Job Description P27298 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:46 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 539 % Identity 18% Template c2h1jA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:oligoendopeptidase f; PDBTitle: 3.1 a x-ray structure of putative oligoendopeptidase f: crystals grown2 by microfluidic seeding Resolution 3.10 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	P	F	S	K	I	L	P	E	H	V	V	P	A	V	T	K	A	L	N	D	C	R	E	N	V	E	R	V	V	A	Q	G	A	P	Y	T	W	E	N	L	C	Q	P	L	A	E	V	D	D	V	L	G	R	I	F	S	P	V	S	H	L	N	S	V	K	N	S	P	E	L	R	E	A	Y	E	Q	T	L
Query Conservation
Alig confidence													.	.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		A	X	K	F	S	E	F	R	Y	E	R	.	.	P	D	I	A	Q	L	Q	A	S	F	Q	E	A	L	D	S	F	R	R	A	G	S	A	A	L	Q	H	E	A	X	K	R	I	N	E	L	R	R	R	Y	S	T	X	A	N	L	C	H	I	R	H	T	I	D	T	N	D	E	F	Y	K	K	E	Q	D	F	F
Template Known Secondary structure					G	G	G	S					.	.																					S	S																																	T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		0	.	.	.	.	.	.	.	.	.	10			.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	L	S	E	Y	S	T	W	V	G	Q	H	E	G	L	Y	K	A	Y	R	D	L	R	D	G	D	H	Y	A	T	L	N	T	A	Q	K	K	A	V	D	N	A	L	R	D	F	E	L	S	G	I	G	L	P	K	E	K	Q	Q	R	Y	G	E	I	A	T	R	L	S	E	L	G	N	Q	Y	S	N	N	V
Query Conservation
Alig confidence													.	.																.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation													.	.																.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Sequence		D	E	T	E	P	V	V	K	G	L	V	.	.	N	D	Y	Y	R	A	L	V	S	S	P	F	R	A	E	.	.	.	.	.	.	L	E	Q	V	W	G	K	Q	L	F	A	L	A	E	T	Q	L	K	T	Y	A	P	V	I	V	E	.	.	.	.	D	L	Q	K	E	N	K	L	A	S	E	Y	T	K	L	I
Template Known Secondary structure													.	.									T		T	T				.	.	.	.	.	.							S										G	G	G			G	G	G			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.																.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.			.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.							.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.					130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	A	T	M	G	W	T	K	L	V	T	D	E	A	E	L	A	G	M	P	E	S	A	L	A	A	A	K	A	Q	A	E	A	K	E	L	E	G	Y	L	L	T	L	D	I	P	S	Y	L	P	V	M	T	Y	C	D	N	Q	A	L	R	E	E	M	Y	R	A	Y	S	T	R	A	S	D	Q	G	P	N	A
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																														.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																														.
Template Sequence		A	S	A	K	I	X	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	E	E	R	T	L	A	Q	L	.	.	.	Q	P	F	V	E	S	P	D	R	A	X	R	Q	R	A	S	E	A	R	F	S	F	F	K	D	Y	E	K	E	.
Template Known Secondary structure			T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					T	G	G	G	.	.	.					T		S	S																		T				.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																														.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	160	.	.				.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.			290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.
Query SS confidence																																									.	.
Query Sequence		G	K	W	D	N	S	K	V	M	E	E	I	L	A	L	R	H	E	L	A	Q	L	L	G	F	E	N	Y	A	F	K	S	L	A	T	K	M	A	E	.	.	N	P	Q	Q	V	L	D	F	L	T	D	L	A	K	R	A	R	P	Q	G	E	K	E	L	A	Q	L	R	A	F	A	K	A	E	F	G	V	D	E
Query Conservation																																									.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																				.	.																				.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	L	D	E	L	Y	D	E	L	V	H	V	R	T	A	I	A	R	K	L	G	F	Q	N	F	V	E	L	G	Y	A	R	L	G	R	T	D	Y	N	A	D	X	V	A	G	Y	R	R	Q	V	K	T	H	I	V	P	L	.	.	.	.	A	A	K	L	R	E	R	Q	R	Q	R	I	Q	V	E	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.																			T	T		S	S									T	T			S																					.	.	.	.												T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template SS confidence
						192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.					.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.
Query SS confidence																																																	.	.
Query Sequence		L	Q	P	W	D	I	A	Y	Y	S	E	K	Q	K	Q	H	L	Y	S	I	S	D	E	Q	L	R	P	Y	F	P	E	N	K	A	V	N	G	L	F	E	V	V	K	R	I	Y	G	.	.	I	T	A	K	E	R	K	D	V	D	V	W	H	P	D	V	R	F	F	E	L	Y	D	E	N	N	E	L	R	G	S
Query Conservation																																																	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	Y	Y	D	E	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	X	F	P	T	G	N	P	T	P	K	G	D	A	D	W	I	V	Q	N	G	R	Q	X	Y	E	E	L	S	P	E	T	G	E	F	F	R	Y	X	V	E	H	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T						S	S																														T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.											.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	L	D	L	Y	A	R	E	N	K	R	G	G	A	W	M	D	D	C	V	G	Q	M	R	K	A	D	G	S	L	Q	K	P	V	A	Y	L	T	C	N	F	N	R	P	V	N	G	K	P	A	L	F	T	H	D	E	V	I	T	L	F	H	E	F	G	H	G	L	H	H	M	L	T	R	I	E	T	A	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		.	.	X	D	L	V	A	K	K	G	K	A	G	G	G	Y	C	T	Y	I	D	D	Y	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	F	S	N	F	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	D	I	D	V	L	T	H	E	A	G	H	A	F	Q	V	Y	E	S	R	.	H	Y	D	I
Template Known Secondary structure		.	.							T	T			S	S							G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T																			T	T	.	T		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
				315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.											.	340	.	.	.	.	.	.										.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	G	I	S	G	V	P	W	D	A	V	E	L	P	S	Q	F	M	E	N	W	C	W	E	P	E	A	L	A	F	I	S	G	H	Y	E	T	G	E	P	L	P	K	E	L	L	D	K	M	L	A	A	K	N	Y	Q	A	A	L	F	I	L	R	Q	L	E	F	G	L	F	D	F	R	L	H	A	E	F	R
Query Conservation
Alig confidence					.																						.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																	.
Template Conservation					.																						.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		P	E	Y	.	N	W	P	T	L	E	A	C	E	I	H	S	X	S	X	E	F	F	T	W	P	.	.	.	.	.	.	.	W	X	E	L	F	F	G	E	D	A	D	K	Y	R	F	A	H	L	S	D	A	L	L	F	.	.	.	.	.	L	P	Y	G	V	A	V	D	E	F	Q	H	A	V	Y	E	.	N	P
Template Known Secondary structure		G	G	G	.	S	S																	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	G	G					G	G	G																.	.	.	.	.																	.	S	T
Template Predicted Secondary structure					.																						.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		373	.	.		.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.								.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420						.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.		.	.
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.							.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	Q	G	A	K	I	L	E	T	L	A	E	I	K	K	L	V	A	V	V	P	S	P	S	W	G	.	.	.	.	.	.	R	F	P	H	A	F	S	H	I	F	A	G	G	Y	A	A	G	Y	Y	S	Y	L	W	A	D	V	L	A	A	D	A	F	S	R	F	E	E	E	G	I	F	N	R	E	T	G	Q
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.															.	.																								.	.	.
Template Conservation																																																	.	.																								.	.	.
Template Sequence		D	X	T	P	A	E	R	K	S	V	W	R	N	I	E	K	A	Y	L	P	T	R	D	Y	A	D	H	D	Y	L	E	R	G	G	F	W	Q	R	Q	G	H	I	Y	T	D	P	F	.	.	Y	Y	I	D	Y	T	L	A	Q	V	C	A	F	Q	F	W	K	R	A	Q	E	D	R	.	.	.	A	S	A	W	R
Template Known Secondary structure		T																		S	T	T				T	T						T	T		G	G	G	G							S	T	T	.	.	T	T																						.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.																								.	.	.
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.			.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.				.	510	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	F	L	D	N	I	L	S	R	G	G	S	E	E	P	M	D	L	F	K	R	F	R	G	R	E	P	Q	L	D	A	M	L	E	H	Y
Query Conservation
Alig confidence						.
Template Conservation						.
Template Sequence		D	Y	V	A	.	L	C	R	L	G	G	S	R	P	F	T	E	L	V	K	S	A	N	L	Q	S	P	F	A	D	G	A	V	A	S	V
Template Known Secondary structure						.					T	T	S	S									T	T				T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		514	.	.	.		.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.