![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 91 | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||
Query Sequence |   | D | V | V | D | A | T | A | G | L | G | R | D | A | F | V | L | A | S | V | . | . | G | C | R | V | R | M | L | E | R | N | P | V | V | A | A | L | L | D | D | G | L | A | R | G | Y | A | D | A | E | I | G | G | W | L | Q | E | R | L | Q | L | I | H | A | S | S | L | T | A | L | T | D | I | T | P | R | P | Q | V | V |
Template Sequence |   | S | L | V | D | V | G | G | G | T | G | G | V | T | K | L | I | H | E | I | F | P | H | L | K | C | T | V | F | D | Q | P | Q | V | V | G | N | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | L | T | G | N | E | N | L | N | F | V | G | G | D | M | F | . | . | . | . | K | S | I | P | S | A | D | A | V |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | . | . | . | . | T | S | ![]() | ![]() | |||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 202 | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | ||||||||||||||||||||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 169 | 170 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | Y | L | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | L | L | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 262 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version |
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|