Job Description P29745 Confidence 99.61% Date Thu Jan 5 11:45:41 GMT 2012 Rank 58 Aligned Residues 241 % Identity 17% Template d1rtqa_ SCOP info Phosphorylase/hydrolase-like Zn-dependent exopeptidases Bacterial dinuclear zinc exopeptidases Resolution 0.95

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.										.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	L	L	E	R	F	L	N	Y	V	S	L	D	T	Q	S	K	A	G	V	R	Q	V	P	S	T	E	G	Q	W	K	L	L	H	L	L	K	E	Q	L	E	E	M	G	L	I	N	V	T	L	S	E	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	M	A	T	L	P	A	N	V	P	G	D	I	P	A
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Sequence		S	Q	I	T	G	T	I	S	S	L	E	S	F	T	N	.	.	.	.	.	.	.	R	F	Y	T	T	T	S	G	A	Q	A	S	D	W	I	A	S	E	W	Q	A	L	S	A	S	L	P	N	A	S	V	K	Q	V	S	H	S	G	Y	N	Q	K	S	V	V	M	T	I	T	G	S	E	A	P	D	.	E	W
Template Known Secondary structure													T	S	S		.	.	.	.	.	.	.			T	T	S																			T	T	S	T	T									T	T													S	S				.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.								.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.		90	.
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	F	I	S	H	V	D	T	S	P	D	C	S	G	K	N	V	N	P	Q	I	V	E	N	Y	R	G	G	D	I	A	L	G	I	G	D	E	V	L	S	P	V	M	F	P	V	L	H	Q	L	L	G	Q	T	L	I	T	T	D	G	K	T	L	L	G	A	D	D	K	A	G	I	A	E	I	M	T	A	L
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Sequence		I	V	I	G	G	H	L	D	S	T	I	G	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	E	Q	S	V	A	P	G	A	D	.	.	.	.	D	D	A	S	G	I	A	A	V	T	E	V	I
Template Known Secondary structure												S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T						T	T	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.					.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.		.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.					.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.														.												.	.	.	.
Query SS confidence											.														.												.	.	.	.
Query Sequence		A	V	L	Q	Q	K	K	I	P	.	H	G	D	I	R	V	A	F	T	P	D	E	E	.	V	G	K	G	A	K	H	F	D	V	D	.	.	.	.	A	F	D	A	R	W	A	Y	T	V	D	G	G	G	V	G	E	L	E	F	E	N	F	N	A	A	S	V	N	I	K	I	V	G	N	N	V	H	P	G	T
Query Conservation											.														.												.	.	.	.
Alig confidence											.														.												.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	L	S	E	N	N	F	Q	P	K	R	S	I	A	F	M	A	Y	A	A	E	E	V	G	L	R	G	S	Q	D	L	A	N	Q	Y	K	S	E	G	K	N	V	V	S	A	L	Q	L	D	M	T	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T				S									S		G	G	G	T	S													T	T										S			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	G	V	M	V	N	A	L	S	L	A	A	R	I	H	A	E	V	P	A	D	E	S	P	E	M	T	E	G	Y	E	G	F	Y	H	L	A	S	M	K	G	T	V	E	R	A	D	M	H	Y	I	I	R	D	F	D	R	K	Q	F	E	A	R	K	R	K	M	M	E	I	A	K	K	V	G	K	G	L	H
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.				.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.						.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	C	Y	I	E	L	V	I	E	D	S	Y	Y	N	M	R	E	K	V	V	E	H	P	H	I	L	D	I	A	Q	Q	A	M	R	D	C	D	I	E	P	E	L	K	P	I	R	G	G	.	.	.	T	D	G	A	Q	L	S	F	M	G	L	P	C	P	N	L	.	.	.	.	.	F	T	G	G	Y	N	Y
Query Conservation																																																			.	.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	S	A	Q	D	V	V	F	I	T	D	Y	T	D	S	N	F	T	Q	Y	L	T	Q	L	M	D	E	Y	L	P	S	L	T	Y	G	F	D	T	C	G	Y	A	C	S	D	H	A	S	W	H	N	A	G	Y	P	A	A	M	P	F	E	S	K	F	N	D	Y	N	P	R	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S						T	T	S																	T	T									S	S			S	T							T	T								S	S		G	G	G	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		379	380	.	.				.	.	.	.	.			.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.						.	.
Query SS confidence						.	.	.						.	.
Query Sequence		H	G	K	H	.	.	.	E	F	V	T	L	.	.	E	G	M	E	K	A	V	Q	V	I	V	R	I	A	E	L	T	A	Q
Query Conservation						.	.	.						.	.
Alig confidence						.	.	.						.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	T	T	Q	D	T	L	A	N	S	D	P	T	G	S	H	A	K	K	F	T	Q	L	G	L	A	Y	A	I	E	M	G	S
Template Known Secondary structure		T	S	T	T			G	G	G	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions