Job Description P27298 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 476 % Identity 17% Template c2qr4B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:peptidase m3b, oligoendopeptidase f; PDBTitle: crystal structure of oligoendopeptidase-f from enterococcus faecium Resolution 2.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.						.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	A	V	T	K	A	L	N	D	C	R	E	N	V	E	R	V	V	A	.	.	.	.	.	Q	G	A	P	Y	T	W	E	N	L	C	Q	P	L	A	E	V	D	D	V	L	G	R	I	F	S	P	V	S	H	L	N	S	V	K	N	S	P	E	L	R	E	A	Y	E	Q	T	L	P	L	L	S	E	Y	S
Query Conservation																						.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.																																								.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.
Template Sequence		D	Q	E	F	D	E	K	Y	L	E	L	S	E	E	L	K	Q	S	E	K	H	K	G	T	L	D	Q	G	A	S	Q	F	L	N	A	I	E	F	V	L	R	V	Y	R	Q	T	E	V	I	Y	V	Y	A	H	L	K	N	D	Q	D	T	G	N	T	.	.	.	D	Y	Q	A	L	Y	A	R	A	S	S	L	F
Template Known Secondary structure																G	G	G	S	T	T	T	T	T		T	T	S																																	S	T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90				.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	W	V	G	Q	H	E	G	L	Y	K	A	Y	R	D	L	R	D	G	D	H	Y	A	T	L	N	T	A	Q	K	K	A	V	D	N	A	L	R	D	F	E	L	S	G	I	G	L	P	K	E	K	Q	Q	R	Y	G	E	I	A	T	R	L	S	E	L	G	N	Q	Y	S	N	N	V	L	D	A	T	M	G	W
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	K	V	S	E	A	V	S	W	F	E	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	I	L	Q	L	S	D	D	Q	I	W	Q	Y	F	K	E	E	P	K	L	E	V	Y	R	H	Y	I	Q	Q	I	V	D	N	R	A	H	V	L	S	A	E	Q	E	S	L	L	A	G	A	G	E	I	F	D	A	S	S	D	T	F
Template Known Secondary structure								T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S													G	G	G	G	G	G									T	T	G	G	G													T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.									.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	L	V	T	D	E	A	E	L	A	G	M	P	E	S	A	L	A	A	A	K	A	Q	A	E	A	K	E	L	E	G	Y	L	L	T	L	D	I	P	S	Y	L	P	V	M	T	Y	C	D	N	Q	A	L	R	E	E	M	Y	R	A	Y	S	T	R	A	S	D	Q	G	P	N	A	G	K	W	D	N	S	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																															.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																															.
Template Sequence		A	V	L	N	N	A	D	L	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	I	E	G	E	N	G	E	I	V	Q	L	S	H	G	V	Y	G	Q	L	L	E	S	.	T	D	R	R	V	R	E	A	A	F	K	G	L	Y	S	V	Y	E	Q	F	R	N	T	F	A	S	T	L	G	T	.
Template Known Secondary structure							T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	S																	.	S																			T											.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																															.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.															.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	M	E	E	I	L	A	L	R	H	E	L	A	Q	L	L	G	F	E	N	Y	A	F	K	S	L	A	T	K	M	A	E	N	P	Q	Q	V	L	D	F	L	T	D	L	A	K	R	A	R	P	Q	G	E	K	E	L	A	Q	L	R	A	F	A	K	A	E	F	G	V	D	E	L	Q	P	W	D	I	A	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.																					.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																										.	.																					.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	H	I	K	G	H	N	F	K	A	K	V	R	N	Y	S	S	A	R	E	A	S	L	S	N	N	.	.	H	I	P	E	S	V	Y	D	T	L	V	D	V	V	N	K	H	L	P	L	.	.	.	.	L	H	R	Y	X	E	L	R	K	R	L	L	E	V	E	K	L	H	X	Y	D	L	Y	T	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.												T	T		S									T	T	.	.	T																T				.	.	.	.													T		S	S	B		G	G	G	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.																					.	.	.	.
Template SS confidence
						240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.			.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.					.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	E	K	Q	K	Q	H	L	Y	S	I	S	D	E	Q	L	R	P	Y	F	P	E	N	K	A	V	N	G	L	F	E	V	V	K	R	I	Y	G	I	T	A	K	E	R	K	D	V	D	V	W	H	P	D	V	R	F	F	E	L	Y	D	E	N	N	E	L	R	G	S	F	Y	L	D	L	Y	A	R	E	N	K
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	E	K	A	L	E	A	L	K	P	X	G	E	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T						T	G	G	G					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	G	A	W	M	D	D	C	V	G	Q	M	R	K	A	D	G	S	L	Q	K	P	V	A	Y	L	T	C	N	F	N	R	P	V	N	G	K	P	A	L	F	T	H	D	E	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	G	L	H	H	M	L	T	R	I	E	T	A	G	V	S	G	I	S	G	V	P	W	D	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	X	A	L	D	Q	L	F	T	L	V	H	E	X	G	H	S	V	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	I	F	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																											339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	360	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.				.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.
Query Sequence		V	E	L	P	S	Q	F	M	E	N	W	C	W	E	P	E	A	L	A	F	I	S	G	H	Y	E	T	G	E	P	L	P	K	E	L	L	D	K	M	L	A	A	K	N	Y	Q	A	A	L	F	I	L	R	Q	L	E	F	G	L	F	D	F	R	L	H	A	.	.	.	E	F	R	P	D	Q	G	A	K	I	L
Query Conservation																																																																				.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	I	A	S	T	T	N	E	N	I	L	T	E	Y	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	E	K	D	P	R	V	R	A	Y	V	L	N	H	Y	L	D	G	F	K	G	T	V	F	R	Q	T	Q	F	A	E	F	E	H	F	X	H	T	E	D	E	K	G	V	P	L	T	S	E	Y	L	S
Template Known Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S																			T																				T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.											.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.				.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure														.	.	.
Query SS confidence														.	.	.
Query Sequence		E	T	L	A	E	I	K	K	L	V	A	V	.	.	.	V	P	S	P	S	W	G	R	F	P	H	A	F	S	H	I	F	A	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	S	Y	L	W	A	D	V	L	A	A	D	A	F	S	R	F	E	E	E	G	I	F	N	R	E	T	G	Q	S	F	L	D	N	I	L	S	R	G	G
Query Conservation														.	.	.
Alig confidence														.	.	.																			.	.	.																										.	.	.										.
Template Conservation																																			.	.	.																										.	.	.										.
Template Sequence		D	S	Y	G	K	L	N	A	K	Y	Y	G	P	A	V	E	E	D	P	E	I	K	F	E	W	S	R	I	P	H	F	Y	Y	.	.	.	N	Y	Y	V	F	Q	Y	S	T	G	F	S	A	A	S	A	L	A	K	K	I	L	N	Q	E	.	.	.	P	E	A	L	E	N	Y	L	A	.	Y	L	K	S	D	Y
Template Known Secondary structure														T	T	B				G	G	G	G	G	G	G	G	G		G	G	G	G	S	.	.	.	S	S		T																			T	T		.	.	.	T	T								.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.																										.	.	.										.
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520				.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.				.	.	.	.	550	.	.	.	.		.	.	.	.	.	560
		652	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	E	E	P	M	D	L	F	K	R	F	R	G	R	E	P	Q	L	D	A	M	L	E	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.									.
Template Conservation		.	.	.									.
Template Sequence		.	.	.	P	V	E	V	X	K	K	A	.	G	V	D	X	T	Q	A	A	Y	I	E	D
Template Known Secondary structure		.	.	.								T	.	T			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.									.
Template SS confidence
					564	.	.	.	.	.	570	.		.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.