Job Description P16869 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:35:50 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 676 % Identity 31% Template c1xkhC_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: C: PDB Molecule:ferripyoverdine receptor; PDBTitle: pyoverdine outer membrane receptor fpva from pseudomonas aeruginosa2 pao1 bound to pyoverdine Resolution 3.60 Å

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		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	V	I	V	E	G	S	A	T	A	P	D	D	G	E	N	D	Y	S	V	T	S	T	S	A	G	T	K	M	Q	M	T	Q	R	D	I	P	Q	S	V	T	I	V	S	Q	Q	R	M	E	D	Q	Q	L	Q	T	L	G	E	V	M	E	N	T	L	G	I	S	K	S	Q	A	D	S	D	R	A	L	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	T	X	I	T	S	N	Q	L	G	T	I	T	E	D	S	G	S	Y	T	P	G	T	I	A	T	A	T	R	L	V	L	T	P	R	E	T	P	Q	S	I	T	V	V	T	R	Q	N	X	D	D	F	G	L	N	N	I	D	D	V	X	R	H	T	P	G	I	T	V	S	A	Y	D	T	D	R	N	N	Y	Y
Template Known Secondary structure									S	S				S	S	S	S			S	S						T	T	T	S	S				S	T	T			S													T	T			B	S					T	T	S	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		S	R	G	F	Q	I	D	N	Y	M	V	D	G	I	P	T	Y	F	E	S	R	W	N	L	G	.	D	A	L	S	D	M	A	L	F	E	R	V	E	V	V	R	G	A	T	G	L	M	T	G	T	G	N	P	S	A	A	I	N	M	V	R	K	H	A	T	S	R	E	F	K	G	D	V	S	A	E	Y	G	S
Query Conservation																											.
Alig confidence																											.																																										.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		A	R	G	F	S	I	N	N	F	Q	Y	D	G	I	P	S	T	A	R	N	V	G	Y	S	A	G	N	T	L	S	D	X	A	I	Y	D	R	V	E	V	L	K	G	A	T	G	L	L	T	G	A	G	S	L	G	A	T	I	N	L	I	R	K	K	P	T	H	.	E	F	K	G	H	V	E	L	G	A	G	S
Template Known Secondary structure			T	T						B		B	T	T	B							S	T	T			S	T	T			B	S	T	T											G	G	G	T	S		S			S				B									S	.	S											T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	K	E	R	Y	V	A	D	L	Q	S	P	L	T	E	D	G	K	I	R	A	R	I	V	G	G	Y	Q	N	N	D	S	W	L	D	R	Y	N	S	E	K	T	F	F	S	G	I	V	D	A	D	L	G	D	L	T	T	L	S	A	G	Y	E	Y	Q	R	I	D	V	N	S	P	T	W	G	G	L	P	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	D	N	Y	R	S	E	L	D	V	S	G	P	L	T	E	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	Q	D	K	H	S	F	X	D	H	Y	E	R	K	T	S	V	Y	Y	G	I	L	E	F	D	L	N	P	D	T	X	L	T	V	G	A	D	Y	Q	D	N	D	P	K	G	S	G	W	S	G	S	F	P
Template Known Secondary structure		T	T												S	S	T	T		S															S	S	T	T																	T	T	S																S				S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	T	D	G	S	S	N	S	Y	D	R	A	R	S	T	A	P	D	W	A	Y	N	D	K	E	I	N	K	V	F	M	T	L	K	Q	Q	F	A	D	T	W	Q	A	T	L	N	A	T	H	S	E	V	E	F	D	S	K	M	M	Y	V	D	A	Y	V	N	K	A	D	G	M	L	V	G	P	Y	S	N	Y
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	D	S	Q	G	N	R	N	D	V	S	R	S	F	N	N	G	A	K	W	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	Q	Y	T	R	T	V	F	A	N	L	E	H	N	F	A	N	G	W	V	G	K	V	Q	L	D	H	K	I	N	G	Y	H	A	P	L	G	A	I	X	G	D	W	P	A
Template Known Secondary structure		S	B		S	S	S	S	B					T	T				B		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T	S																							S	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390												.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	G	F	D	Y	V	G	G	T	G	W	N	S	G	K	R	K	V	D	A	L	D	L	F	A	D	G	S	Y	E	L	F	G	R	Q	H	N	L	M	F	G	G	S	Y	S	K	Q	N	N	R	Y	F	S	S	W	A	N	I	F	P	D	E	I	G	S	F	Y	N	F	N	G	N	F	P	Q	T	D	W	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	D	N	S	A	K	I	V	A	Q	K	Y	T	G	E	T	K	S	N	S	L	D	I	Y	L	T	G	P	F	Q	F	L	G	R	E	H	E	L	V	V	G	T	S	A	S	F	S	H	W	E	G	K	S	Y	W	N	L	R	N	Y	D	N	T	T	D	D	F	I	N	W	D	G	D	I	G	K	P	D	W	G
Template Known Secondary structure		T	T	T																												S	S	S	S																									S						S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.		.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		P	Q	S	L	A	Q	D	D	T	T	H	M	K	S	L	Y	A	A	T	R	V	T	L	A	D	P	L	H	L	I	L	G	A	R	Y	T	.	N	W	R	V	D	T	L	T	Y	S	M	E	K	N	H	T	T	P	Y	A	G	L	V	F	D	I	N	D	N	W	S	T	Y	A	S	Y	T	S	I	F	Q	P	Q
Query Conservation																																						.
Alig confidence																																						.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	S	Q	Y	I	D	D	K	T	R	Q	L	G	S	Y	X	T	A	R	F	N	V	T	D	D	L	N	L	F	L	G	G	R	V	V	D	Y	R	V	T	G	L	N	P	T	I	R	E	S	G	R	F	I	P	Y	V	G	A	V	Y	D	L	N	D	T	Y	S	V	Y	A	S	Y	T	D	I	F	X	P	Q
Template Known Secondary structure		S		S																				S	S	S	S																S	S	S	S																			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
		520	.	.	.			.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.			.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.																																													.	.
Query SS confidence						.	.																																													.	.
Query Sequence		N	D	R	D	.	.	S	S	G	K	Y	L	A	P	I	T	G	N	N	Y	E	L	G	L	K	S	D	W	M	N	S	R	L	T	T	T	L	A	I	F	R	I	E	Q	D	N	V	A	Q	S	.	.	T	G	T	P	I	P	G	S	N	G	E	T	A	Y	K	A	V	D	G	T	V	S	K	G	V	E	F	E
Query Conservation						.	.																																													.	.
Alig confidence						.	.																																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	W	Y	R	D	S	S	N	K	L	L	E	P	D	E	G	Q	N	Y	E	I	G	I	K	G	E	Y	L	D	G	R	L	N	T	S	L	A	Y	F	E	I	H	E	E	N	R	A	E	E	D	A	L	Y	N	S	K	P	T	N	P	A	I	T	Y	A	Y	K	G	I	K	A	K	T	K	G	Y	E	A	E
Template Known Secondary structure			T	T				S	S	S																				T	T	T	T																				S	S	T	T	S					T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.		.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.			.	.	.	.	670	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.																							.	.
Query SS confidence																																																		.																							.	.
Query Sequence		L	N	G	A	I	T	D	N	W	Q	L	T	F	G	A	T	R	Y	I	A	E	D	N	E	G	N	A	V	N	P	N	L	P	R	T	T	V	K	M	F	T	S	Y	R	L	P	V	M	.	P	E	L	T	V	G	G	G	V	N	W	Q	N	R	V	Y	T	D	T	V	T	P	.	.	Y	G	T	F	R	A	E
Query Conservation																																																		.																							.	.
Alig confidence																																																		.																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	G	E	L	A	P	G	W	Q	V	Q	A	G	Y	T	H	K	I	I	R	D	D	S	G	K	K	V	S	T	W	E	P	Q	D	Q	L	S	L	Y	T	S	Y	K	F	K	G	A	L	D	K	L	T	V	G	G	G	A	R	W	Q	G	K	S	W	Q	X	V	Y	N	N	P	R	S	R	W	E	K	F	S
Template Known Secondary structure						S	S	S	S															T	T			B			T	T	S		S													G	G	G	T	T																				G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.
		673	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.			.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.
Query SS confidence																																									.	.
Query Sequence		Q	G	S	Y	A	L	V	D	L	F	T	R	Y	Q	V	T	K	N	F	S	L	Q	G	N	V	N	N	L	F	D	K	T	Y	D	T	N	V	E	G	.	.	S	I	V	Y	G	T	P	R	N	F	S	I	T	G	T	Y	Q	F
Query Conservation																																									.	.
Alig confidence																																									.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	D	Y	W	L	V	D	L	X	A	R	Y	Q	I	T	D	K	L	S	A	S	V	N	V	N	N	V	F	D	K	T	Y	Y	T	N	I	G	F	Y	T	S	A	S	Y	G	D	P	R	N	L	X	F	S	T	R	W	D	F
Template Known Secondary structure																	S	S	S								T	T	T	T								S		S	S	S								S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		757	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.