Job Description P27298 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 524 % Identity 17% Template d1j36a_ SCOP info Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain Neurolysin-like Resolution 2.40

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		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	W	E	N	L	C	Q	P	L	A	E	V	D	D	V	L	G	R	I	F	S	P	V	S	H	L	N	S	V	K	N	S	P	E	L	R	E	A	Y	E	Q	T	L	P	L	L	S	E	Y	S	T	W	V	G	Q	H	E	G	L	Y	K	A	Y	R	D	L	R	D	G	D	H	Y	A	T	L	N	T	A	Q	K
Query Conservation
Alig confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	K	E	Y	L	E	N	L	N	K	E	L	A	K	R	T	N	V	E	T	E	A	A	W	A	Y	R	S	A	I	T	D	E	N	E	K	K	K	N	E	I	S	A	E	L	A	K	F	M	K	E	V	A	S	D	T	T	K	F	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	R	S	Y	Q	S	E	D	L	K
Template Known Secondary structure																													T	T	S																									T	G	G	G	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.										.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	V	D	N	A	L	R	D	F	E	L	S	G	I	G	L	P	K	E	K	Q	Q	R	Y	G	E	I	A	T	R	L	S	E	L	G	N	Q	Y	S	N	N	V	L	D	A	T	M	G	W	T	K	L	V	T	D	E	A	E	L	A	G	M	P	E	S	A	L	A	A	A	K	A	Q	A	E	A	K	E	L
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Q	F	K	A	L	.	.	.	.	.	.	T	K	L	G	Y	A	A	L	P	E	D	D	Y	A	E	L	L	D	T	L	S	A	M	E	S	N	F	A	K	V	K	V	C	D	Y	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.				S	G	G	G	S																					T					B	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100							.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.																															.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	Y	L	L	T	L	D	I	P	S	Y	L	P	V	M	T	Y	C	D	N	Q	A	L	R	E	E	M	Y	R	A	Y	S	T	R	A	S	D	Q	G	P	N	A	G	K	W	D	N	S	K	V	M	E	E	I	L	A	L	R	H	E	L	A	Q	L	L	G	F	E	N	Y	A	F	K	S	L	A	T	K	M
Query Conservation
Alig confidence										.																															.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation										.																															.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Sequence		T	K	C	D	L	A	L	D	.	P	E	I	E	E	V	I	S	K	S	R	D	H	E	E	L	A	Y	Y	W	R	E	F	Y	D	K	A	G	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	S	Q	F	E	R	Y	V	E	L	N	T	K	A	A	K	L	N	N	F	T	S	G	A	E	A	W	L	D	E	.	.
Template Known Secondary structure		T	T					T	T	.	T																											T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G																		T	T		S	S								T	.	.
Template Predicted Secondary structure										.																															.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.									.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.			.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.																													.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.																													.	.	.
Query Sequence		A	E	N	P	Q	Q	V	L	D	F	L	T	D	L	A	K	R	A	R	P	Q	G	E	K	E	L	A	Q	L	R	A	F	A	K	A	E	F	G	V	D	E	L	Q	P	W	D	I	.	.	A	Y	Y	S	E	K	Q	K	Q	H	L	Y	S	I	S	D	E	Q	L	R	P	Y	F	P	E	N	K	A	.	.	.
Query Conservation																																																	.	.																													.	.	.
Alig confidence		.																																															.	.																													.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	Y	E	D	D	T	F	E	Q	Q	L	E	D	I	F	A	D	I	R	P	L	Y	Q	Q	I	H	G	Y	V	R	F	R	L	R	K	H	Y	G	D	A	V	V	S	E	T	G	P	I	P	M	H	L	L	G	N	M	W	A	Q	Q	W	S	E	I	A	D	I	V	S	P	F	P	E	K	P	L	V	D	V	S
Template Known Secondary structure		.	T			T	T																	T	T	T														T	T	T	S		T	T	S				T	T	S	S	S	S	T	T		S			G	G	G						S		T	T	S					T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
											363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	G	L	F	E	V	V	K	R	I	Y	G	I	T	A	K	E	R	K	D	V	D	V	W	H	P	D	V	R	F	F	E	L	Y	D	E	N	N	E	L	R	G	S	F	Y	L	D	L	Y	A	R	E	N	K	R	G	G	A	W	M	D	D	C	V	G	Q	M	R	K	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	M	E	K	Q	A	Y	T	P	L	K	M	F	Q	M	G	D	D	F	F	T	S	M	N	L	T	K	L	P	Q	D	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	I	I	E	K	P	T	D	G	R	D	L	V	C	H	A	S	A	W	D	F	Y	L	I
Template Known Secondary structure							T	T																T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		S			S	S	S						S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	S	L	Q	K	P	V	A	Y	L	T	C	N	F	N	R	P	V	N	G	K	P	A	L	F	T	H	D	E	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	G	L	H	H	M	L	T	R	I	E	T	A	G	V	S	G	I	S	G	V	P	W	D	A	V	E	L	P	S	Q	F	M	E	N	W	C	W	E	P	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	D	V	R	I	K	Q	C	T	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	D	Q	L	F	T	V	H	H	E	L	G	H	I	Q	Y	F	L	Q	Y	Q	H	Q	P	F	V	Y	R	.	.	T	G	A	N	P	G	F	H	E	A	V	G	D	V	L	S	L	S	V	S	T	P	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																					T	T	S		G	G	G		.	.	S		S																		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template SS confidence
								347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.										.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.			.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		514	.	.	.	.	.	520	.				.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure										.	.	.
Query SS confidence										.	.	.
Query Sequence		A	L	A	F	I	S	G	H	.	.	.	Y	E	T	G	E	P	L	P	K	E	L	L	D	K	M	L	A	A	K	N	Y	Q	A	A	L	F	I	L	R	Q	L	E	F	G	L	F	D	F	R	L	H	A	E	F	R	P	D	Q	G	A	K	I	L	E	T	L	A	E	I	K	K	L	V	A	V	V	P	S	P
Query Conservation										.	.	.
Alig confidence										.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	E	K	I	G	L	L	K	D	Y	V	R	D	D	E	A	R	I	N	Q	L	F	L	T	A	L	D	K	I	V	F	L	P	F	A	F	T	M	D	K	Y	R	W	S	L	F	R	.	.	.	.	.	.	.	G	E	V	D	K	A	N	W	N	C	A	F	W	K	L	R	D	E	Y	S	G	I	E	P	P
Template Known Secondary structure						T	T	S	S	S	S					S	T	T	T									T	T	T	T	T																	T	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		G	G	G																		S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.								.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
						591	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	S	W	G	R	F	P	H	A	F	S	H	I	F	A	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	S	Y	L	W	A	D	V	L	A	A	D	A	F	S	R	F	E	E	E	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	N	R	E	T	G	Q	S	F	L	D	N	I	L	S	R
Query Conservation		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																		.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation																							.	.	.																																																				.
Template Sequence		V	V	R	S	E	K	D	F	D	A	P	A	K	Y	H	I	S	A	D	V	E	.	.	.	Y	L	R	Y	L	V	S	F	I	I	Q	F	Q	F	Y	K	S	A	C	I	K	A	G	Q	Y	D	P	D	N	V	E	L	P	L	D	N	C	D	I	Y	G	S	A	R	A	G	A	A	F	H	N	.	M	L	S	M
Template Known Secondary structure		S				T	T				G	G	G	S						T			.	.	.																						T	T	S			S	S		T	T	S		G	G	G				T	T											.			T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.																																																				.
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.				.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.		.	.	.	.
		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.		.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		G	G	S	E	E	P	M	D	L	F	K	R	F	R	G	.	R	E	P	Q	L	D	A	M	L	E	H	Y
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.
Template Conservation
Template Sequence		G	A	S	K	P	W	P	D	A	L	E	A	F	N	G	E	R	I	M	S	G	K	A	I	A	E	Y	F
Template Known Secondary structure		T	T	S	S											S							T	T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.