Job Description P75780 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:14:03 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 640 % Identity 21% Template c1xkwA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:fe(iii)-pyochelin receptor; PDBTitle: pyochelin outer membrane receptor fpta from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 2.00 Å

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		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	P	S	L	Y	A	P	Q	Q	S	A	D	P	K	F	S	R	P	V	A	D	T	T	R	T	M	T	V	I	S	E	Q	V	I	K	D	Q	G	A	T	N	L	T	D	A	L	K	N	V	P	G	V	G	A	F	F	A	G	E	N	G	N	S	T	T	G	D	A	I	Y	M	R	G	A	D	T	S	N	S
Query Conservation
Alig confidence																																																															.	.	.	.	.												.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.												.
Template Sequence		S	T	S	A	T	Q	P	P	G	V	T	T	L	G	K	V	P	L	K	P	R	E	L	P	Q	S	A	S	V	I	D	H	E	R	L	E	Q	Q	N	L	F	S	L	D	E	A	M	Q	Q	A	T	G	V	T	V	Q	P	F	Q	L	L	.	.	.	.	.	T	T	A	Y	Y	V	R	G	F	K	V	.	D	S
Template Known Secondary structure				T	T				T	T		B		T	T	S	S		B		G	G	G		S	S													T	T			B							T	S	T	T								T	T	.	.	.	.	.							T	T				.
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.												.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.						.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.					.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.
Query Sequence		I	Y	I	D	G	I	R	D	I	G	.	.	.	.	S	V	S	R	D	T	F	N	T	E	Q	V	E	V	I	K	G	P	S	G	T	D	Y	G	R	S	A	P	T	G	S	I	N	M	I	S	K	Q	P	R	N	D	S	G	I	D	A	S	A	S	I	G	S	A	W	F	R	R	G	T	L	D	V	N	Q	V
Query Conservation												.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	E	L	D	G	V	P	A	L	L	G	N	T	A	S	S	P	Q	D	M	A	I	Y	E	R	V	E	I	L	R	G	S	N	G	L	L	H	G	T	G	N	P	A	A	T	V	N	L	V	R	K	R	P	Q	R	E	F	A	A	S	T	T	L	S	A	G	R	W	D	R	Y	R	A	E	V	D	V	G	G	P
Template Known Secondary structure					T	T						S	S	T	T					B		T	T									S			T	T	T	T		S			S	S												S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	D	T	T	A	V	R	L	N	V	M	G	E	K	T	H	D	A	G	R	D	K	V	K	N	E	R	Y	G	V	A	P	S	V	A	F	G	L	G	T	A	N	R	L	Y	L	N	Y	L	H	V	T	Q	H	N	T	P	D	G	G	I	P	T	I	G	L	P	G	Y	S	A	P	S	A	G	T	A	A	L
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	A	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	E	D	R	D	Y	F	Y	D	V	A	D	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	L	L	Y	G	V	T	E	F	D	L	S	P	D	T	L	L	T	V	G	A	Q	Y	Q	H	I	D	S	I	T	N	M	A	G	V	P
Template Known Secondary structure		S	S	S	S	S	S															S	S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T																		S	S		B
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.																.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	H	S	G	K	V	D	T	H	N	F	Y	G	T	D	S	D	Y	D	D	S	T	T	D	T	A	T	M	R	F	E	H	D	I	N	D	N	T	T	I	R	N	T	T	R	W	S	R	V	K	Q	D	Y	L	M	T	A	I	M	G	G	A	S	N	I	T	Q	P	T	S	D	V	N	S	W	T	W	S	R	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	A	K	D	G	S	N	L	G	L	S	R	D	T	Y	L	D	V	D	W	D	R	F	K	W	D	T	Y	R	A	F	G	S	L	E	Q	Q	L	G	G	G	W	K	G	K	V	S	A	E	Y	Q	E	A	D	S	R	L	R	Y	A	G	S	F	G	A	I	D	P	Q	T	G	D	G	G	Q	L	M	G	A	A
Template Known Secondary structure			B	T	T	S							T	T				B		T	T																				T	T																							S		B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	T	K	D	V	S	N	K	I	L	T	N	Q	T	N	L	T	S	T	F	Y	T	G	S	I	G	H	D	V	S	T	G	V	E	F	T	R	E	T	Q	T	N	Y	G	V	N	P	V	T	L	P	A	V	N	I	Y	H	P	D	S	S	I	H	P	G	G	L	T	R	N	G	A	N	A	N	G	Q	T	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	F	K	S	I	Q	R	S	L	D	A	N	L	N	G	P	V	R	L	F	G	L	T	H	E	L	L	G	G	V	T	Y	A	Q	G	E	T	R	Q	D	T	A	R	F	L	N	L	P	N	T	P	V	N	V	Y	R	W	D	P	H	G	V	P	R	P	Q	I	G	Q	Y	T	S	P	G	T	T	T	T	T
Template Known Secondary structure																						T	T																							B	S	S								T	T	T			S	S	S						B				B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	F	A	I	Y	A	F	D	T	L	Q	I	T	R	D	F	E	L	N	G	G	I	R	L	D	N	Y	H	T	E	Y	D	S	A	T	A	C	G	G	S	G	R	G	A	I	T	C	P	T	G	V	A	K	G	S	P	V	T	T	V	D	T	A	K	S	G	N	L	M	N	W	K	A	G	A	L	Y	H	L	T
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	G	L	Y	A	L	G	R	I	K	L	A	E	P	L	T	L	V	V	G	G	R	E	S	W	W	D	Q	D	T	P	A	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	P	G	R	Q	F	T	P	Y	G	G	L	I	W	D	F	A
Template Known Secondary structure															T	T																	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		E	N	G	N	V	Y	I	N	Y	A	V	S	Q	Q	P	P	G	G	N	N	F	A	L	A	Q	S	G	S	G	N	S	A	N	R	T	D	F	K	P	Q	K	A	N	T	S	E	I	G	T	K	W	Q	V	L	D	K	R	L	L	L	T	A	A	L	F	R	T	D	I	E	N	E	V	E	Q	N	D	D	G	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	W	S	W	Y	V	S	Y	A	E	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	P	L	S	P	V	E	G	K	T	Y	E	T	G	I	K	G	E	L	A	D	G	R	L	N	L	S	L	A	A	F	R	I	D	L	E	N	N	P	Q	E	D	P	D	H	P
Template Known Secondary structure		T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					G	G	G	T																				S	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
								604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.				.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																																						.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																																						.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	T	Y	S	Q	Y	G	K	K	R	V	E	G	Y	E	I	S	V	A	G	N	I	T	P	A	W	Q	V	I	G	G	Y	T	Q	Q	K	A	T	I	K	N	G	K	D	V	A	Q	D	G	S	S	S	L	P	Y	T	P	E	H	A	F	T	L	W	S	Q	Y	Q	A	T	.	.	.	D	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																											.																											.	.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		G	P	P	N	N	P	F	Y	I	S	G	G	K	V	R	S	Q	G	F	E	L	E	G	T	G	Y	L	T	P	Y	W	S	L	S	A	G	Y	T	Y	T	S	T	E	Y	L	K	D	S	.	Q	N	D	S	G	T	R	Y	S	T	F	T	P	R	H	L	L	R	L	W	S	N	Y	D	L	P	W	Q	D	R	R
Template Known Secondary structure			S	T	T																									T	T																		T	.	T	S		T	T		B	S		T	T	S		S												S
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.		.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.
		675	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	V	G	A	G	A	R	Y	I	G	S	M	H	K	G	S	D	G	A	V	G	T	P	A	F	T	E	G	Y	W	V	A	D	A	K	L	G	Y	R	V	N	R	N	L	D	F	Q	L	N	V	Y	N	L	F	D	T	D	Y	V	A	S	I	N	K	S	G	Y	R	Y	H	P	G	E	P	R	T	F	L	L
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.
Template Conservation																							.	.	.
Template Sequence		W	S	V	G	G	G	L	Q	A	Q	S	D	Y	S	V	D	Y	R	G	V	S	.	.	.	M	R	Q	G	G	Y	A	L	V	N	M	R	L	G	Y	K	I	D	E	H	W	T	A	A	V	N	V	N	N	L	F	D	R	T	Y	Y	Q	S	L	S	N	P	N	W	N	N	R	Y	G	E	P	R	S	F	N	V
Template Known Secondary structure																			T	T			.	.	.																	S	S	S	S									S	T	T											T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.
Template SS confidence
		638	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.				.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
		755	.	.	.	.	760
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	N	M	H	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	L	R	G	A	F
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		715	.	.	.	.	720