Job Description P16869 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:35:50 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 664 % Identity 18% Template c2grxB_ PDB info PDB header:metal transport Chain: B: PDB Molecule:ferrichrome-iron receptor; PDBTitle: crystal structure of tonb in complex with fhua, e. coli2 outer membrane receptor for ferrichrome Resolution 3.30 Å

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		51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.			.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Query SS confidence																																																																						.	.
Query Sequence		T	A	P	D	D	G	E	N	D	Y	S	V	T	S	T	S	A	G	T	K	M	Q	M	T	Q	R	D	I	P	Q	S	V	T	I	V	S	Q	Q	R	M	E	D	Q	Q	L	Q	T	L	G	E	V	M	E	N	T	L	G	I	S	K	S	Q	A	D	S	D	R	A	.	.	L	Y	Y	S	R	G	F	Q	I	D
Query Conservation																																																																						.	.
Alig confidence																																																																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	S	A	W	G	P	A	A	T	I	A	A	R	Q	S	A	T	G	T	K	T	D	T	P	I	Q	K	V	P	Q	S	I	S	V	V	T	A	E	E	M	A	L	H	Q	P	K	S	V	K	E	A	L	S	Y	T	P	G	V	S	V	G	T	R	G	A	S	N	T	Y	D	H	L	I	I	R	G	F	A	A	E
Template Known Secondary structure				S	S	S			S	S	S	S						T	T	T	S	S				G	G	G		S	S											T	T	T			S	S	S	S	T	T	S	T	T		T	T			S		T	T	T	T			S	S						T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
						129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	N	Y	M	V	D	G	I	P	T	Y	F	E	S	R	W	N	L	G	D	A	L	S	D	M	A	L	F	E	R	V	E	V	V	R	G	A	T	G	L	M	T	G	T	G	N	P	S	A	A	I	N	M	V	R	K	H	A	T	S	R	E	F	K	G	D	V	S	A	E	Y	G	S	W	N	K	E
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																.	.	.																																										.
Template Conservation																					.	.	.																																										.
Template Sequence		G	Q	S	Q	N	N	Y	L	N	G	L	K	L	Q	G	N	F	Y	N	.	.	.	D	A	V	I	D	P	Y	M	L	E	R	A	E	I	M	R	G	P	V	S	V	L	Y	G	K	S	S	P	G	G	L	L	N	M	V	S	K	R	P	T	T	.	E	P	L	K	E	V	Q	F	K	A	G	T	D	S	L	F
Template Known Secondary structure		S	S							T	T						B	T	T	B	.	.	.						G	G	G									S								S			S	S												S	.	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.																																										.
Template SS confidence
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.				.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	V	A	D	L	Q	S	P	L	T	E	D	G	K	I	R	A	R	I	V	G	G	Y	Q	N	N	D	S	W	L	D	R	Y	N	S	E	K	T	F	F	S	G	I	V	D	A	D	L	G	D	L	T	T	L	S	A	G	Y	E	Y	Q	R	I	D	V	N	S	P	T	W	G	G	L	P	R	W	N	T	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	T	G	F	D	F	S	D	S	L	D	D	D	G	V	Y	S	Y	R	L	T	G	L	A	R	S	A	N	A	Q	Q	K	G	S	E	E	Q	R	Y	A	I	A	P	A	F	T	W	R	P	D	D	K	T	N	F	T	F	L	S	Y	F	Q	N	E	P	E	T	G	Y	Y	G	W	L	P	K	E	G	T	V	E
Template Known Secondary structure											S	S	T	T	S		S														S	S	S	S																S	S	S	S																					B		S	B	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.
Query Sequence		G	S	S	N	S	Y	D	R	A	R	S	T	A	P	D	W	A	Y	N	D	K	E	I	N	K	V	F	M	T	L	K	Q	Q	F	A	D	T	W	Q	A	T	L	N	A	T	H	S	E	V	E	F	D	S	K	M	M	.	.	.	Y	V	D	A	Y	V	N	K	A	D	G	M	L	V	G	P	Y	S	N	Y	G
Query Conservation																																																										.	.	.
Alig confidence																																																										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	P	N	G	K	R	L	P	T	D	F	N	E	G	A	K	N	N	T	Y	S	R	N	E	K	M	V	G	Y	S	F	D	H	E	F	N	D	T	F	T	V	R	Q	N	L	R	F	A	E	N	K	T	S	Q	N	S	V	Y	G	Y	G	V	C	S	D	P	A	N	A	Y	S	K	Q	C	A	A	L	A	P
Template Known Secondary structure				T	T	S					T	T				S		T	T																			S	S	S																								B	T	T	S	G	G	G	T	T		T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	F	D	Y	V	G	G	T	G	W	N	S	G	K	R	K	V	D	A	L	D	L	F	A	D	G	S	Y	E	L	F	G	R	Q	H	N	L	M	F	G	G	S	Y	S	K	Q	N	N	R	Y	F	S	S	W	A	N	I	F	P	D	E	I	G	S	F	Y	N	F	N	G	N	F	P	Q	T	D	W	S	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	D	K	G	H	Y	L	A	R	K	Y	V	V	D	D	E	K	L	Q	N	F	S	V	D	T	Q	L	Q	S	K	F	A	T	G	D	I	D	H	T	L	L	T	G	V	D	F	M	R	M	R	N	D	I	N	A	W	F	G	Y	D	D	S	V	P	L	L	N	L	T	D	F	D	F	N	A	K	D	P	A	N
Template Known Secondary structure					T	T		B																										S	S	S																									S	S	S	S										T	T				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.							.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	S	L	A	Q	D	D	T	T	H	M	K	S	L	Y	A	A	T	R	V	T	L	A	D	P	L	H	L	I	L	G	A	R	Y	T	N	W	R	V	D	.	.	.	.	.	.	T	L	T	Y	S	M	E	K	N	H	T	T	P	Y	A	G	L	V	F	D	I	N	D	N	W	S	T	Y	A	S	Y	T	S	I
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	G	P	Y	R	I	L	N	K	Q	K	Q	T	G	V	Y	V	Q	D	Q	A	Q	W	D	K	V	L	V	T	L	G	G	R	Y	D	W	A	D	Q	E	S	L	N	R	V	A	G	T	T	D	K	R	D	D	K	Q	F	T	W	R	G	G	V	N	Y	L	F	D	N	G	V	T	P	Y	F	S	Y	S	E	S
Template Known Secondary structure																									T	T																			T	T	T	T																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Q	P	Q	N	D	R	D	S	S	G	K	Y	L	A	P	I	T	G	N	N	Y	E	L	G	L	K	S	D	W	M	N	S	R	L	T	T	T	L	A	I	F	R	I	E	Q	D	N	V	A	Q	S	T	G	T	P	I	P	G	S	N	G	E	T	A	Y	K	A	V	D	G	T	V	S	K	G	V	E	F	E
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	P	S	S	Q	V	G	K	D	G	N	I	F	A	P	S	K	G	K	Q	Y	E	V	G	V	K	Y	V	P	E	D	R	P	I	V	V	T	G	A	V	Y	N	L	T	K	T	N	N	L	M	A	D	P	E	G	.	.	.	.	.	.	S	F	F	S	V	E	G	G	E	I	R	A	R	G	V	E	I	E
Template Known Secondary structure								B		T	T	S	S	B																		S	S	S																					T	T	T	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.							.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620					.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.			.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.																						.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.																						.	.
Query Sequence		L	N	G	A	I	T	D	N	W	Q	L	T	F	G	A	T	R	Y	I	A	E	D	N	E	G	.	.	.	.	N	A	V	N	P	N	L	P	R	T	T	V	K	M	F	T	S	Y	R	L	P	.	.	V	M	P	E	L	T	V	G	G	G	V	N	W	Q	N	R	V	Y	T	D	T	V	T	P	Y	G	T	F
Query Conservation																											.	.	.	.																						.	.
Alig confidence																											.	.	.	.																						.	.																										.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		A	K	A	A	L	S	A	S	V	N	V	V	G	S	Y	T	Y	T	D	A	E	Y	T	T	D	T	T	Y	K	G	N	T	P	A	Q	V	P	K	H	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	F	F	D	G	P	L	S	G	L	T	L	G	T	G	G	R	Y	T	G	S	S	Y	G	D	P	A	N	S	F	.	.	.
Template Known Secondary structure							S	S	S																		T	T	T	T	T				T	T			S													S	S	T	T	T	T															S	S	T	T			S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.					690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.			.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		R	A	E	Q	G	S	Y	A	L	V	D	L	F	T	R	Y	Q	V	T	K	.	.	.	.	N	F	S	L	Q	G	N	V	N	N	L	F	D	K	T	Y	D	T	N	V	E	G	.	.	S	I	V	Y	G	T	P	R	N	F	S	I	T	G	T	Y	Q	F
Query Conservation																						.	.	.	.																							.	.
Alig confidence		.	.																			.	.	.	.																							.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	K	V	G	S	Y	T	V	V	D	A	L	V	R	Y	D	L	A	R	V	G	M	A	G	S	N	V	A	L	H	V	N	N	L	F	D	R	E	Y	V	A	S	C	F	N	T	Y	G	C	F	W	G	A	E	R	Q	V	V	A	T	A	T	F	R	F
Template Known Secondary structure		.	.																G	G	G	G	T		S	S									S	T	T									S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.