Job Description P24171 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:46 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 539 % Identity 15% Template c2h1jA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:oligoendopeptidase f; PDBTitle: 3.1 a x-ray structure of putative oligoendopeptidase f: crystals grown2 by microfluidic seeding Resolution 3.10 Å

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		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	F	D	Q	I	A	N	H	H	Y	R	P	A	F	D	E	G	M	Q	Q	K	R	A	E	I	A	A	I	A	L	N	P	Q	M	P	D	F	N	N	T	I	L	A	L	E	Q	S	G	E	L	L	T	R	V	T	S	V	F	F	A	M	T	A	A	H	T	N	D	E	L	Q	R	L	D	E	Q	F	S	A	E
Query Conservation
Alig confidence											.	.
Template Conservation											.	.
Template Sequence		K	F	S	E	F	R	Y	E	R	.	.	P	D	I	A	Q	L	Q	A	S	F	Q	E	A	L	D	S	F	R	R	A	G	S	A	A	L	Q	H	E	A	X	K	R	I	N	E	L	R	R	R	Y	S	T	X	A	N	L	C	H	I	R	H	T	I	D	T	N	D	E	F	Y	K	K	E	Q	D	F	F	D	E
Template Known Secondary structure			G	G	G	S					.	.																					S	S																																	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10			.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	E	L	A	N	D	I	Y	L	N	G	E	L	F	A	R	V	D	A	V	W	Q	R	R	E	S	L	G	L	D	S	E	S	I	R	L	V	E	V	I	H	Q	R	F	V	L	A	G	A	K	L	A	Q	A	D	K	A	K	L	K	V	L	N	T	E	A	A	T	L	T	S	Q	F	N	Q	R	L	L	A
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.																													.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.																													.	.	.													.	.	.	.
Template Sequence		T	E	P	V	V	K	G	L	.	.	.	.	.	V	N	D	Y	Y	R	A	L	V	S	S	P	F	R	A	E	L	E	Q	V	W	G	K	Q	L	F	A	L	.	.	.	A	E	T	Q	L	K	T	Y	A	P	V	I	.	.	.	.	V	E	D	L	Q	K	E	N	K	L	A	S	E	Y	T	K	L	I	A	S
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.										T		T	T										S						.	.	.					G	G	G			G	G	G	.	.	.	.																				T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.																													.	.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.						.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.				.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	K	S	G	G	L	V	V	N	D	I	A	Q	L	A	G	M	S	E	Q	E	I	A	L	A	A	E	A	A	R	E	K	G	L	D	N	K	W	L	I	P	L	L	N	T	T	Q	Q	P	A	L	A	E	M	R	D	R	A	T	R	E	K	L	F	I	A	G	W	T	R	A	E	K	N	D	A	N	D	T
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.																										.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.																										.
Template Sequence		A	K	I	X	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	E	E	R	T	L	.	.	.	A	Q	L	Q	P	F	V	E	S	P	D	R	A	X	R	Q	R	A	S	E	A	R	F	S	F	.	F	K	D	Y	E	K	E	L
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					T	.	.	.	G	G	G					T		S	S															.				T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.																										.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.																																.	.	.	.	.	.	.				160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.		.	.	.	.	.	190	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.			.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.
Query SS confidence																																					.	.
Query Sequence		R	A	I	I	Q	R	L	V	E	I	R	A	Q	Q	A	T	L	L	G	F	P	H	Y	A	A	W	K	I	A	D	Q	M	A	K	T	.	.	P	E	A	A	L	N	F	M	R	E	I	V	P	A	A	R	Q	R	A	S	D	E	L	A	S	I	Q	A	V	I	D	K	Q	Q	G	G	F	S	A	Q	P	W	D
Query Conservation																																					.	.
Alig confidence																																					.	.																								.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.
Template Sequence		D	E	L	Y	D	E	L	V	H	V	R	T	A	I	A	R	K	L	G	F	Q	N	F	V	E	L	G	Y	A	R	L	G	R	T	D	Y	N	A	D	X	V	A	G	Y	R	R	Q	V	K	T	H	I	V	P	L	A	A	K	L	R	.	.	.	.	E	R	Q	R	Q	R	I	Q	V	E	K	L	Y	Y	Y	D
Template Known Secondary structure																			T	T		S	S									T	T			S																										.	.	.	.							T	T		S	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.					.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	A	F	Y	A	E	Q	V	R	R	E	K	F	D	L	D	E	A	Q	L	K	P	Y	F	E	L	N	T	V	L	N	E	G	V	F	W	T	A	N	Q	L	F	G	I	K	F	V	E	R	F	D	I	P	V	Y	H	P	D	V	R	V	W	E	I	F	D	H	N	G	V	G	L	A	L	F	Y	G	D	F	F
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	X	F	P	T	G	N	P	T	P	K	G	D	A	D	W	I	V	.	Q	N	G	R	Q	X	Y	E	E	L	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	G	E	F	F	R	Y	X	V	E	H	E	L	X	D	L	V
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				T	T						S	S							.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		269											270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	D	S	K	S	G	G	A	W	M	G	N	F	V	E	Q	S	T	L	N	K	T	H	P	V	I	Y	N	V	C	N	Y	Q	K	P	A	A	G	E	P	A	L	L	L	W	D	D	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	T	L	H	G	L	F	A	R	Q	R	Y	A	T	L	S	G	T	N	T	P	R	D
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		A	K	K	G	K	A	G	G	G	Y	C	T	Y	I	D	D	Y	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	F	I	F	S	N	F	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	D	I	D	V	L	T	H	E	A	G	H	A	F	Q	V	Y	E	S	R	.	H	Y	D	I	P	E	Y	N	W	P	T	L	E
Template Known Secondary structure				T	T			S	S							G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T																			T	T	.	T		S	S	G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.								.	340	.	.	.	.	.	.										.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	E	F	P	S	Q	I	N	E	H	W	A	T	H	P	Q	V	F	A	R	Y	A	R	H	Y	Q	S	G	A	A	M	P	D	E	L	Q	Q	K	M	R	N	A	S	L	F	N	K	G	Y	E	M	S	E	L	L	S	A	A	L	L	D	M	R	W	H	C	L	E	E	N	E	A	M	Q	D	V	D	D	F
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		A	C	E	I	H	S	X	S	X	E	F	F	T	W	P	.	.	.	.	.	.	.	W	X	E	L	F	F	G	E	D	A	D	K	Y	R	F	A	H	L	S	D	A	L	L	.	.	.	.	.	F	L	P	Y	G	V	A	V	D	E	F	Q	H	A	V	Y	E	N	P	D	X	T	.	.	P	A	E	R	K	S
Template Known Secondary structure														T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	G	G					G	G	G															.	.	.	.	.																		S	T	T			.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.								.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.						420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.			.	.	.	.	.	.
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.							.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	R	A	L	V	A	E	N	M	D	L	P	A	I	P	P	R	.	.	.	.	.	.	Y	R	S	S	Y	F	A	H	I	F	G	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	A	Y	L	W	T	Q	M	L	A	D	D	G	Y	Q	W	F	V	E	Q	G	G	L	T	R	E	N	G	L	R	F	R	E	A	I	L	S	R
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.											.	.																												.	.	.										.
Template Conservation																																				.	.																												.	.	.										.
Template Sequence		V	W	R	N	I	E	K	A	Y	L	P	T	R	D	Y	A	D	H	D	Y	L	E	R	G	G	F	W	Q	R	Q	G	H	I	Y	.	.	T	D	P	F	Y	Y	I	D	Y	T	L	A	Q	V	C	A	F	Q	F	W	K	R	A	Q	E	D	R	.	.	.	A	S	A	W	R	D	Y	V	A	.	L	C	R	L
Template Known Secondary structure											S	T	T				T	T						T	T		G	G	G	G						.	.		S	T	T	T	T																						.	.	.										.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.																												.	.	.										.
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.			.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.				.	510	.	.	.	.	.	.	.		.	.	520	.
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	S	E	D	L	E	R	L	Y	R	Q	W	R	G	K	A	P	K	I	M	P	M	L	Q	H	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	G	S	R	P	F	T	E	L	V	K	S	A	N	L	Q	S	P	F	A	D	G	A	V	A	S	V
Template Known Secondary structure		T	T	S	S									T	T				T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.