G	E	Y	G	D	K	I	K	A	K	I
Template Known Secondary structure		S																								S					S	S							T	T	T	S	G	G	G	T	T	T			T	T		G	G	G								B		T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
										192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.																		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	N	N	P	S	E	L	T	I	F	Y	P	A	V	P	R	V	F	K	N	Y	E	L	I	I	S	A	A	R	K	L	K	E	Q	S	N	I	K	F	L	L	T	I	S	G	T	E	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	K	Y	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	K	Y	L	E	R	D	L	G	S	E	R	M	E	L	P	A	I	I	A	S	S	R	L	D	Q	K	K	N	H	Y	G	L	V	E	A	Y	V	Q	N	K	E	L	Q	D	K	A	N	L	V	L	T	L	R	G	I	E	N	P	F	E	D	Y	S	R	A	G	Q	E	E	K	E	I	L	G	K	I	I	E	L
Template Known Secondary structure									S		G	G	G	T	T	S							S				G	G	G											T															S	S		S	B	T	T	T	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270					.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.
Query Sequence		I	S	L	A	E	G	L	D	N	V	H	F	L	G	Y	L	D	K	E	K	I	D	H	C	.	.	.	.	Y	N	I	S	D	I	V	C	F	P	S	R	L	E	T	W	G	L	P	L	S	E	A	K	E	R	G	K	W	V	L	A	S	D	F	P	F	T	R	E	T	L	G	S	Y	E	K	K	A	F	F	D
Query Conservation																										.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	D	N	N	D	C	R	G	K	V	S	M	F	P	L	N	S	Q	Q	E	L	A	G	C	Y	A	Y	L	A	S	K	G	S	V	F	A	L	T	S	F	Y	E	P	F	G	L	A	P	V	E	A	M	A	S	G	L	P	A	V	V	T	R	N	G	G	P	A	E	I	L	D	G	G	K	Y	G	V	L	V	D
Template Known Secondary structure					T	T		B	T	T								S														T	T								S		B				S								T	T							S	S	B						T	G	G	G	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.							350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	N	N	D	D	M	L	V	K	L	I	I	D	F	K	K	G	N	L	K	K	D	I	S	D	A	N	.	.	.	.	.	.	F	I	Y	R	N	E	N	V	L	V	G	F	D	E	L	V	N	F	I	T	E	E
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	E	D	P	E	D	I	A	R	G	L	L	K	A	F	E	S	E	E	T	W	S	A	Y	Q	E	K	G	K	Q	R	V	E	E	R	Y	T	W	Q	E	T	A	R	G	Y	L	E	V	I	Q	E	I	A	D	R
Template Known Secondary structure		T	T														S																				S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.