Job Description P16869 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:35:50 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 649 % Identity 19% Template c3qlbA_ PDB info PDB header:metal transport Chain: A: PDB Molecule:enantio-pyochelin receptor; PDBTitle: enantiopyochelin outer membrane tonb-dependent transporter from2 pseudomonas fluorescens bound to the ferri-enantiopyochelin Resolution 3.26 Å

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		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.			.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Query SS confidence																																																																							.	.
Query Sequence		A	T	A	P	D	D	G	E	N	D	Y	S	V	T	S	T	S	A	G	T	K	M	Q	M	T	Q	R	D	I	P	Q	S	V	T	I	V	S	Q	Q	R	M	E	D	Q	Q	L	Q	T	L	G	E	V	M	E	N	T	L	G	I	S	K	S	Q	A	D	S	D	R	A	.	.	L	Y	Y	S	R	G	F	Q	I
Query Conservation																																																																							.	.
Alig confidence																																																																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	S	A	T	G	P	Q	A	G	Y	V	A	K	R	S	L	S	G	T	K	T	D	A	S	L	S	E	I	P	Q	S	I	S	V	I	T	R	D	Q	M	D	A	Q	Q	V	Q	S	V	N	E	A	L	R	Y	T	A	G	V	Q	A	N	T	T	A	A	S	Q	R	F	D	T	L	S	I	R	G	F	D	V
Template Known Secondary structure					S	S	S			S	S	S						S	T	T	T	S	S				T	T	T		S	S													T	T			S					G	G	G	S	T	T							S	S			S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
			128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	D	N	Y	M	V	D	G	I	P	T	Y	F	E	S	R	W	N	L	G	D	A	L	S	D	M	A	L	F	E	R	V	E	V	V	R	G	A	T	G	L	M	T	G	T	G	N	P	S	A	A	I	N	M	V	R	K	H	A	T	S	R	E	F	K	G	D	V	S	A	E	Y	G	S	W	N	K	E	R	Y
Query Conservation		.
Alig confidence		.																.	.	.	.																																										.
Template Conservation																		.	.	.	.																																										.
Template Sequence		T	T	G	M	L	R	D	G	L	K	G	N	T	A	Q	A	.	.	.	.	W	P	K	V	E	A	Y	G	L	E	R	I	D	V	L	K	G	P	A	S	V	L	F	G	Q	N	S	P	G	G	V	V	N	Q	I	S	K	R	P	L	D	.	K	P	F	H	E	V	Q	I	Q	G	G	S	F	D	R	A	Q	G
Template Known Secondary structure		G	G	G				T	T	B					S	S		.	.	.	.						G	G	G									S							S	S			T	T												S	.	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.																																										.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.					.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	D	L	Q	S	P	L	T	E	D	G	K	I	R	A	R	I	V	G	G	Y	Q	N	N	D	S	W	L	D	R	Y	N	S	E	K	T	F	F	S	G	I	V	D	A	D	L	G	D	L	T	T	L	S	A	G	Y	E	Y	Q	R	I	D	V	N	S	P	T	W	G	G	L	P	R	W	N	T	D	G	S
Query Conservation
Alig confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	F	D	F	S	G	P	L	D	D	E	G	Q	F	L	Y	R	L	V	G	L	E	R	D	S	G	T	Q	F	D	H	I	K	D	D	K	Q	Y	F	A	P	S	F	T	W	K	P	N	D	D	T	S	L	T	L	L	A	D	Y	T	Q	D	T	F	G	A	P	R	V	F	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S	S	S	S	S	S													B		S	S	T	T		B														S	S	S	S																	S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	S	Y	D	R	A	R	S	T	A	P	D	W	A	Y	N	D	K	E	I	N	K	V	F	M	T	L	K	Q	Q	F	A	D	T	W	Q	A	T	L	N	A	T	H	S	E	V	E	F	D	S	K	M	M	Y	V	D	A	Y	V	N	K	A	D	G	M	L	V	G	P	Y	S	N	Y	G	P	G	F	D	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	P	A	Q	G	T	L	L	G	N	P	N	G	K	V	R	H	N	V	F	L	D	E	P	G	L	D	N	D	R	T	Q	Y	S	L	G	Y	L	L	E	H	R	L	N	D	V	W	S	L	N	S	S	A	R	Y	G	H	V	N	L	L	T	N	T	A	S	G	M	S	L	A	P	D	L	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	B	S	B	T	T	T	B			T	T					T	T				S		S	S																			S	S	S																										T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	G	T	G	W	N	S	G	K	R	K	V	D	A	L	D	L	F	A	D	G	S	Y	E	L	F	G	R	Q	H	N	L	M	F	G	G	S	Y	S	K	Q	N	N	R	Y	F	S	S	W	A	N	I	F	P	D	E	I	G	S	F	Y	N	F	N	G	N	F	P	Q	T	D	W	S	P	Q	S	L	A	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	L	N	R	A	A	Y	R	F	R	I	V	G	D	T	Y	S	L	D	N	N	A	Q	A	R	W	N	L	G	S	T	Q	M	V	S	L	L	G	I	D	Y	R	R	T	R	E	D	Y	Y	L	R	G	G	S	A	S	P	I	D	I	Y	N	P	V	H	H	H	H	G	V	F	D	P	S	T	P	F	T	N	T
Template Known Secondary structure																												B	S	S	S																														S	S	S									B				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.							.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	T	T	H	M	K	S	L	Y	A	A	T	R	V	T	L	A	D	P	L	H	L	I	L	G	A	R	Y	T	.	.	.	.	.	.	N	W	R	V	D	T	L	T	Y	S	M	E	K	N	H	T	T	P	Y	A	G	L	V	F	D	I	N	D	N	W	S	T	Y	A	S	Y	T	S	I	F	Q	P	Q	N
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Q	R	A	D	Q	V	G	V	Y	A	Q	Q	Q	F	T	F	D	E	H	W	V	L	T	V	G	G	R	Q	D	R	S	S	A	R	T	D	N	R	M	N	D	S	G	S	K	Q	D	D	E	K	F	T	Y	R	T	G	L	V	Y	L	A	D	N	G	L	A	P	Y	I	S	Y	S	T	S	F	D	P	V	L
Template Known Secondary structure																			T	T	T																			T	T	T	T																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
		521	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	D	S	S	G	K	Y	L	A	P	I	T	G	N	N	Y	E	L	G	L	K	S	D	W	M	N	S	R	L	T	T	T	L	A	I	F	R	I	E	Q	D	N	V	A	Q	S	T	G	T	P	I	P	G	S	N	G	E	T	A	Y	K	A	V	D	G	T	V	S	K	G	V	E	F	E	L	N	G	A	I
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	N	F	Y	G	T	P	Y	K	P	T	S	A	K	Q	S	E	V	G	V	K	Y	Q	P	P	G	I	D	S	Y	I	T	L	S	L	F	D	L	T	Q	E	N	V	L	T	T	D	P	A	Q	.	.	.	.	.	.	R	L	N	K	I	Q	T	G	E	I	N	V	R	G	I	E	L	E	G	K	A	S	L
Template Known Secondary structure		S	B		S	S	S		B																		T	T	S	S																				S	S	S	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.							.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		601	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620							.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.			.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		T	D	N	W	Q	L	T	F	G	A	T	R	Y	I	A	E	D	N	E	G	.	.	.	.	.	.	N	A	V	N	P	N	L	P	R	T	T	V	K	M	F	T	S	Y	R	L	P	V	.	.	M	P	E	L	T	V	G	G	G	V	N	W	Q	N	R	V	Y	T	D	T	V	T	P	Y	G	T	F	R	A	E
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																							.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	G	L	D	L	L	A	A	L	T	Y	N	D	A	E	V	S	K	S	N	N	P	L	E	K	G	K	R	P	T	D	T	P	E	K	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	L	P	E	G	P	L	S	G	L	G	F	G	A	G	V	R	Y	I	G	S	T	E	A	D	A	A	N	T	Q	.	.	.	.	.	R
Template Known Secondary structure		T	T	S																S	S			T	T							T	T			S													S	S	T	T	T	T																S	T	T	S			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.						.
		673	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.							.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.		.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.																									.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.																									.
Query Sequence		Q	G	S	Y	A	L	V	D	L	F	T	R	Y	Q	V	.	.	.	.	.	.	T	K	N	F	S	L	Q	G	N	V	N	N	L	F	D	K	T	Y	D	T	N	V	E	G	.	S	I	V	Y	G	T	P	R	N	F	S	I	T	G	T	Y	Q	F
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.																									.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	S	Y	T	L	L	D	A	A	V	H	Y	D	F	D	K	L	I	P	A	A	K	G	L	R	L	A	V	N	A	T	N	L	T	D	K	H	Y	Y	E	G	C	S	L	T	N	C	S	A	G	Y	D	R	S	V	I	A	S	L	R	Y	R	W
Template Known Secondary structure																G	G	G	S	S	G	G	G	T	T									S	T	T										S	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.