Job Description P24171 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:46 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 522 % Identity 15% Template d1j36a_ SCOP info Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain Neurolysin-like Resolution 2.40

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		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	N	T	I	L	A	L	E	Q	S	G	E	L	L	T	R	V	T	S	V	F	F	A	M	T	A	A	H	T	N	D	E	L	Q	R	L	D	E	Q	F	S	A	E	L	A	E	L	A	N	D	I	Y	L	N	G	E	L	F	A	R	V	D	A	V	W	Q	R	R	E	S	L	G	L	D	S	E	S	I	R	L
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	Y	L	E	N	L	N	K	E	L	A	K	R	T	N	V	E	T	E	A	A	W	A	Y	R	S	A	I	T	D	E	N	E	K	K	K	N	E	I	S	A	E	L	A	K	F	M	K	E	V	A	S	D	T	T	K	F	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	R	S	Y	Q	S	E	D	L	K	R	Q
Template Known Secondary structure																											T	T	S																									T	G	G	G	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.										.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	V	I	H	Q	R	F	V	L	A	G	A	K	L	A	Q	A	D	K	A	K	L	K	V	L	N	T	E	A	A	T	L	T	S	Q	F	N	Q	R	L	L	A	A	N	K	S	G	G	L	V	V	N	D	I	A	Q	L	A	G	M	S	E	Q	E	I	A	L	A	A	E	A	A	R	E	K	G	L	D	N
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	A	L	.	.	.	T	K	L	G	Y	A	A	L	P	E	D	D	Y	A	E	L	L	D	T	L	S	A	M	E	S	N	F	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	V	C	D	Y	K	D	S	T
Template Known Secondary structure						.	.	.				S	G	G	G	S																					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					B	T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		97	.	.	100				.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	W	L	I	P	L	L	N	T	T	Q	Q	P	A	L	A	E	M	R	D	R	A	T	R	E	K	L	F	I	A	G	W	T	R	A	E	K	N	D	A	N	D	T	R	A	I	I	Q	R	L	V	E	I	R	A	Q	Q	A	T	L	L	G	F	P	H	Y	A	A	W	K	I	A	D	Q	M	A	K	T	P	E
Query Conservation
Alig confidence									.																															.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation									.																															.	.	.	.																																.	.	.
Template Sequence		K	C	D	L	A	L	D	.	P	E	I	E	E	V	I	S	K	S	R	D	H	E	E	L	A	Y	Y	W	R	E	F	Y	D	K	A	G	T	A	.	.	.	.	V	R	S	Q	F	E	R	Y	V	E	L	N	T	K	A	A	K	L	N	N	F	T	S	G	A	E	A	W	L	D	E	.	.	.	Y	E	D	D
Template Known Secondary structure		T					T	T	.	T																											T	G	G	.	.	.	.	G																		T	T		S	S								T	.	.	.	T			T
Template Predicted Secondary structure									.																															.	.	.	.																																.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.					.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.				.	.	210	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.			.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	L	N	F	M	R	E	I	V	P	A	A	R	Q	R	A	S	D	E	L	A	S	I	Q	A	V	I	D	K	Q	Q	G	G	F	S	A	Q	P	W	D	W	.	.	A	F	Y	A	E	Q	V	R	R	E	K	F	D	L	D	E	A	Q	L	K	P	Y	F	E	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	F	E	Q	Q	L	E	D	I	F	A	D	I	R	P	L	Y	Q	Q	I	H	G	Y	V	R	F	R	L	R	K	H	Y	G	D	A	V	V	S	E	T	G	P	I	P	M	H	L	L	G	N	M	W	A	Q	Q	W	S	E	I	A	D	I	V	S	P	F	P	E	K	P	L	V	D	V	S	A	E	M	E	K
Template Known Secondary structure		T																	T	T	T														T	T	T	S		T	T	S				T	T	S	S	S	S	T	T		S			G	G	G						S		T	T	S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
			364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.					430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																																			.	.	.	.
Query SS confidence		.																																																																			.	.	.	.
Query Sequence		.	T	V	L	N	E	G	V	F	W	T	A	N	Q	L	F	G	I	K	F	V	E	R	F	D	I	P	V	Y	H	P	D	V	R	V	W	E	I	F	D	H	N	G	V	G	L	A	L	F	Y	G	D	F	F	A	R	D	S	K	S	G	G	A	W	M	G	N	.	.	.	.	F	V	E	Q	S	T	L	N	K
Query Conservation		.																																																																			.	.	.	.
Alig confidence		.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.								.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Sequence		Q	A	Y	T	P	L	K	M	F	Q	M	G	D	D	F	F	T	S	M	N	L	T	K	L	P	Q	D	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	I	I	E	K	P	T	D	G	R	D	L	V	C	H	A	S	A	W	D	F	Y	L	I	D	D	V	.	.
Template Known Secondary structure		T	T																T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		S			S	S	S						S							S	S	S	S			.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template SS confidence
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	H	P	V	I	Y	N	V	C	N	Y	Q	K	P	A	A	G	E	P	A	L	L	L	W	D	D	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	T	L	H	G	L	F	A	R	Q	R	Y	A	T	L	S	G	T	N	T	P	R	D	F	V	E	F	P	S	Q	I	N	E	H	W	A	T	H	P	Q	V	F	A	R	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	R	I	K	Q	C	T	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	D	Q	L	F	T	V	H	H	E	L	G	H	I	Q	Y	F	L	Q	Y	Q	H	Q	P	F	V	Y	R	T	G	A	N	P	.	G	F	H	E	A	V	G	D	V	L	S	L	S	V	S	T	P	K	H	L	E	K	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																					T	T	S		G	G	G		S		S			.																S							T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
							350	.	.	.	.	.	.	.										.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.		.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.					.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.
Query Sequence		A	R	H	Y	Q	S	G	A	A	M	P	D	E	L	Q	Q	K	M	R	N	A	S	L	F	N	K	G	Y	E	M	S	E	L	L	S	A	A	L	L	D	M	R	W	H	C	L	E	E	N	E	A	M	Q	D	V	D	D	F	E	L	R	A	L	V	A	E	N	M	D	L	.	.	.	.	P	A	I	P	P	R
Query Conservation																																																																								.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	L	K	D	Y	V	R	D	D	E	A	R	I	N	Q	L	F	L	T	A	L	D	K	I	V	F	L	P	F	A	.	.	.	.	.	F	T	M	D	K	Y	R	W	S	L	F	R	G	E	V	D	K	A	N	W	N	C	A	F	W	K	L	R	D	E	Y	S	G	I	E	P	P	V	V	R	S	E	K	D
Template Known Secondary structure		T	S	S	S	S					S	T	T	T									T	T	T	T	T						.	.	.	.	.												T	T	T	S		G	G	G																		S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.						.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	R	S	S	Y	F	A	H	I	F	G	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	A	Y	L	W	T	Q	M	L	A	D	D	G	Y	Q	W	F	V	E	Q	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	R	E	N	G	L	R	F	R	E	A	I	L	S	R	G	N	S	E	D	L	E
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation											.	.	.																																																									.
Template Sequence		F	D	A	P	A	K	Y	H	I	.	.	.	S	A	D	V	E	Y	L	R	Y	L	V	S	F	I	I	Q	F	Q	F	Y	K	S	A	C	I	K	A	G	Q	Y	D	P	D	N	V	E	L	P	L	D	N	C	D	I	Y	G	S	A	R	A	G	A	A	F	H	N	.	M	L	S	M	G	A	S	K	P	W	P
Template Known Secondary structure				G	G	G	S				.	.	.			T																								T	T	S			S	S		T	T	S		G	G	G				T	T											.			T	T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.																																																									.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.				.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.		.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
		658	.	660	.	.	.	.	.		.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		R	L	Y	R	Q	W	R	G	.	K	A	P	K	I	M	P	M	L	Q	H	R
Query Conservation										.
Alig confidence										.
Template Conservation
Template Sequence		D	A	L	E	A	F	N	G	E	R	I	M	S	G	K	A	I	A	E	Y	F
Template Known Secondary structure									S							T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.