Job Description P29745 Confidence 99.28% Date Thu Jan 5 11:45:41 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 246 % Identity 14% Template d2afwa1 SCOP info Phosphorylase/hydrolase-like Zn-dependent exopeptidases Glutaminyl-peptide cyclotransferase-like Resolution 1.56

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.			.	.	.	50	.	.	.	.	.	.											.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	L	L	E	R	F	L	N	Y	V	S	L	D	T	Q	S	K	A	G	V	R	Q	V	P	S	T	E	G	Q	W	K	L	L	H	L	L	K	E	Q	L	E	E	M	G	.	.	L	I	N	V	T	L	S	E	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	M	A	T	L	P	A	N	V	P	G	D
Query Conservation																																															.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.
Template Sequence		S	E	M	W	Q	N	D	L	Q	P	L	L	I	E	R	Y	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	G	S	Y	A	A	R	Q	H	I	M	Q	R	I	Q	R	L	Q	A	D	W	V	L	E	I	D	T	F	L	S	Q	T	P	Y	G	Y	R	S	F	S	N	I	I	S	T	L	N	P	.	.	.	T	A
Template Known Secondary structure								T	T	G	G	G		S				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	S																T	S	S	S														T	T	S	S										S	S	T	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.
Template SS confidence
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80									.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.				130	.
		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	A	I	G	F	I	S	H	V	D	T	S	P	D	C	S	G	K	N	V	N	P	Q	I	V	E	N	Y	R	G	G	D	I	A	L	G	I	G	D	E	V	L	S	P	V	M	F	P	V	L	H	Q	L	L	G	Q	T	L	I	T	T	D	G	K	T	L	L	G	A	D	D	K	A	G	I	A	E	I	M
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Sequence		K	R	H	L	V	L	A	C	H	Y	D	S	K	Y	F	S	H	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	R	V	F	V	G	A	T	.	.	.	.	D	S	A	V	P	C	A	M	M	L
Template Known Secondary structure		S																	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B					T	T	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								150	.	.	.	.	.	.	.	.					.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.				.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.										.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.																.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	L	A	V	L	Q	Q	K	.	.	.	K	I	P	H	G	D	I	R	V	A	F	T	P	D	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	K	G	A	K	H	F	D	V	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	A	R	W	A	Y	T	V	D	G	G	G	V	G	E
Query Conservation											.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	A	R	A	L	D	K	K	L	L	S	L	K	P	D	L	S	L	Q	L	I	F	F	D	G	E	E	A	F	L	H	W	S	P	Q	D	S	L	Y	G	S	R	H	L	A	A	K	M	A	S	T	P	H	P	P	G	A	R	G	T	S	Q	L	H	G	M	D	L	L	V	L	L	D	L	I	G	A	P	N
Template Known Secondary structure							T						T	T												S			S		S	S	S			S	S	S	S													T	S	B	S	S	T	T		S	S		B	T	T	T	T									S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	F	E	N	F	N	A	A	S	V	N	I	K	I	V	G	N	N	V	H	P	G	T	A	K	G	V	M	V	N	A	L	S	L	A	A	R	I	H	A	E	V	P	A	D	E	S	P	E	M	T	E	G	Y	E	G	F	Y	H	L	A	S	M	K	G	T	V	E	R	A	D	M	H	Y	I	I	R	D	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	N	F	F	P	N	S	A	R	W	F	E	R	L	Q	A	I	E	H	E	L	H	E	L	G	L	L	K	D	H	S	L	E	G	R	Y	F	Q	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B					G	G	G																	T	T		S	S	S			S	T	T		S	B		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		255	.																				.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	K	Q	F	E	A	R	K	R	K	M	M	E	I	A	K	K	V	G	K	G	L	H	P	D	C	Y	I	E	L	V	I	E	D	S	Y	Y	N	M	R	E	K	V	V	E	H	P	H	I	L	D	I	A	Q	Q	A	M	R	D	C	D	I	E	P	E	L	K	P	I	R	G	G	T	D	G	A	Q	L	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	Y	G	G	V	I	Q	D	D	H	I	P	F	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S				S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																			297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.				.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.									.	.	.
Query SS confidence														.	.									.	.	.
Query Sequence		F	M	G	L	P	C	P	N	L	F	T	G	.	.	G	Y	N	Y	H	G	K	H	.	.	.	E	F	V	T	L	E	G	M	E	K	A	V	Q	V	I	V	R	I	A	E	L	T
Query Conservation														.	.									.	.	.
Alig confidence														.	.									.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	G	V	P	V	L	H	L	I	P	S	P	F	P	E	V	W	H	T	M	D	D	N	E	E	N	L	D	E	S	T	I	D	N	L	N	K	I	L	Q	V	F	V	L	E	Y
Template Known Secondary structure		T	T	T									S	S			T	T	T	T	S	T	T		S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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