Job Description P08204 Confidence 90.72% Date Thu Jan 5 11:00:58 GMT 2012 Rank 119 Aligned Residues 317 % Identity 19% Template c3khyA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:propionate kinase; PDBTitle: crystal structure of a propionate kinase from francisella2 tularensis subsp. tularensis schu s4 Resolution 1.98 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50		.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.
Query SS confidence																																																				.
Query Sequence		M	A	I	A	I	G	L	D	F	G	S	D	S	V	R	A	L	A	V	D	C	A	T	G	E	E	I	A	T	S	V	E	W	Y	P	R	W	Q	K	G	Q	F	C	D	A	P	N	N	Q	F	.	R	H	H	P	R	D	Y	I	E	S	M	E	A	A	L	K	T	V	L	A	E	L	S	V	E	Q	R	A	A
Query Conservation																																																				.
Alig confidence																																																				.																								.	.
Template Conservation																																																																												.	.
Template Sequence		X	S	E	I	L	V	L	N	C	G	S	S	S	V	K	F	A	L	I	N	P	H	T	S	Q	S	L	V	T	G	L	A	E	N	I	A	T	K	N	C	K	V	V	F	K	A	E	H	K	I	V	K	Y	L	E	N	G	S	Y	K	D	V	F	E	X	L	K	D	F	L	V	E	N	K	.	.	H	L	E	K
Template Known Secondary structure												S	S									T	T	T	T										S	T	T	S	T	T							S	S	S							T	T																	T	T	.	.		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.
		80	.	.	.	.						.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	G	I	G	.	.	.	.	.	V	D	S	T	G	S	T	P	A	P	I	D	A	D	G	N	V	L	A	L	R	P	E	F	A	E	N	P	N	A	M	F	V	L	W	K	D	H	T	A	V	E	E	A	E	E	I	T	R	L	C	H	A	P	G	N	V	D	Y	S	R	Y	I	G	G	I	Y	S	S	E
Query Conservation							.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	A	I	G	H	R	V	V	H	G	G	Q	Y	F	S	K	S	V	L	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	S	L	E	K	I	K	A	C	I	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	L	H	N	P
Template Known Secondary structure										S			T	T	T		S	S					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.												.	.	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	F	W	A	K	I	L	H	V	T	R	Q	D	S	A	V	A	Q	S	A	A	S	W	I	E	L	C	D	W	V	P	A	L	L	S	G	T	T	R	P	Q	D	I	R	R	G	R	C	S	A	G	H	K	S	L	W	H	E	S	W	G	G	L	P	P	A	S	F	F	D	E	L	D	P	I	L	N	R	H	L
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	H	I	E	G	I	R	F	C	Q	Q	I	F	P	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.						.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.							.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.				.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.				.
Query Sequence		P	S	P	L	F	T	D	T	W	T	A	D	I	P	V	G	T	L	C	P	E	W	A	Q	R	L	G	L	P	.	.	.	.	.	E	S	V	V	I	S	G	G	A	F	D	C	H	M	G	A	V	G	.	.	.	.	.	.	A	G	A	.	Q	P	N	A	L	V	K	V	I	G	T	S	T	C	D	I	L	I
Query Conservation																															.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.				.
Alig confidence		.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.				.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	P	Q	V	A	V	F	D	T	A	F	H	Q	T	X	P	S	Y	I	A	E	Y	A	I	P	Y	E	L	T	H	K	H	N	I	R	K	Y	G	A	H	G	T	S	H	K	Y	V	S	E	Q	A	A	K	I	L	T	Q	Q	K	A	N	V	I	V	A	H	L	G	N	G	C	S	I	T	A	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.							T	T	G	G	G	G	G	S						S		S	S							T	S			S				S																S		S	S										S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		303	.	.	.	.	.	.	310					.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.
Query Sequence		A	D	K	Q	S	V	G	E	.	.	.	.	R	A	V	K	G	I	C	G	Q	V	D	G	S	V	V	P	G	F	I	G	L	E	A	G	Q	S	A	F	G	D	I	Y	A	W	F	G	R	V	L	G	W	P	L	E	Q	L	A	A	Q	H	P	E	L	K	T	Q	I	N	A	S	Q	K	Q	L	L	P	A	L
Query Conservation										.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	G	K	S	I	D	T	S	X	G	L	T	P	L	D	G	L	V	X	G	T	R	S	G	C	I	D	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	A	Y	I	S	D	N	L	G	W	S	V	T	E	I	T	N	X	L	N	K	Q	S	G	L	L	G	I	C	G	H	N	D	X	R	E	V
Template Known Secondary structure			T	T						S			S	S	T	T	S	S	S			S	S				S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							S								S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240													.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	E	A	W	A	K	N	P	S	L	D	H	L	P	V	V	L	D	W	F	N	G	R	R	T	P	N	A	N	Q	R	L	K	G	V	I	T	D	L	N	L	A	T	D	A	P	L	L	F	G	G	L	I	A	A	T	A	F	G	A	R	A	I	M	E	C	F	T	D	Q	G	I	A	V	N	N	V	M	A	L
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Q	L	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	D	S	L	A	K	L	A	I	E	I	F	S	H	R	V	A	K	F	V	A	S	Y	X	I	Y	F	N	K	L	D	A	L	V	F	T
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																							G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	I	A	R	K	N	Q	V	I	M	Q	A	C	C	D	V	L	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	G	I	G	E	N	A	A	N	I	R	K	N	I	I	S	K	L	A
Template Known Secondary structure																			T	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.