Job Description P04805 Confidence 99.76% Date Thu Jan 5 10:58:21 GMT 2012 Rank 37 Aligned Residues 273 % Identity 22% Template d1h3na3 SCOP info Adenine nucleotide alpha hydrolase-like Nucleotidylyl transferase Class I aminoacyl-tRNA synthetases (RS), catalytic domain Resolution 2.0

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.						.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.														.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query Sequence		P	S	P	T	G	Y	L	H	V	G	G	A	R	T	A	L	Y	S	W	L	F	A	R	.	.	.	.	.	N	H	G	G	E	F	V	L	R	I	E	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	E	R	S	T	P	E	A	I	E	A	I	M	D	G	M	N	W	L	S	L	E	W	D	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Alig confidence																									.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		P	Y	P	S	G	D	L	H	M	G	H	L	K	N	Y	T	M	G	D	V	L	A	R	F	R	R	M	Q	G	Y	E	V	L	H	P	M	G	W	D	A	F	G	L	P	A	E	N	A	A	L	K	F	G	V	H	P	K	D	W	T	Y	A	N	I	R	Q	A	K	E	S	L	R	L	M	G	I	L	Y	D	W
Template Known Secondary structure				S	S	S			B																				T	T									B			S	S										T	T																					T	T					G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
				70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.						.	100	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	110
Predicted Secondary structure		.	.																														.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																														.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	E	G	P	Y	Y	Q	T	K	R	F	D	R	Y	N	A	V	I	D	Q	M	L	E	E	G	T	A	Y	K	C	.	.	.	.	.	Y	C	S	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	E	A	L	R	E
Query Conservation		.	.																														.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																														.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	R	E	V	T	T	C	E	P	E	Y	Y	R	W	N	Q	W	I	F	L	K	M	W	E	K	G	L	A	Y	R	A	K	G	L	V	N	W	C	P	K	C	Q	T	V	L	A	N	E	Q	V	V	E	G	R	C	W	R	H	E	D	T	P	V	E	K	R	E	L	E	Q	W	Y	L	R	I	T	A	Y	A	E
Template Known Secondary structure		G	G			B	T	T	S																	T	T													T	T	T	T					G	G	G			T	T			S	S		T	T	S	B													G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.			.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	M	A	K	G	E	K	P	R	Y	D	G	R	C	R	H	S	H	E	H	H	A	D	D	E	P	.	.	C	V	V	R	F	A	N	P	Q	E	G	S	V	V	F	D	D	Q	I	R	G	P	I	E	F	S	N	Q	E	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	L	K	D	L	E	G	L	N	W	P	E	K	V	K	A	M	Q	R	A	W	I	G	R	L	R	D	W	L	I	S	R	Q	R	Y	W	G	T	P	I	P	M	V	H	C	E	A	C	G	V	V	P	V	P	E	E	E	L	P	V	L	L	P	D	L	K	D	V	E	D	I	R	P	K	G	K	S	P	L
Template Known Secondary structure						T	T	T	T		B	S																							S		S	S	S									T	T	T							G	G	G															S		S	S	S		G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
						169	170	.	.	.	.	.			.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	D	L	I	I	R	R	T	.	.	D	G	S	P	T	Y	N	F	C	V	V	V	D	D	W	D	M	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	H	V	I	R	G	E	D	H	I	N	N	T	P	R	Q	I	N	I	L	K
Query Conservation		.	.	.	.								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.								.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	H	P	E	F	Y	E	T	T	C	P	K	C	G	G	P	A	K	R	D	T	D	T	M	D	T	F	F	D	S	S	W	Y	Y	L	R	Y	T	D	P	H	N	D	R	L	P	F	D	P	E	K	A	N	A	W	M	P	V	D	Q	Y	I	G	G	V	E	H	A	V	L	H	L	L	Y	S	R	F	F	T
Template Known Secondary structure		G	G										T	T	T		S															T	T	S					T	T	S	T	T		S	S	S	S	S										S	B	S						G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
		216	.																																																															.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	P	V	P	V	Y	A	H	V	S	M	I	N	G	D
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	F	L	H	D	L	G	M	V	K	V	E	E	P	F	Q	G	L	F	T	Q	G	M	V	L	A	W	T	D	F	G	P	V	E	V	E	G	S	V	V	R	L	P	E	P	T	R	I	R	L	E	I	P	E	S	A	L	S	L	E	D	V	R	K	M	G	A	E	L	R	P	H	E	D	G	T	L	H	L	W
Template Known Secondary structure							T	T	S		S		S		S	B	S	B																				T	T													T		S		S										T	T							T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	K	K	L	S	K	R	H	G	A	V	S	V	M	Q	Y	R	D	D	G	Y	L	P	E	A	L	L	N	Y	L	V	R	L	G	W	S	H	G	D	Q	E	I	F	T	R	E	E	M
Query Conservation
Alig confidence																																					.
Template Conservation																																					.
Template Sequence		K	P	A	V	M	S	K	S	K	G	N	G	V	M	V	G	P	F	V	K	E	Q	G	A	D	I	A	R	I	T	I	L	F	A	A	.	P	P	E	N	E	M	V	W	T	E	E	G	V
Template Known Secondary structure								T	T	T	T				B								S													S	.		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																					.
Template SS confidence
		634	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.		.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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