Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 95 Aligned Residues 353 % Identity 21% Template d2d3na2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.90

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		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.										.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	H	W	N	R	L	N	S	D	A	S	N	L	K	S	K	G	I	T	A	V	W	I	P	P	A	W	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	Q	N	D	V	G	Y	G	A	Y	D	L	Y	D	L	G	E	F	N	Q	K	G	T	V	R	T	K	Y	G	T	R	S	Q	L	Q	A
Template Known Secondary structure		S																	T										S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T			S		S				T	T		S	S		S		B	T	T	B	S	S	B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50														.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	T	S	L	K	N	N	G	I	Q	V	Y	G	D	V	V	M	N	H	K	G	G	A	D	A	T	E	.	.	.	.	.	.	M	V	R	A	V	E	V	N	P	N	N	R	N	Q	E	V	T	G	E	Y	T	I	E	A	W	T	R	F	D	F	P	G	R	G	N	T	H	S	S	F	K	W	R	W	Y	H
Template Known Secondary structure									T	T										S				S		S				.	.	.	.	.	.									T	T							S											B			T	T	T	T	T	S	S					B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.							.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	D	G	V	D	W	D	Q	S	R	R	L	N	N	R	I	Y	K	F	R	G	H	G	K	A	W	D	W	E	V	D	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	N	Y	D	Y	L	M	Y	A	D	I	D	M	D	H	P	E	V	V	N	E	L	R	N	W	G	V	W	Y	T	N	T	L	G	L	D
Template Known Secondary structure						S			T	T	T			S	S							S	T	T					S	S				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S						S	S					T	T																				T		S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.											.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.
Query Sequence		G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	.	.	.	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A
Query Conservation																																																														.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	R	I	D	A	V	K	H	I	K	Y	S	F	T	R	D	W	I	N	H	V	R	S	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	N	M	F	A	V	A	E	F	W	K	N	D	L	G	A	I	E	N	Y	L	Q	K	T	N	W	N	H	S	V	F	D	V	P	L	H	Y	N	L	Y
Template Known Secondary structure						T	T	G	G	G	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T												S												T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.														.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		533	.	.			.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.										.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure					.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	V	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P
Query Conservation					.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	A	S	K	S	G	G	N	Y	D	M	R	N	I	F	N	G	T	V	V	Q	R	H	P	S	H	A	V	T	F	V	D	N	H	D	S	Q	P	E	E	A	L	E	S	F	V	E	E	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	T	L	T	R	E	Q	G	Y	P	S	V	F	Y	G	D	Y	Y	G	I	P	T	H	G
Template Known Secondary structure						T	T	T		S		G	G	G	T	T	T	T							G	G	G					S			T	T	T	S	T	T	S	T	T						T	T	T										S	S	S	S	S												B	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		602	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	R	S	K	I	D	P	I	L	E	A	R	Q	K	Y
Template Known Secondary structure		B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		379	380	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.