Job Description P32136 Confidence 99.98% Date Thu Jan 5 11:49:21 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 414 % Identity 14% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	H	N	P	L	T	L	K	L	N	L	R	E	K	I	A	Y	G	M	G	D	V	G	S	N	L	M	L	C	I	G	T	L	Y	L	L	K	F	Y	T	D	E	L	G	M	P	A	Y	Y	G	G	I	I	F	L	V	A	K	F	F	T	A	F	T	D	M	L	T	G	F	L	L	D	S	R	K	N	I	G
Query Conservation
Alig confidence																																									.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.																																				.	.	.	.
Template Sequence		A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	.	.	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D	R	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S																													T	S								T	.	.	T	S	S	T	T		S	S																											S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.																																				.	.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	K	G	K	F	R	P	F	I	L	Y	A	A	V	P	A	A	L	I	A	T	L	Q	F	I	A	T	T	F	C	L	P	V	K	T	T	I	A	T	A	L	F	M	M	F	G	L	S	Y	S	L	M	N	C	S	Y	G	A	M	I	P	A	I	T	K	N	P	N	E	R	A	Q	L	A	A	Y	R	Q	G	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																														.	.
Template Conservation		.	.	.																														.	.
Template Sequence		.	.	.	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	.	.	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H
Template Known Secondary structure		.	.	.																												S	S	.	.	S	S																T										T	T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																														.	.
Template SS confidence
					91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.			120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	I	G	L	L	I	C	T	V	A	F	I	P	L	Q	S	L	F	S	D	S	T	V	G	Y	A	C	A	A	L	M	F	S	I	G	G	F	I	F	M	M	L	C	Y	R	G	V	K	E	H	Y	V	D	T	T	P	T	G	H	K	A	S	I	L	K	S	F	C	A	I	F	R	N	P	P	L	L	V	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	V	G	G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I
Template Known Secondary structure						T	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T				S		T	T	T						T							T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		C	I	A	N	L	C	T	L	A	A	F	N	I	K	L	A	I	Q	V	Y	Y	T	Q	Y	V	L	N	.	D	I	N	L	L	S	W	M	G	F	F	S	M	G	C	I	L	I	G	V	L	L	V	P	L	T	V	K	C	F	G	K	K	Q	V	Y	L	A	G	M	V	L	W	A	V	G	D	I	L	N	Y	F
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V
Template Known Secondary structure																							B	T	T	B	S																																T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
		321					.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.																																																											.
Query SS confidence			.	.	.	.																																																											.
Query Sequence		W	.	.	.	.	G	S	N	S	F	T	F	V	M	F	S	C	V	A	F	F	G	T	A	F	V	N	S	L	N	W	A	L	V	P	D	T	V	D	Y	G	E	W	K	T	G	I	R	A	E	G	S	V	Y	T	G	Y	T	F	F	R	K	I	.	S	A	A	L	A	G	F	L	P	G	I	M	L	T	Q	I
Query Conservation			.	.	.	.																																																											.
Alig confidence			.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.																		.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	.	.	.	.	.	.	.	K	K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F
Template Known Secondary structure		T	T	S			T	T																	T													T	S		.	.	.	.	.	.	.	T	T																															S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.								.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Y	V	P	N	I	A	Q	S	D	A	T	L	Q	G	L	R	Q	L	I	F	I	W	P	C	A	L	A	I	I	A	A	L	T	M	G	F	F	Y	T	L	N	E	K	R	F	A	L	I	I	E	E	I
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																															G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		412																.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.