Job Description P08204 Confidence 97.15% Date Thu Jan 5 11:00:58 GMT 2012 Rank 66 Aligned Residues 307 % Identity 19% Template c1tuuA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:acetate kinase; PDBTitle: acetate kinase crystallized with atpgs Resolution 2.50 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.							.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	A	I	A	I	G	L	D	F	G	S	D	S	V	R	A	L	A	V	D	C	A	T	G	E	E	I	A	T	S	V	E	W	Y	P	R	W	Q	K	G	Q	F	C	D	A	P	N	N	Q	F	R	H	H	P	R	D	Y	I	E	S	M	E	A	A	L	K	T	V	L	A	E	L	.	.	.	.	.	.	S	V
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																																																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		M	K	.	V	L	V	I	N	A	G	S	S	S	L	K	Y	Q	L	I	D	M	T	N	E	S	A	L	A	V	G	L	C	E	R	I	G	I	D	N	S	I	I	T	Q	K	K	F	D	G	K	K	L	E	K	L	T	D	L	P	T	H	K	D	A	L	E	E	V	V	K	A	L	T	D	D	E	F	G	V	I
Template Known Secondary structure				.								S	S									T	T	T	T											T	T	S	S	S								T	T	S											S													T		T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		1	.		.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.						.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	R	A	A	V	V	G	I	G	.	.	.	.	.	V	D	S	T	G	S	T	P	A	P	I	D	A	D	G	N	V	L	A	L	R	P	E	F	A	E	N	P	N	A	M	F	V	L	W	K	D	H	T	A	V	E	E	A	E	E	I	T	R	L	C	H	A	P	G	N	V	D	Y	S	R	Y	I	G	G
Query Conservation												.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	M	G	E	I	N	A	V	G	H	R	V	V	H	G	G	E	K	F	T	T	S	A	L	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	V	E	K	A	I	K	D	C	F	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G									S			T	T	T			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.												120
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	Y	S	S	E	W	F	W	A	K	I	L	H	V	T	R	Q	D	S	A	V	A	Q	S	A	A	S	W	I	E	L	C	D	W	V	P	A	L	L	S	G	T	T	R	P	Q	D	I	R	R	G	R	C	S	A	G	H	K	S	L	W	H	E	S	W	G	G	L	P	P	A	S	F	F	D	E	L	D	P	I
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	H	N	P	P	N	M	M	G	I	S	A	C	A	E	I	M	P	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T																T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.							.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.									.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query Sequence		L	N	R	H	L	P	S	P	L	F	T	D	T	W	T	A	D	I	P	V	G	T	L	C	P	E	W	A	Q	R	L	G	L	P	E	.	.	.	.	.	.	S	V	V	I	S	G	G	A	F	D	C	.	.	.	.	.	.	.	.	H	M	G	A	V	G	A	G	A	.	Q	P	N	A	L	V	K	V	I	G
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.						.						.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	V	I	V	F	D	T	A	F	H	Q	T	M	P	P	Y	A	Y	M	Y	A	L	P	Y	D	L	Y	E	K	H	G	V	R	K	Y	.	G	F	H	G	T	S	H	K	Y	V	A	E	R	A	A	L	M	L	G	K	P	A	E	E	T	K	I	I	T	C	H	L	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	G	G	G	G	G									S	S														.																			T	S		G	G	G									S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template SS confidence
												142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.		.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.					310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.
Query Sequence		T	S	T	C	D	I	L	I	A	D	K	Q	S	V	G	.	.	.	.	E	R	A	V	K	G	I	C	G	Q	V	D	G	S	V	V	P	G	F	I	G	L	E	A	G	Q	S	A	F	G	D	I	Y	A	W	F	G	R	V	L	G	W	P	L	E	Q	L	A	A	Q	H	P	E	L	K	T	Q	I	N	A	S
Query Conservation																	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	G	S	S	I	T	A	V	E	G	G	K	S	V	E	T	S	M	G	F	T	P	L	E	G	L	A	M	G	T	R	C	G	S	I	D	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	P	F	L	M	E	K	E	G	L	T	T	R	E	I	D	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S								T	T						S			S	S	T	T	S	S	S			S	S				S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.													.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	K	Q	L	L	P	A	L	T	E	A	W	A	K	N	P	S	L	D	H	L	P	V	V	L	D	W	F	N	G	R	R	T	P	N	A	N	Q	R	L	K	G	V	I	T	D	L	N	L	.	A	T	D	A	P	L	L	F	G	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	A	T	A	F	G	A	R
Query Conservation																																																			.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	N	K	K	S	G	V	L	G	V	S	G	L	S	N	D	F	R	D	L	D	E	A	A	S	K	G	N	R	K	A	E	L	A	L	E	I	F	A	Y	K	V	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S								S	S		S											T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																							268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	M	E	C	F	T	D	Q	G	I	A	V	N	N	V	M	A	L	G	G	I	A	R	K	N	Q	V	I	M	Q	A	C	C	D	V	L	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	F	I	G	E	Y	S	A	V	L	N	G	A	D	A	V	V	F	T	A	G	I	G	E	N	S	A	S	I	R	K	R	I	L	T	G	L	D
Template Known Secondary structure											T	T	S		S																					T	T		G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.