Job Description P27298 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 528 % Identity 14% Template d2ajfa1 SCOP info Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain Neurolysin-like Resolution 2.90

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		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	E	N	L	C	Q	P	L	A	E	V	D	D	V	L	G	R	I	F	S	P	V	S	H	L	N	S	V	K	N	S	P	E	L	R	E	A	Y	E	Q	T	L	P	L	L	S	E	Y	S	T	W	V	G	Q	H	E	G	L	Y	K	A	Y	R	D	L	R	D	G	D	H	Y	A	T	L	N	T	A	Q	K	K
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	T	F	L	D	K	F	N	H	E	A	E	D	L	F	Y	Q	S	S	L	A	S	W	N	Y	N	T	N	I	T	E	E	N	V	Q	N	M	N	N	A	G	D	K	W	S	A	F	L	K	E	Q	S	T	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	Y	P	L	Q	E	I	Q	N	L	T	V	K	L
Template Known Secondary structure																														S																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80										.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	D	N	A	L	R	D	F	E	L	S	G	I	G	L	P	K	E	K	Q	Q	R	Y	G	E	I	A	T	R	L	S	E	L	G	N	Q	Y	S	N	N	V	L	D	A	T	M	G	W	T	K	L	V	T	D	E	A	E	L	A	G	M	P	E	S	A	L	A	A	A	K	A	Q	A	E	A	K	E	L	E
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	L	Q	A	L	Q	Q	.	.	.	N	G	S	S	V	L	S	E	D	K	S	K	R	L	N	T	I	L	N	T	M	S	T	I	Y	S	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	C	N	P	D	N
Template Known Secondary structure							T		.	.	.		G	G	G	G	S		T	T																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.				.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130																																				.	.	.	.	.	.	.
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Y	L	L	T	L	D	I	P	S	Y	L	P	V	M	T	Y	C	D	N	Q	A	L	R	E	E	M	Y	R	A	Y	S	T	R	A	S	D	Q	G	P	N	A	G	K	W	D	N	S	K	V	M	E	E	I	L	A	L	R	H	E	L	A	Q	L	L	G	F	E	N	Y	A	F	K	S	L	A	T	K	M	A
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	E	C	L	L	L	E	P	G	L	N	E	I	M	A	N	S	L	D	Y	N	E	R	L	W	A	W	E	S	W	R	S	E	V	G	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	P	L	Y	E	E	Y	V	V	L	K	N	E	M	A	R	A	N	H	Y	E	D	Y	G	D	Y	W	R	G	D	Y	E	V
Template Known Secondary structure		T	T					T	T	T	T																									T				.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T		S	S							G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.									.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		289	290								.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.																																						.
Query Sequence		E	N	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	Q	V	L	D	F	L	T	D	L	A	K	R	A	R	P	Q	G	E	K	E	L	A	Q	L	R	A	F	A	K	A	E	F	G	V	D	.	E	L	Q	P	W	D	I	A	Y	Y	S	E	K	Q	K	Q	H	L	Y	S	I	S	D	E	Q	L	R	P	Y	F	P	E	N
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.																																						.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	V	D	G	Y	D	Y	S	R	G	Q	L	I	E	D	V	E	H	T	F	E	E	I	K	P	L	Y	E	H	L	H	A	Y	V	R	A	K	L	M	N	A	Y	P	S	Y	I	S	P	I	G	C	L	P	A	H	L	L	G	D	M	W	G	R	F	W	T	N	L	Y	S	L	T	V	P	F	G	Q	K	P
Template Known Secondary structure			S	S	T	T	S		B																																			S	T	T	S			T	T	B				G	G	G	S	S	S	S	S	S	S			G	G	G						T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		361													.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	N	G	L	F	E	V	V	K	R	I	Y	G	I	T	A	K	E	R	K	D	V	D	V	W	H	P	D	V	R	F	F	E	L	Y	D	E	N	N	E	L	R	G	S	F	Y	L	D	L	Y	A	R	E	N	K	R	G	G	A	W	M	D	D	C	V	G
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	D	V	T	D	A	M	V	D	Q	A	W	D	A	Q	R	I	F	K	E	A	E	K	F	F	V	S	V	G	L	P	N	M	T	Q	G	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	S	M	L	T	D	P	G	N	V	Q	K	A	V	C	H	P	T	A	W
Template Known Secondary structure										G	G	G	T																T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	M	R	K	A	D	G	S	L	Q	K	P	V	A	Y	L	T	C	N	F	N	R	P	V	N	G	K	P	A	L	F	T	H	D	E	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	G	L	H	H	M	L	T	R	I	E	T	A	G	V	S	G	I	S	G	V	P	W	D	A	V	E	L	P	S	Q	F	M	E	N	W
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template Sequence		D	L	G	K	.	.	.	.	.	.	.	G	D	F	R	I	L	M	C	T	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	D	D	F	L	T	A	H	H	E	M	G	H	I	Q	Y	D	M	A	Y	A	A	Q	P	F	L	L	R	N	.	.	G	A	N	E	G	F	H	E	A	V	G	E	I	M	S	L	S
Template Known Secondary structure					T	.	.	.	.	.	.	.	T										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																					T	S	S		G	G	G		S	.	.		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.								.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.										.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.			.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	W	E	P	E	A	L	A	F	I	S	G	H	Y	E	T	G	E	P	L	P	K	E	L	L	D	K	M	L	A	A	K	N	Y	Q	A	A	L	F	I	L	R	Q	L	E	F	G	L	F	D	F	R	L	H	A	E	F	R	P	D	Q	G	A	K	I	L	E	T	L	A	E	I	K	K	L	V	A	V	V	P
Query Conservation
Alig confidence																																.																								.	.
Template Conservation																																.																								.	.
Template Sequence		A	A	T	P	K	H	L	K	S	I	G	L	L	S	P	D	F	Q	E	D	N	E	T	E	I	N	F	L	L	K	.	Q	A	L	T	I	V	G	T	L	P	F	T	Y	M	L	E	K	W	R	W	M	V	F	.	.	K	G	E	I	P	K	D	Q	W	M	K	K	W	W	E	M	K	R	E	I	V	G	V	V
Template Known Secondary structure			T	S							T	T	S	S		T	T															.					T	T	T																	.	.		T		S		G	G	G												T	T
Template Predicted Secondary structure																																.																								.	.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.		.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.			.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
		589	590					.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.												.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	P	.	.	.	.	S	W	G	R	F	P	H	A	F	S	H	I	F	A	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	S	Y	L	W	A	D	V	L	A	A	D	A	F	S	R	F	E	E	E	G	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	E	T	G	Q	S	F	L	D	N	I	L	S	R	G	G	S	E
Query Conservation				.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																		.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation																									.	.	.																																														.
Template Sequence		E	P	V	P	H	D	E	T	Y	C	D	P	A	S	L	F	H	V	S	N	D	Y	S	.	.	.	F	I	R	Y	Y	T	R	T	L	Y	Q	F	Q	F	Q	E	A	L	C	Q	A	A	K	H	E	G	P	L	H	K	C	D	I	S	N	S	T	E	A	G	Q	K	L	F	N	.	M	L	R	L	G	K	S	E
Template Known Secondary structure			S	S				T	T			G	G	G	G	S					T	T			.	.	.		T																				T	T			S		G	G	G				T	T											.			T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.																																														.
Template SS confidence
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.				.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.		.	.	.	560	.	.	.	.
		654	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.		.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.
Query SS confidence													.
Query Sequence		E	P	M	D	L	F	K	R	F	R	G	.	R	E	P	Q	L	D	A	M	L	E	H	Y
Query Conservation													.
Alig confidence													.
Template Conservation
Template Sequence		P	W	T	L	A	L	E	N	V	V	G	A	K	N	M	N	V	R	P	L	L	N	Y	F
Template Known Secondary structure									T	T	S	S		S	S			S							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		565	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.