Job Description P29745 Confidence 99.53% Date Thu Jan 5 11:45:41 GMT 2012 Rank 62 Aligned Residues 295 % Identity 17% Template c2ijzF_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: F: PDB Molecule:probable m18-family aminopeptidase 2; PDBTitle: crystal structure of aminopeptidase Resolution 3.00 Å

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		23	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.								.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Q	V	P	S	T	E	G	Q	W	K	L	L	H	L	L	K	E	Q	L	E	E	M	G	L	.	.	.	.	.	.	.	I	N	V	T	L	S	E	K	G	T	L	M	A	T	L	P	A	N	V	P	G	D	I	P	A	I	G	F	I	S	H	V	D	T	S	P	D	C	S	G	K	N	V	N	P	Q	I	V
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.																					.															.	.	.	.
Template Conservation																																																						.															.	.	.	.
Template Sequence		D	F	L	K	A	S	P	T	P	F	H	A	T	A	S	L	A	R	R	L	E	A	A	G	Y	R	R	L	D	E	G	G	R	Y	Y	V	T	R	N	D	S	S	L	I	A	I	R	L	G	S	P	L	.	E	S	G	F	R	L	V	G	A	H	T	D	S	P	.	.	.	.	C	L	R	V	K	P	N	P	E
Template Known Secondary structure		S	S	S	T	T	T										S												S										T	T	T	T											S	.	T	T												S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.															.	.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.		.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.					.	.	.	80	.	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.			.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.						.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.																									.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.																									.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	Y	R	G	G	.	.	D	I	A	L	G	I	G	D	E	V	L	S	P	V	M	F	P	V	L	H	Q	L	L	G	.	.	.	.	.	Q	T	L	I	T	T	D	G	K	T	L	L	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.																									.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.																									.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	A	R	N	G	F	L	Q	L	G	V	E	V	Y	G	G	A	L	F	A	P	W	F	D	R	D	L	S	L	A	G	R	V	T	F	R	A	N	G	K	L	E	S	R	L	V	D	F	R	K	A	I	A	V	I	P	N	L	N	P	I	N	A	Q	N	E	L	P	P	I	I	A	Q	L	A	P	G	E	T	A
Template Known Secondary structure					T	T										S				S	T	T	S	B	S						S					T	T	T								S				B	B					S	S								S	T	T										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
																																	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	K	A	G	I	A	E	I	M	T	A	L	A	V	L	Q	Q	K	K	I	P	H	G	D	I	R	V	A	F	T	P	D	E	E	V	G	K	G	A	K	H	F	D	V	D	A	F	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.
Template Sequence		D	V	V	L	D	Y	E	L	S	F	Y	D	T	Q	S	A	A	V	V	G	L	N	D	E	F	I	A	G	A	R	L	D	N	L	L	S	C	H	A	G	L	E	A	L	.	.	.	.	L	N	A	E	G	D	E	N	C	I	L	V	C	T	D	H	E	E	V	G	S	C	S	H	C	G	A	D	G	P	F	L
Template Known Secondary structure					S		S			T	T							S						S	S	S	S	S				S	S		S	S	S	S	T	T	T	T	T	T	T	.	.	.	.	T	T	T	T	S		S	S	S								S		T	T	T	T						S	S			T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.					.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	W	A	Y	T	V	D	G	G	G	V	G	E	L	E	F	E	N	F	N	A	A	S	V	N	I	K	I	V	G	N	N	V	H	P	G	T	A	K	G	V	M	V	N	A	L	S	L	A	A	R	I	H	A	E	V	P	A	D	E	S	P	E	M	T	E	G	Y	E	G	F	Y	H	L	A	S	M	K	G
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation					.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Sequence		E	Q	V	.	.	.	L	R	R	L	L	P	E	G	D	A	F	S	R	A	I	Q	R	S	L	L	V	S	A	D	N	A	H	G	V	H	P	N	Y	A	D	R	H	D	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	P	A	L	N	G	G	P	V	I	K	I	N	S	N	Q	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	S	.	.	.			S	S	S	S	S	S	S	S	T	T	T	T	T	S	S														S	S		G	G	G			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S				B					S	S	S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template SS confidence
		281	.	.				.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.															.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	E	R	A	D	M	H	Y	I	I	R	D	F	D	R	K	Q	F	E	A	R	K	R	K	M	M	E	I	A	K	K	V	G	K	G	L	H	P	D	C	Y	I	E	L	V	I	E	D	S	Y	Y	N	M	R	E	K	V	V	E	H	P	H	I	L	D	I	A	Q	Q	A	M	R	D	C	D	I	E	P	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	A	T	N	S	E	T	A	G	F	F	R	H	L	C	Q	D	S	E	V	P	V	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S							G	G	G	T						T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																										341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		349	350	.					.	.	.	.	.	.	.	.	360	.			.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.											.	.
Query SS confidence					.	.	.	.											.	.
Query Sequence		L	K	P	.	.	.	.	I	R	G	G	T	D	G	A	Q	L	.	.	S	F	M	G	L	P	C	P	N	L	F	T	G	G	Y	N	Y	H	G	K	H	E	F	V	T	L	E	G	M	E	K	A	V	Q	V	I	V	R	I	A	E
Query Conservation					.	.	.	.											.	.
Alig confidence					.	.	.	.											.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	V	T	R	S	D	M	G	C	G	S	T	I	G	P	I	T	A	S	Q	V	G	V	R	T	V	D	I	G	L	P	T	F	A	M	H	S	I	R	E	L	A	G	S	H	D	L	A	H	L	V	K	V	L	G	A	F	Y	A
Template Known Secondary structure		B					S	S								S	T	T	T	G	G	G	S	S												S		S	S	S	S					S	S							T	T					T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.