Job Description P27298 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 463 % Identity 14% Template c3hq2A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:bacillus subtilis m32 carboxypeptidase; PDBTitle: bsucp crystal structure Resolution 2.90 Å

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		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	W	E	N	L	C	Q	P	L	A	E	V	D	D	V	L	G	R	I	F	S	P	V	S	H	L	N	S	V	K	N	S	P	E	L	R	E	A	Y	E	Q	T	L	P	L	L	S	E	Y	S	T	W	V	G	Q	H	E	G	L	Y	K	A	Y	R	D	L	R	D	G	D	H	Y	A	T	L	N	T	A	Q	K
Query Conservation
Alig confidence																																																																									.	.
Template Conservation																																																																									.	.
Template Sequence		T	Y	E	K	E	F	F	D	L	L	K	R	I	S	H	Y	S	E	A	V	A	L	M	H	W	D	S	R	T	G	A	P	K	N	G	S	E	D	R	A	E	S	I	G	Q	L	S	T	D	I	F	N	I	Q	T	S	D	R	M	K	E	L	I	D	V	L	Y	E	R	F	D	.	.	D	L	S	E	D	T	K
Template Known Secondary structure																													T	T	T			T	T	S																																		T	G	G	.	.	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.			.	.	.	.	80	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	V	D	N	A	L	R	D	F	E	L	S	G	I	G	L	P	K	E	K	Q	Q	R	Y	G	E	I	A	T	R	L	S	E	L	G	N	Q	Y	S	N	N	V	L	D	A	T	M	G	W	T	K	L	V	T	D	E	A	E	L	A	G	M	P	E	S	A	L	A	A	A	K	A	Q	A	E	A	K	E	L
Query Conservation
Alig confidence																.																											.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.																											.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	V	E	L	A	K	K	E	Y	E	E	N	K	.	K	I	P	E	A	E	Y	K	E	Y	V	I	L	C	S	K	A	E	T	A	W	E	E	A	K	G	.	.	.	.	.	K	S	D	F	S	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T	.	T	S																									.	.	.	.	.	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																											.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.		.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.						.	.	.	.	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	Y	L	L	T	L	D	I	P	S	Y	L	P	V	M	T	Y	C	D	N	Q	A	L	R	E	E	M	Y	R	A	Y	S	T	R	A	S	D	Q	G	P	N	A	G	K	W	D	N	S	K	V	M	E	E	I	L	A	L	R	H	E	L	A	Q	L	L	G	F	E	N	Y	A	F	K	S	L	A	T	K	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	Y	L	E	Q	L	I	E	F	N	K	R	F	I	T	Y	W	G	Y	Q	E	H	P	Y	D	A	L	L	D	L	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		288			.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.
Query SS confidence			.	.
Query Sequence		A	.	.	E	N	P	Q	Q	V	L	D	F	L	T	D	L	A	K	R	A	R	P	Q	G	E	K	E	L	A	Q	L	R	A	F	A	K	A	E	F	G	V	D	E	L	Q	P	W	D	I	A	Y	Y	S	E	K	Q	K	Q	H	L	Y	S	I	S	D	E	Q	L	R	P	Y	F	P	E	N	K	A	V	N	G
Query Conservation			.	.
Alig confidence			.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	P	G	V	T	V	K	V	L	D	Q	L	F	A	E	L	K	E	A	I	I	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	Q	V	T	A	S	G	N	K	P	D	T	S	F	I	T	K	A	F	P	K	E	K	Q	K	E	L
Template Known Secondary structure		S	T	T																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	T	T					T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	E	V	V	K	R	I	Y	G	I	T	A	K	E	R	K	D	V	D	V	W	H	P	D	V	R	F	F	E	L	Y	D	E	N	N	E	L	R	G	S	F	Y	L	D	L	Y	A	R	E	N	K	R	G	G	A	W	M	D	D	C	V	G	Q	M	R	K	A	D	G	S	L	Q	K	P	V	A	Y	L	T
Query Conservation
Alig confidence									.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	Y	F	L	Q	E	.	L	G	Y	D	F	D	G	G	R	L	D	E	T	V	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	T	T	L	N	R	G	D	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T
Template Known Secondary structure									.	T	T			T	T	S							S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.												.	.
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		C	N	F	N	R	P	V	N	G	K	P	A	L	F	T	H	D	E	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	G	L	H	H	M	L	T	R	I	E	T	A	G	V	S	G	I	S	G	V	P	W	D	A	V	E	L	P	S	Q	F	M	E	N	W	C	.	W	E	P	E	A	L	A	F	I	S	G	H	Y	E	T
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.																																																			.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	Y	D	E	K	D	.	.	.	.	.	.	.	F	R	T	A	I	F	G	T	I	H	E	C	G	H	A	I	Y	E	Q	N	I	D	E	A	L	S	G	T	N	L	S	D	G	A	S	M	G	I	H	E	S	Q	S	L	F	Y	E	N	F	I	G	R	N	K	H	F	W	T	P	Y	Y	K	K	I	Q	E
Template Known Secondary structure						T	T		.	.	.	.	.	.	.	T																		T	T	S		G	G	G	T	T	S	S	S	S	S		S														T	T	T	T	T	S	G	G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.								.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
		525	.	.			.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.											.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	P	.	.	L	P	K	E	L	L	D	K	M	L	A	A	K	N	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	L	F	I	L	R	Q	L	E	F	G	L	F	D	F	R	L	H	A	E	F	R	P	D	Q	G	A	K	I	L	E	T	L	A	E	I	K	K	L	V	A	V	V	P	S	P	S	W
Query Conservation					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation																																																				.	.
Template Sequence		A	S	P	V	Q	F	K	D	I	S	L	D	D	F	V	R	A	I	N	E	S	K	P	S	F	I	R	V	E	A	D	E	L	T	Y	P	L	H	I	I	I	R	Y	E	I	E	K	A	I	F	.	.	S	N	E	V	S	V	E	D	L	P	S	L	W	N	Q	K	Y	Q	D	Y	L	G	I	T	P	Q	T	D
Template Known Secondary structure			S	T	T	T	T	T	T											T						S		G	G	G			T	T	T																	.	.	T	T		S		G	G	G														S				S	S	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.			.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.										.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	R	F	P	H	A	F	S	H	I	F	A	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	S	Y	L	W	A	D	V	L	A	A	D	A	F	S	R	F	E	E	E	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	N	R	E	T	G	Q	S	F	L	D	N	I	L	S	R	G	G	S	E	E	P	M	D	L	F	K	R	F	R
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.
Template Sequence		A	E	G	I	L	Q	D	V	H	W	.	A	G	G	D	F	G	Y	F	P	S	Y	A	L	G	Y	M	Y	A	A	Q	L	K	Q	K	M	L	E	D	L	P	E	F	D	A	L	L	E	R	G	E	F	H	P	I	K	Q	W	L	T	E	K	V	H	I	H	G	K	R	K	K	P	L	D	I	I	K	D	A	T
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	S		S	T	T	.	T	T	T		T	T		T																						T	T								T													T	T	T	T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
		664	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	R	E	P	Q	L	D	A	M	L	E	H	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	E	E	L	N	V	R	Y	L	I	D	Y	L
Template Known Secondary structure		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.