Job Description P24171 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:46 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 528 % Identity 12% Template d2ajfa1 SCOP info Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain Neurolysin-like Resolution 2.90

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		55	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	N	N	T	I	L	A	L	E	Q	S	G	E	L	L	T	R	V	T	S	V	F	F	A	M	T	A	A	H	T	N	D	E	L	Q	R	L	D	E	Q	F	S	A	E	L	A	E	L	A	N	D	I	Y	L	N	G	E	L	F	A	R	V	D	A	V	W	Q	R	R	E	S	L	G	L	D	S	E	S	I	R
Query Conservation
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	T	F	L	D	K	F	N	H	E	A	E	D	L	F	Y	Q	S	S	L	A	S	W	N	Y	N	T	N	I	T	E	E	N	V	Q	N	M	N	N	A	G	D	K	W	S	A	F	L	K	E	Q	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	A	Q	M	Y	P	L	Q	E	I	Q	N	L	T	V	K	L
Template Known Secondary structure																														S																									.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.										.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	E	V	I	H	Q	R	F	V	L	A	G	A	K	L	A	Q	A	D	K	A	K	L	K	V	L	N	T	E	A	A	T	L	T	S	Q	F	N	Q	R	L	L	A	A	N	K	S	G	G	L	V	V	N	D	I	A	Q	L	A	G	M	S	E	Q	E	I	A	L	A	A	E	A	A	R	E	K	G	L	D
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	L	Q	A	L	.	.	.	Q	Q	N	G	S	S	V	L	S	E	D	K	S	K	R	L	N	T	I	L	N	T	M	S	T	I	Y	S	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	C	N	P	D
Template Known Secondary structure							.	.	.	T			G	G	G	G	S		T	T																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100				.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130																																					.	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		N	K	W	L	I	P	L	L	N	T	T	Q	Q	P	A	L	A	E	M	R	D	R	A	T	R	E	K	L	F	I	A	G	W	T	R	A	E	K	N	D	A	N	D	T	R	A	I	I	Q	R	L	V	E	I	R	A	Q	Q	A	T	L	L	G	F	P	H	Y	A	A	W	K	I	A	D	Q	M	A	K	T	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																									.	.	.	.																																					.
Template Conservation																																									.	.	.	.
Template Sequence		N	P	Q	E	C	L	L	L	E	P	G	L	N	E	I	M	A	N	S	L	D	Y	N	E	R	L	W	A	W	E	S	W	R	S	E	V	G	K	Q	.	.	.	.	L	R	P	L	Y	E	E	Y	V	V	L	K	N	E	M	A	R	A	N	H	Y	E	D	Y	G	D	Y	W	R	G	D	Y	E	V	N	G	V
Template Known Secondary structure			T	T					T	T	T	T																									T				.	.	.	.																			T	T		S	S							G	G	G		B		S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.					.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
								294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330		.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																						.																																		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																						.																																		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	P	E	A	A	L	N	F	M	R	E	I	V	P	A	A	R	Q	R	A	S	D	E	L	A	S	I	Q	A	V	I	D	K	Q	Q	G	G	F	.	S	A	Q	P	W	D	W	A	F	Y	A	E	Q	V	R	R	E	K	F	D	L	D	E	A	Q	L	K	P	Y	F	E	L	N	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																						.																																		.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																						.																																		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	Y	D	Y	S	R	G	Q	L	I	E	D	V	E	H	T	F	E	E	I	K	P	L	Y	E	H	L	H	A	Y	V	R	A	K	L	M	N	A	Y	P	S	Y	I	S	P	I	G	C	L	P	A	H	L	L	G	D	M	W	G	R	F	W	T	N	L	Y	S	L	T	V	P	F	G	Q	K	P	N	I	D
Template Known Secondary structure		T	T	S		B																																			S	T	T	S			T	T	B				G	G	G	S	S	S	S	S	S	S			G	G	G						T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
										364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	L	N	E	G	V	F	W	T	A	N	Q	L	F	G	I	K	F	V	E	R	F	D	I	P	V	Y	H	P	D	V	R	V	W	E	I	F	D	H	N	G	V	G	L	A	L	F	Y	G	D	F	F	A	R	D	S	K	S	G	G	A	W	M	G	N	F	V	E	Q	S	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	D	A	M	V	D	Q	A	W	D	A	Q	R	I	F	K	E	A	E	K	F	F	V	S	V	G	L	P	N	M	T	Q	G	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	S	M	L	T	D	P	G	N	V	Q	K	A	V	C	H	P	T	A	W	D	L	G
Template Known Secondary structure							G	G	G	T																T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	K	T	H	P	V	I	Y	N	V	C	N	Y	Q	K	P	A	A	G	E	P	A	L	L	L	W	D	D	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	T	L	H	G	L	F	A	R	Q	R	Y	A	T	L	S	G	T	N	T	P	R	D	F	V	E	F	P	S	Q	I	N	E	H	W	A	T	H	P	Q	V	F
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation			.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		K	.	.	.	.	G	D	F	R	I	L	M	C	T	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	D	D	F	L	T	A	H	H	E	M	G	H	I	Q	Y	D	M	A	Y	A	A	Q	P	F	L	L	R	N	G	A	N	E	.	G	F	H	E	A	V	G	E	I	M	S	L	S	A	A	T	P	K	H	L
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	T										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																					T	S	S		G	G	G		S		S	S	T	.	T														T	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
		353					.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.										.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.		.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590					.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.
Query Sequence		A	R	Y	A	R	H	Y	Q	S	G	A	A	M	P	D	E	L	Q	Q	K	M	R	N	A	S	L	F	N	K	G	Y	E	M	S	E	L	L	S	A	A	L	L	D	M	R	W	H	C	L	E	E	N	E	A	M	Q	D	V	D	D	F	E	L	R	A	L	V	A	E	N	M	D	L	P	A	.	.	.	.	I
Query Conservation																																																																													.	.	.	.
Alig confidence																									.																									.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																									.																									.	.	.
Template Sequence		K	S	I	G	L	L	S	P	D	F	Q	E	D	N	E	T	E	I	N	F	L	L	K	.	Q	A	L	T	I	V	G	T	L	P	F	T	Y	M	L	E	K	W	R	W	M	V	F	K	.	.	.	G	E	I	P	K	D	Q	W	M	K	K	W	W	E	M	K	R	E	I	V	G	V	V	E	P	V	P	H	D
Template Known Secondary structure				T	T	S	S		T	T															.					T	T	T																		.	.	.	T		S		G	G	G												T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure																									.																									.	.	.
Template SS confidence
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.		.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.				.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.												.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	P	R	Y	R	S	S	Y	F	A	H	I	F	G	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	A	Y	L	W	T	Q	M	L	A	D	D	G	Y	Q	W	F	V	E	Q	G	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	E	N	G	L	R	F	R	E	A	I	L	S	R	G	N	S	E	D	L	E	R	L	Y
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation															.	.	.																																																		.
Template Sequence		E	T	Y	C	D	P	A	S	L	F	H	V	S	.	.	.	N	D	Y	S	F	I	R	Y	Y	T	R	T	L	Y	Q	F	Q	F	Q	E	A	L	C	Q	A	A	K	H	E	G	P	L	H	K	C	D	I	S	N	S	T	E	A	G	Q	K	L	F	N	.	M	L	R	L	G	K	S	E	P	W	T	L	A	L
Template Known Secondary structure		T	T			G	G	G	G	S					.	.	.	T	T				T																				T	T			S		G	G	G				T	T											.			T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.																																																		.
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.				.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.		.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
		661	.	.	.	.		.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		R	Q	W	R	G	.	K	A	P	K	I	M	P	M	L	Q	H
Query Conservation							.
Alig confidence							.
Template Conservation
Template Sequence		E	N	V	V	G	A	K	N	M	N	V	R	P	L	L	N	Y
Template Known Secondary structure			T	T	S	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.