Job Description P75780 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:14:03 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 612 % Identity 18% Template c1po3A_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:iron(iii) dicitrate transport protein feca PDBTitle: crystal structure of ferric citrate transporter feca in2 complex with ferric citrate Resolution 3.40 Å

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		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.					.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.																.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.																.	.	.
Query Sequence		R	P	V	A	D	T	T	R	T	M	T	V	I	S	E	Q	V	I	K	D	Q	G	A	T	N	L	T	D	A	L	K	N	V	P	G	V	G	A	F	F	A	G	E	N	G	N	S	T	T	G	D	A	I	Y	M	R	G	A	.	.	.	.	D	T	S	N	S	I	Y	I	D	G	I	R	D	I	G	.	.	.
Query Conservation																																																												.	.	.	.																.	.	.
Alig confidence																																																												.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	V	F	E	H	A	G	A	R	D	V	I	R	R	E	D	F	A	K	T	G	A	T	T	M	R	E	V	L	N	R	I	P	G	V	S	A	P	E	N	N	G	T	G	S	H	D	L	A	M	N	F	G	I	R	G	L	N	P	R	L	A	S	R	S	T	V	L	M	D	G	I	P	V	P	F	A	P	Y
Template Known Secondary structure				G	G	G		S	S	S						G	G	G	T	G	G	G	T			S						T	T	S	T	T						S	B	T	T	B		S	S	S	S						T	T				G	G	G	T	T	S					T	T				S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
								139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.							.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	S	V	S	R	D	T	F	N	T	E	Q	V	E	V	I	K	G	P	S	G	T	D	Y	G	R	S	A	P	T	G	S	I	N	M	I	S	K	Q	P	R	N	D	S	G	I	D	A	S	A	S	.	.	.	.	.	.	I	G	S	A	W	F	R	R	G	T	L	D	V	N	Q	V	I	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	P	Q	L	S	L	A	P	V	S	L	G	N	M	D	A	I	D	V	V	R	G	G	G	A	V	R	Y	G	P	Q	S	V	G	G	V	V	N	F	V	T	R	A	I	P	Q	D	F	G	I	E	A	G	V	E	G	Q	L	S	P	T	S	S	Q	N	N	P	K	E	T	H	N	L	M	V	G	G	T	A
Template Known Secondary structure		T					S	S					G	G	G									S				S	S	S		S	S	G	G	G												S	S													T	T	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	T	T	A	V	R	L	N	V	M	G	E	K	T	H	D	A	G	R	D	K	V	K	N	E	R	Y	G	V	A	P	S	V	A	F	G	L	G	T	A	N	R	L	Y	L	N	Y	L	H	V	T	Q	H	N	T	P	D	G	G	I	P	T	I	G	L	P	G	Y	S	A	P	S	A	G	T	A	A	L	N	H
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	N	G	F	G	T	A	L	L	Y	S	G	T	R	G	S	D	W	R	E	H	S	A	T	R	I	D	D	L	M	L	K	S	K	Y	A	P	D	E	V	H	T	F	N	S	L	L	Q	Y	Y	D	G	E	A	D	M	P	G	G	L	S	R	A	D	Y	D	A	D	R	W	Q	S	T	R	P	Y	D	R	F	W
Template Known Secondary structure		T	T	T															S	S	S	S																S	S	S	S																													T	T			S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	K	V	D	T	H	N	F	Y	G	T	D	S	D	Y	D	D	S	T	T	D	T	A	T	M	R	F	E	H	D	I	N	D	N	T	T	I	R	N	T	T	R	W	S	R	V	K	Q	D	Y	L	M	T	A	I	M	G	G	A	S	N	I	T	Q	P	T	S	D	V	N	S	W	T	W	S	R	T	A	N
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	R	K	L	A	S	L	G	Y	Q	F	Q	P	D	S	Q	H	K	F	N	I	Q	G	F	Y	T	Q	T	L	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	L	E	Q	G	K	R	I	T
Template Known Secondary structure															S	S	S	S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	D	V	S	N	K	I	L	T	N	Q	T	N	L	T	S	T	F	Y	T	G	S	I	G	H	D	V	S	T	G	V	E	F	T	R	E	T	Q	T	N	Y	G	V	N	P	V	T	L	P	A	V	N	I	Y	H	P	D	S	S	I	H	P	G	G	L	T	R	N	G	A	N	A	N	G	Q	T	D	T	F
Query Conservation
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	P	R	N	Y	W	V	R	G	I	E	P	R	Y	S	Q	I	F	M	I	G	P	S	A	H	E	V	G	V	G	Y	R	Y	L	N	E	S	T	H	E	M	R	Y	Y	T	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	G	Q	L	P	S	G	S	S	P	Y	D	R	D	T	R	S	G	T	E	A	H
Template Known Secondary structure																							T	T																									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.										.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	Y	A	F	D	T	L	Q	I	T	R	D	F	E	L	N	G	G	I	R	L	D	N	Y	H	T	E	Y	D	S	A	T	A	C	G	G	S	G	R	G	A	I	T	C	P	T	G	V	A	K	G	S	P	V	T	T	V	D	T	A	K	S	G	N	L	M	N	W	K	A	G	A	L	Y	H	L	T	E	N
Query Conservation
Alig confidence													.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	W	Y	L	D	D	K	I	D	I	G	.	N	W	T	I	T	P	G	M	R	F	E	H	I	E	S	Y	Q	N	N	A	I	T	G	T	H	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	S	Y	N	A	P	L	P	A	L	N	V	L	Y	H	L	T	D	S
Template Known Secondary structure												T	.	T																			T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T
Template Predicted Secondary structure													.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.		.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		G	N	V	Y	I	N	Y	A	V	S	Q	Q	P	P	G	G	N	N	F	A	L	A	Q	S	G	S	G	N	S	A	N	R	T	D	F	K	P	Q	K	A	N	T	S	E	I	G	T	K	W	Q	V	L	D	K	R	L	L	L	T	A	A	L	F	R	T	D	I	E	N	E	V	E	Q	N	D	D	G	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.																						.	.																									.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Sequence		W	N	L	Y	A	N	T	E	G	S	F	G	T	V	Q	Y	S	Q	I	G	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	G	N	V	E	P	E	K	A	R	T	W	E	L	G	T	R	Y	D	D	.	.	G	A	L	T	A	E	M	G	L	F	L	I	N	F	N	N	Q	Y	D	S	N	Q	T	N	D	T	V
Template Known Secondary structure																	G	G	G	S	S				.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S																		.	.	S	S													S							T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.								.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.			.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
						604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	T	Y	S	Q	Y	G	K	K	R	V	E	G	Y	E	I	S	V	A	G	N	I	T	P	A	W	Q	V	I	G	G	Y	T	Q	Q	K	A	T	I	K	N	G	K	D	V	A	Q	D	G	S	S	S	L	P	Y	T	P	E	H	A	F	T	L	W	S	Q	Y	Q	A	T	D	D	I	S	V	G	A
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																											.	.	.																							.
Template Conservation																																																.	.	.																							.
Template Sequence		T	A	R	G	K	T	R	H	T	G	L	E	T	Q	A	R	Y	D	L	G	T	L	T	P	T	L	D	N	V	S	I	Y	A	S	Y	A	Y	V	N	A	E	I	R	E	K	G	.	.	.	D	T	Y	G	N	L	V	P	F	S	P	K	H	K	G	T	L	G	V	D	Y	K	.	P	G	N	W	T	F	N	L
Template Known Secondary structure																				T	T	S	S		G	G	G	T	T																S	S	S	.	.	.	T	T	T	T		B		S	S			S	B										.	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.																							.
Template SS confidence
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.				.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.		.	.	.	.	.	.	650	.
		680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.						700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.				.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.		.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.																		.	.	.																							.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.																		.	.	.																							.
Query Sequence		G	A	R	Y	I	G	S	M	H	K	G	S	D	G	A	V	G	T	P	A	.	.	.	.	.	F	T	E	G	Y	W	V	A	D	A	K	L	G	Y	R	V	N	.	.	.	R	N	L	D	F	Q	L	N	V	Y	N	L	F	D	T	D	Y	V	A	S	I	N	.	K	S	G	Y	R	Y	H	P	G	E	P	R
Query Conservation																						.	.	.	.	.																		.	.	.																							.
Alig confidence																						.	.	.	.	.																		.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		N	S	D	F	Q	S	S	Q	F	A	D	N	A	N	T	V	K	E	S	A	D	G	S	T	G	R	I	P	G	F	M	L	W	G	A	R	V	A	Y	D	F	G	P	Q	M	A	D	L	N	L	A	F	G	V	K	N	I	F	D	Q	D	Y	F	I	R	S	Y	D	D	N	N	K	G	I	Y	A	G	Q	P	R
Template Known Secondary structure									B		S	S	T	T				S			S	S	S	S	S	S		B														S		T	T	T	T										S	T	T										S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		652	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.
		751	.	.	.	.	.	.	.	.	760
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	F	L	L	T	A	N	M	H	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	L	Y	M	Q	G	S	L	K	F
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		732	.	.	.	.	.	.	.	740	.