Job Description P07762 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:31 GMT 2012 Rank 47 Aligned Residues 427 % Identity 17% Template c1cygA_ PDB info PDB header:glycosyltransferase Chain: A: PDB Molecule:cyclodextrin glucanotransferase; PDBTitle: cyclodextrin glucanotransferase (e.c.2.4.1.19) (cgtase) Resolution 2.50 Å

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		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Q	F	D	A	P	I	S	I	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	R	H	T	D	N	N	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	E	L	A	D	Q	L	V	P	.	.	Y	A	K	W	M	G	F	T	H	L	E	L	L	P	I	N	E	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.		.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.
Template Sequence		K	V	N	F	T	S	D	V	V	Y	Q	I	V	V	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	S	G	A	L	F	S	S	G	C	T	N	L	R	K	Y	C	G	G	D	W	Q	G	I	I	N	K	I	.	N	D	G	Y	L	T	D	M	G	V	T	A	I	W	I	S	Q	P	V	E	N	V	F	S	V	M
Template Known Secondary structure		T	T			T	T								G	G	G	T			S		G	G	G				G	G	G	B		G	G	G		S	T	T	S	B													.		T	S	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
					292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	H	P	F	D	G	S	W	G	Y	Q	P	T	G	L	Y	A	P	T	R	R	F	G	T	R	D	D	F	R	Y	F	I	D	A	A	H	A	A	G	L	N	V	I	L	D	W	V	P	G	H	F	P	T	D	D	F	A	L	A	E	F	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	A	S	G	S	A	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	K	P	N	P	F	F	G	T	L	S	D	F	Q	R	L	V	D	A	A	H	A	K	G	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	N	P	S	Y	M	E	N	G	R	L	Y	D	N	G	T	L	L	G	G	Y	T
Template Known Secondary structure		S	S	S	S				S	T	T	S		S									T	T	T																T	T									T	T							S	S		T	T	S	T	T	T	T					T	T						S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
				354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370									.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	T	N	L	Y	E	H	S	D	P	R	E	G	Y	H	Q	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	L	I	Y	N	Y	G	R	R	E	V	S	N	F	L	V	G	N	A	L	Y	W	I	E	R	F	G	I	D	A	L	R	V	D	A	V	A	S	M	I	Y	R	D	Y	S	R	K	E	G	E	W	I
Query Conservation		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.																									.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	A	N	M	Y	F	H	H	N	G	G	T	T	F	S	S	L	E	D	G	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	H	Q	N	P	V	I	D	R	Y	L	K	D	A	V	K	M	W	I	.	D	M	G	I	D	G	I	R	M	D	A	V	K	H	M	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T		T	T			B			S		B				S	S						S	S	B	S	T	T				B		T	T	S																.	T	T	T							S		G	G	G	S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.		.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		P	N	E	F	G	G	R	E	N	L	E	A	I	E	F	L	R	N	T	N	R	I	L	G	E	Q	V	S	G	A	V	T	M	A	E	E	S	T	D	F	P	G	V	.	S	R	P	Q	D	M	G	G	L	G	F	W	Y	K	W	N	L	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	M	K	L	D	P	V	Y	R	Q	Y
Query Conservation																																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.															.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	Q	K	S	L	M	D	E	I	D	N	Y	R	P	.	V	F	T	F	G	E	W	F	L	S	E	N	E	V	D	A	N	N	H	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	G	Q	K	L	R	Q	V	L	R	N	N	S	D	N	W	Y	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.											T	T													S	S				B													T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template SS confidence
															233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510			.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure										.	.
Query SS confidence										.	.
Query Sequence		H	H	D	K	L	T	F	G	.	.	I	L	Y	N	Y	T	E	N	F	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	K	S	I	L	D	R	M	P	G	D	A	W	Q	K	F	A	N	L	R	A	Y	Y	G	W	M	W	A	F	P	G	K	K	L	L	F	M	G	N	E	F	A	Q	G	R	E	W	N	H
Query Conservation										.	.
Alig confidence										.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	Q	M	I	Q	D	T	A	S	A	Y	D	E	V	L	D	Q	V	T	F	I	D	N	H	D	M	D	R	F	M	I	D	G	G	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	V	D	M	A	L	A	V	L	L	T	S	R	G	V	P	N	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	G	N	G	D	P
Template Known Secondary structure														T	T	G	G	G					S			T	T	S			S			T	T			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.											.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	S	L	D	W	H	L	L	E	G	G	D	N	W	H	H	G	V	Q	R	L	V	R	D	L	N	L	T	Y	R	H	H	K	A	M	H	E	L	D	F	D	P	Y	G	F	E	W	L	V	V	D	D	K	E	R	S	V	L	I	F	V	R	R	D	K	E	G	N	E	I	I	V	A	S	N	F	T	P	V
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation									.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		N	N	R	K	M	M	S	.	.	.	.	S	F	N	K	N	T	R	A	Y	Q	V	I	Q	K	L	S	S	L	R	R	N	N	P	A	L	A	Y	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	Q	R	W	I	N	G	D	V	Y	V	Y	E	R	Q	F	G	K	.	D	V	V	L	V	A	V	N	R	S	S	S
Template Known Secondary structure		G	G	G					.	.	.	.				S		S																								.	.	.	.	.	.	.	.								S	S									T	T	.											S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.					.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.									.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	R	H	D	Y	R	F	G	I	N	Q	P	G	K	W	R	E	I	L	N	T	D	S	M	H	Y	H	G	S	N	A	G	N	G	G	T	V	H	S	D	E	I	A	S	H	G	R	Q	H	S	L	S	L	T	L	P	P	L	A	T	I	W	L	V	R
Query Conservation
Alig confidence					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	N	Y	.	S	I	T	G	L	F	T	A	L	P	A	G	T	Y	T	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	G	L	L	D	G	N	T	I	Q	V	G	S	N	G	S	V	N	A	F	D	L	G	P	G	E	V	G	V	W	A	Y
Template Known Secondary structure					.				S		B		S	S		S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T									G	G	G	B	B							T	T
Template Predicted Secondary structure					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		436	.	.		.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.												.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.