Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 40 Aligned Residues 375 % Identity 19% Template d2fhfa5 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.65

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.
Query SS confidence																																																						.	.
Query Sequence		E	R	A	E	T	D	T	S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	.	.	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P
Query Conservation																																																						.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	M	P	H	A	Q	K	T	K	A	D	L	A	K	M	T	I	H	E	S	H	I	R	D	L	S	A	W	D	Q	T	V	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	R	G	K	Y	L	A	L	T	A	Q	E	S	N	M	V	Q	H	L	K	Q	L	S	A	S	G	V	T	H	I	E	L	L	P	V
Template Known Secondary structure					S	S			S	S						T													T	T		T	T	S		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T	S													T							S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.										.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	L	A	T	V	N	E	F	S	D	K	V	A	D	I	Q	Q	P	F	S	R	L	C	E	V	N	S	A	V	K	S	S	E	F	A	G	Y	C	D	S	G	S	T	V	E	E	V	L	T	Q	L	K	Q	N	D	S	K	D	N	P	Q	V	Q	A	L	N	T	L	V	A	Q	T	D	S	Y	N	W	G	Y
Template Known Secondary structure					S	S	S				G	G	G				T	T	S	B													T	S	T	T	G	G	G	T	T	S	S		B									S	T	T		B	T	T	B											T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.								290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	.	.	.	.	.	.	.	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	.	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.														.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	F	H	Y	T	V	P	E	G	S	Y	A	T	D	P	E	G	T	A	R	I	K	E	F	R	T	M	I	Q	A	I	K	Q	D	L	G	M	N	V	I	M	D	V	V	Y	N	H	T	N	A	A	G	P	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	S	V	L	D	K	I	V	P	W	Y
Template Known Secondary structure											S	T	T	S	S			S	T	T																T	S										T	T			S			S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.													.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Q	R	L	N	E	T	T	G	S	V	E	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	C	S	D	S	A	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	B		B		T	T	T			B			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S			B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	650
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	H	R	M	F	A	K	L	I	A	D	S	L	A	V	W	T	T	D	Y	K	I	D	G	F	R	F	D	L	M	L	Y	H	P	K	A	Q	I	L	S	A	W	E	R	I	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	P	D	I	Y	F	F	G	E	G	W	D	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S																										T	T	G	G	G	S	B													T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.															.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520							.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	.	.	.	.	.	.	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Q	S	D	R	F	E	I	A	S	Q	I	N	L	K	G	T	G	I	G	T	F	S	D	R	L	R	D	A	V	R	G	G	G	P	F	D	S	G	D	A	L	R	Q	N	Q	G	V	G	S	G	A	G	V	L	P	N	E	L	T	T	L	S	D	D	Q	A	R	H	L	A	D	L	T	R	L	G	M	A	G
Template Known Secondary structure		S		T	T	T	S		B			T	T	T	T	T	T	S	S															S		T	T			T	T								G	G	G	T	T	T	T	S			S	S																				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		711	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
																																552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	A	D	F	V	L	I	D	K	D	G	A	V	K	R	G	S	E	I	D	Y	N	G	A	P	G	G	Y	A	A	D	P	T	E	V	V	N	Y	V	S	K	H	D	N	Q	T	L	W	D	M	I	S	Y	K	A	A	Q	E	A	D	L	D	T	R	V	R	M	Q	A	V	S	L	A	T	V	M	L	G	Q
Template Known Secondary structure			B	T	T						T	T	S					G	G	G	S			T	T			S			B	S	S	G	G	G					S			S	S	S	S										S		T	T																			T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		791	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.									610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	630	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	S	V	A	H	W	Q
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	A	F	D	Q	Q	G	S	E	L	L	R	S	K	S	F	T	R	D	S	Y	D	S	G	D	W	F	N	R	V	D	Y	S	L	Q	D	N	N	Y	N	V	G	M	P	R	S	S	D	D	G	S	N	Y	D	I	I	A	R	V	K	D	A	V	A	T	P	G	E	T	E	L	K	Q	M	T	A	F	Y	Q
Template Known Secondary structure		S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T	S									T	T		S			S		S	S	S								G	G	G								T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		871	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	L	T	A	L	R	K	S	S	P	L	F	T	L	G
Template Known Secondary structure								T	S		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		951	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.