Job Description P24171 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:46 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 463 % Identity 16% Template c1wgzC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:carboxypeptidase 1; PDBTitle: crystal structure of carboxypeptidase 1 from thermus thermophilus Resolution 2.60 Å

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		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80				.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure																													.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.
Query Sequence		D	F	N	N	T	I	L	A	L	E	Q	S	G	E	L	L	T	R	V	T	S	V	F	F	A	M	T	.	.	.	A	A	H	T	N	D	E	L	Q	R	L	D	E	Q	F	S	A	E	L	A	E	L	A	N	D	I	Y	L	N	G	E	L	F	A	R	V	D	A	V	W	Q	R	R	E	S	L	G	L	D	S
Query Conservation																													.	.	.
Alig confidence																													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	E	A	A	Y	Q	N	L	L	E	F	Q	R	E	T	A	Y	L	A	S	L	G	A	L	A	A	W	D	Q	R	T	M	I	P	K	K	G	H	E	H	R	A	R	Q	M	A	A	L	A	R	L	L	H	Q	R	M	T	D	P	R	I	G	E	W	L	E	K	V	E	G	S	P	L	V	Q	D	P	L	S
Template Known Secondary structure																																T	T	T			T	T																					T												T	T	S	G	G	G	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	I	R	L	V	E	V	I	H	Q	R	F	V	L	A	G	A	K	L	A	Q	A	D	K	A	K	L	K	V	L	N	T	E	A	A	T	L	T	S	Q	F	N	Q	R	L	L	A	A	N	K	S	G	G	L	V	V	N	D	I	A	Q	L	A	G	M	S	E	Q	E	I	A	L	A	A	E	A	A	R	E
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	A	V	N	V	R	E	W	R	Q	A	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	R	A	I	P	E	R	L	A	V	E	L	A	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S										.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.											280
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	L	D	N	K	W	L	I	P	L	L	N	T	T	Q	Q	P	A	L	A	E	M	R	D	R	A	T	R	E	K	L	F	I	A	G	W	T	R	A	E	K	N	D	A	N	D	T	R	A	I	I	Q	R	L	V	E	I	R	A	Q	Q	A	T	L	L	G	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	E	S	E	A	E	S	F	W	E	E	A	R	P	R	D	D	W	R	G	F	L	P	Y	L	K	R	V	Y	A	L	T	K	E	K	A	E	V	L	F	A	L	P	P	A	P	G	D	P	P	Y	G	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	T	T																									T	S			S	T	T	S					S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																												110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.		.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		Y	A	A	W	K	I	A	D	Q	M	A	K	.	T	P	E	A	A	L	N	F	M	R	E	I	V	P	A	A	R	Q	R	A	S	D	E	L	A	S	I	Q	A	V	I	D	K	Q	Q	G	G	F	S	A	Q	P	W	D	W	A	F	Y	A	E	Q	V	R	R	E	K	F	D	L	D	E	A	Q	L	K	P	Y
Query Conservation														.
Alig confidence														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	D	A	L	L	D	G	Y	E	P	G	M	R	A	R	E	L	L	P	L	F	A	E	L	K	E	G	L	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	D	R	I	L	G	S	G	K	R	P	D	T	S	I	L	H	R	P
Template Known Secondary structure											S	T	T																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T						G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	E	L	N	T	V	L	N	E	G	V	F	W	T	A	N	Q	L	F	G	I	K	F	V	E	R	F	D	I	P	V	Y	H	P	D	V	R	V	W	E	I	F	D	H	N	G	V	G	L	A	L	F	Y	G	D	F	F	A	R	D	S	K	S	G	G	A	W	M	G	N	F	V	E	Q	S	T	L	N	K	T
Query Conservation
Alig confidence									.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.										.					.	.
Template Conservation									.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.										.					.	.
Template Sequence		Y	P	V	E	A	Q	R	.	R	F	A	L	E	L	L	S	A	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	D	L	E	A	G	R	L	D	P	T	A	.	.	.	.	.	.	H	P	F	E	I	A	I	G	P	.	G	D	V	R	.	.
Template Known Secondary structure									.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			G	G	G							S	.	.	.	.	.	.	S								T	.	T				.	.
Template Predicted Secondary structure									.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.										.					.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.							.	.	.	.	.	250	.	.	.		.	.	.	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.			.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.		.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.		.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.																											.																						.
Query SS confidence																								.	.																											.																						.
Query Sequence		H	P	V	I	Y	N	V	C	N	Y	Q	K	P	A	A	G	E	P	A	L	L	L	.	.	W	D	D	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	T	L	H	G	L	F	A	R	Q	R	Y	A	T	.	L	S	G	T	N	T	P	R	D	F	V	E	F	P	S	Q	I	N	E	H	W	.	A	T	H	P	Q	V	F
Query Conservation																								.	.																											.																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.		.	.																											.																						.
Template Conservation		.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	I	T	T	R	Y	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	F	N	A	G	I	F	G	T	L	H	E	M	G	H	A	L	Y	E	Q	G	L	P	K	E	H	W	G	T	P	R	G	D	A	V	S	L	G	V	H	E	S	Q	S	R	T	W	E	N	L	V	G	R	S	L	G	F	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																						S		G	G	G	T	T	S	G	G	G	S		S														T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							258	.	260	.	.	.	.										.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		516	.	.	.	520	.	.	.		.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.										.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	Y	A	R	H	Y	Q	.	S	G	A	A	M	P	D	E	L	Q	Q	K	M	R	N	A	S	L	F	N	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	M	S	E	L	L	S	A	A	L	L	D	M	R	W	H	C	L	E	E	N	E	A	M	Q	D	V	D	D	F	E	L	R	A	L	V	A	E	N
Query Conservation										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.										.							.
Template Conservation																																																			.							.
Template Sequence		E	R	F	F	P	R	A	R	E	V	F	A	S	L	G	D	V	S	L	E	D	F	H	F	A	V	N	A	V	E	P	S	L	I	R	V	E	A	D	E	V	T	Y	N	L	H	I	L	V	.	R	L	E	L	E	L	.	A	L	F	R	G	E	L	S	P	E	D	L	P	E	A	W	A	E	K	Y	R	D	H
Template Known Secondary structure													G	G	G	T	T										T	T						S		T	T	T			T	T	T								.							.				T	T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																			.							.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.										.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	D	L	P	A	I	P	P	R	Y	R	S	S	Y	F	A	H	I	F	G	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	A	Y	L	W	T	Q	M	L	A	D	D	G	Y	Q	W	F	V	E	Q	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	R	E	N	G	L	R	F	R	E	A	I	L	S	R	G	N	S	E	D	L
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.
Template Sequence		L	G	V	A	P	K	D	Y	K	D	G	V	M	Q	D	V	H	W	A	G	.	G	L	F	G	Y	F	P	T	Y	T	L	G	N	L	Y	A	A	Q	F	F	Q	K	A	E	A	E	L	G	P	L	E	P	R	F	A	R	G	E	F	Q	P	F	L	D	W	T	R	A	R	I	H	A	E	G	S	R	F	R	P
Template Known Secondary structure			S				S	S	S	T	T	T	G	G	G		S	G	G	G	G	.	T			S		T																														T	T													T	G	G	G	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		657	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	R	L	Y	R	Q	W	R	G	K	A	P	K	I	M	P	M	L	Q	H	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	V	L	V	E	R	V	T	G	E	A	P	S	A	R	P	F	L	A	Y	L
Template Known Secondary structure										S	S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.