Job Description P24177 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:44 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 675 % Identity 16% Template c3aqpB_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: B: PDB Molecule:probable secdf protein-export membrane protein; PDBTitle: crystal structure of secdf, a translocon-associated membrane protein,2 from thermus thrmophilus Resolution 3.30 Å

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		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	Q	A	S	V	T	L	S	F	K	A	G	T	D	P	D	E	A	V	Q	Q	V	Q	N	Q	L	Q	S	A	M	R	K	L	P	Q	A	V	Q	N	Q	G	V	T	V	R	K	T	G	D	T	N	I	L	T	I	A	F	V	S	T	D	G	S	M	D	K	Q	D	I	A	D	Y	V	A	S	N	I	Q	D
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.																									.	.	.	.
Template Sequence		K	G	G	L	R	I	V	L	E	A	D	V	E	N	P	T	L	D	D	L	E	K	A	R	T	V	L	E	N	R	I	N	.	.	A	L	G	V	A	E	P	L	I	Q	I	Q	G	Q	K	R	I	V	V	E	L	P	G	L	.	.	.	.	S	Q	A	D	Q	D	R	A	L	K	L	I	G	Q	R	A	V	L
Template Known Secondary structure		T											S	S	S																			.	.					S	S							T	T	T										.	.	.	.														S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.																									.	.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.			.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.					.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		165	.	.	.	.			170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure							.	.												.
Query SS confidence							.	.												.
Query Sequence		P	L	S	R	V	.	.	N	G	V	G	D	I	D	A	Y	G	S	.	Q	Y	S	M	R	I	W	L	D	P	A	K	L	N	S	F	Q	M	T	A	K	D	V	T	D	A	I	E	S	Q	N	A	Q	I	A	V	G	Q	L	G	G	T	P	S	V	D	K	Q	A	L	N	A	T	I	N	A	Q	S	L	L	Q
Query Conservation							.	.												.
Alig confidence							.	.												.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	R	I	V	K	E	G	A	T	G	T	T	V	A	Q	I	N	Q	A	L	R	E	N	P	R	L	N	R	E	E	L	E	K	D	L	I	K	P	E	D	L	G	P	P	L	L	T	G	A	D	L	A	D	A	R	.	.	.	.	.	.	A	V	F	D	Q	F	G	R	P	Q	V	S	L	T	F	T	P	E
Template Known Secondary structure										T	T		B												S	S											B				S	S					S			S								.	.	.	.	.	.					T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.							170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	E	Q	F	R	D	I	T	L	R	V	N	Q	D	G	S	E	V	R	L	G	D	V	A	T	V	E	M	G	A	E	K	Y	D	Y	L	S	R	F	N	G	K	P	A	S	G	L	G	V	K	L	A	S	G	A	N	E	M	A	T	A	E	L	V	L	N	R	L	D	E	L	A	Q	Y	F	P	H	G	L
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Sequence		G	A	K	K	F	E	E	V	T	R	Q	N	I	G	K	.	.	.	.	R	L	A	I	V	L	D	G	R	V	Y	T	A	P	V	I	R	Q	A	I	T	G	G	Q	A	V	I	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	S	S	V	E	E	A	S	E	I	A	L	V	L	R	S	.	.	G	S	L	P	V	P	L
Template Known Secondary structure													T	T	T	S	.	.	.	.							T	T									S	S				S	S					.	.	.	.	.	.	.						S	S												.	.			S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.					.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.								230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.			.	.	250	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		E	Y	K	V	A	Y	E	T	T	S	F	V	.	K	A	S	I	E	D	V	V	K	T	L	L	E	A	I	A	L	V	F	L	V	M	Y	L	F	L	Q	N	F	R	A	T	L	I	P	T	I	A	V	P	V	V	L	M	G	T	F	S	V	L	Y	A	F	G	Y	S	V	N	T	L	T	M	F	A	M	V	L
Query Conservation														.
Alig confidence														.																												.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		K	V	A	E	I	R	A	I	G	P	T	L	G	Q	D	A	I	Q	A	G	I	R	S	A	L	I	G	T	L	A	I	F	L	L	I	F	A	Y	Y	G	.	P	H	L	G	L	V	A	S	L	G	L	L	Y	T	S	A	L	I	L	G	L	L	S	G	L	G	A	T	L	T	L	P	G	I	A	G	L	V	L
Template Known Secondary structure																																									T	.
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	G	L	L	V	D	D	A	I	V	V	V	E	N	V	E	R	I	M	S	E	E	G	L	T	P	R	E	A	T	R	K	S	M	G	Q	I	Q	G	A	L	V	G	I	A	M	V	L	S	A	V	F	V	P	M	A	F	F	G	G	T	T	G	A	I	Y	R	Q	F	S	I	T	I	V	A	A	M	V	L
Query Conservation
Alig confidence																						.																																											.	.	.
Template Conservation																						.																																											.	.	.
Template Sequence		T	L	G	A	A	V	D	G	N	V	L	S	F	E	R	I	K	E	E	L	.	R	A	G	K	K	L	R	Q	A	I	P	E	G	F	R	H	S	T	L	T	I	M	D	V	N	I	A	H	L	L	A	A	A	A	L	Y	Q	Y	A	T	G	P	.	.	.	V	R	G	F	A	V	I	L	A	I	G	V	V	A
Template Known Secondary structure																						.		T	T																																			T			T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.																																											.	.	.
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.		.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	L	V	A	M	I	L	T	P	A	L	C	A	T	L	L	K	P	L	K	K	G	E	H	H	G	Q	K	G	F	F	A	W	F	N	Q	M	F	N	R	N	A	E	R	Y	E	K	G	V	A	K	I	L	H	R	S	L	R	W	I	V	I	Y	V	L	L	L	G	G	M	V	F	L	F	L	R	L	P	T
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	V	F	S	N	L	V	F	S	R	H	L	L	E	R	L	A	D	R	G	E	I	R	P	P	M	W	L	V	D	P	R	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	M	G	P	A	R	Y	V	T	A	A	T	L	L	L	A	A	L	A	A	G	V	V	F	A	K	G	F
Template Known Secondary structure																					T														S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T																							T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	F	L	P	L	E	D	R	G	M	F	T	T	S	V	Q	L	P	S	G	S	T	Q	Q	Q	T	L	K	V	V	E	Q	I	E	K	Y	Y	F	T	H	E	K	D	N	I	M	S	V	F	A	T	V	G	S	G	P	G	G	N	G	Q	N	V	A	R	M	F	I	R	L	K	D	W	S	E	R	D	S	K	T
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Y	S	I	D	F	T	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	S	F	A	I	I	E	R	A	T	K	A	F	N	Q	I	K	E	A	R	V	I	A	S	S	P	P	A	I	S	G	L	G	S	S	A	G	F	D	M	E	L	Q	D	H	A	G	A	G	H	D	A	L	M	A	A	R	N	Q	L	L	A	L	A	A	E	N	P	E	L	T	R	V	R	H	N	G	L	D
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		721	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	S	P	Q	L	Q	I	D	I	D	Q	R	K	A	Q	A	L	G	V	A	I	D	D	I	N	D	T	L	Q	T	A	W	G	S	S	Y	V	N	D	F	M	D	R	G	R	V	K	K	V	Y	V	Q	A	A	A	P	Y	R	M	L	P	D	D	I	N	L	W	Y	V	R	N	K	D	G	G	M	V	P	F	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.										.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.										.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	A	Y	T	L	R	A	E	P	N	.	.	.	.	.	.	V	E	V	E	T	L	R	R	F	L	E	E	K	G	F	P	G	K	E	A	V	I	T	Q	V	Y	R	E	F	L	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.								T	T	.	.	.	.	.	.												T	T	T	S		S	S	S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.										.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					482	.	.	.	.	.	.	.	490							.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
		801	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	A	T	S	R	W	E	T	G	S	P	R	L	E	R	Y	N	G	Y	S	A	V	E	I	V	G	E	A	A	P	G	V	S	T	G	T	A	M	D	I	M	E	S	L	V	K	Q	L	P	N	G	F	G	L	E	W	T	A	M	S	Y	Q	E	R	L	S	G	A	Q	A	P	A	L	Y	A	I	S	L	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	P	L	S	D	E	R	R	L	E	L	E	R	L	F	A	S	E	L	K	A	T	V	L	A	S	E	T	V	G	P	A	I	G	E	E	L	R	R	N	A	V	M	A	V	L	V	G	L	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S																		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		881	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.			.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Query SS confidence																																																																												.	.
Query Sequence		V	V	F	L	C	L	A	A	L	Y	E	S	W	S	V	P	F	S	V	M	L	V	V	P	L	G	V	I	G	A	L	L	A	T	W	M	R	G	L	E	N	D	V	Y	F	Q	V	G	L	L	T	V	I	G	L	S	A	K	N	A	I	L	I	V	E	F	A	N	E	M	N	Q	K	G	.	.	H	D	L	F
Query Conservation																																																																												.	.
Alig confidence												.																																																																.	.
Template Conservation												.
Template Sequence		L	I	L	L	Y	V	A	F	R	F	.	D	W	T	F	G	V	A	S	I	L	A	V	A	H	D	V	A	I	V	A	G	M	Y	S	L	L	G	L	E	F	S	I	P	T	I	A	A	L	L	T	I	V	G	Y	S	I	N	D	S	I	V	V	S	D	R	I	R	E	N	Q	K	L	L	R	H	L	P	Y	A
Template Known Secondary structure											S	.																											T																																					S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
		959	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	T	L	H	A	C	R	Q	R	L	R	P	I	L	M	T	S	L	A	F	I	F	G	V	L	P	M	A	T	S	T	G	A	G	S	G	G	Q	H	A	V	G	T	G	V	M	G	G	M	I	S	A	T	I	L	A	I	Y	F	V	P	L	F	F	V	L	V	R	R	R
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.
Template Sequence		E	L	V	N	R	S	I	N	Q	T	L	S	R	T	V	M	T	S	L	T	T	L	L	P	I	L	A	L	L	F	L	.	.	.	G	G	S	V	L	R	D	F	A	L	A	I	F	V	G	I	F	V	G	T	Y	S	S	I	Y	V	V	S	A	L	V	V	A	W	K	N	R
Template Known Secondary structure																																	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.
Template SS confidence
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.				690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.