Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 88 Aligned Residues 352 % Identity 16% Template d1r7aa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.77

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		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	K	V	Q	L	I	T	Y	A	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	D	G	T	I	K	S	M	T	D	I	L	R	T	R	F	D	G	V	Y	D	G	V	H	I	L	P	F	F	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S							S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S	S	S	S												S	T	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R
Query Conservation
Alig confidence		.																															.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																															.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	F	D	G	A	D	A	G	F	D	P	I	D	H	T	K	V	D	E	R	L	G	S	W	D	D	V	A	E	L	S	.	.	.	.	.	K	T	H	N	I	M	V	D	A	I	V	N	H	M	S	W	E	S	K	Q	F	Q	D	V	L	A	K	G	E	E	S	E	Y	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	S	S	S	S	S	T	T	S	S		S							T	T	T											.	.	.	.	.	T	T	S									S				T	T	S										G	G	G	S	T	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																															.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380		.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	.	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M
Query Conservation																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	F	L	T	M	S	S	V	F	P	N	G	A	T	E	E	D	L	A	G	I	Y	R	P	R	P	G	L	P	F	T	H	Y	K	F	A	G	K	T	R	L	V	W	V	S	F	T	P	Q	Q	V	D	I	D	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	B		B						T	T									T	S			S	S	S	S		S							T	T								S	S	S	T	T				B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.														.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	K	G	W	E	Y	L	M	S	I	F	D	Q	M	A	.	A	S	H	V	S	Y	I	R	L	D	A	V	G	Y	G	A	K	E	A	G	T	S	C	F	M	T	P	K	T	F	K	L	I	S	R	L	R	E	E	G	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S																.		T	T								T	G	G	G	S				T	T	S		S	S	S																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																								.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																								.
Template Sequence		.	.	.	R	G	L	E	I	L	I	E	V	H	S	Y	Y	K	K	Q	V	E	I	A	S	K	V	.	D	R	V	Y	D	F	A	L	P	P	L	L	L	H	A	L	S	T	G	H	V	E	P	V	A	H	W	T	D	I	R	P	N	N	A	V	T	V	L	D	T	H	D	G	I	G	V	I	D	I	G	S	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T									S										T	T	S	.	S						S																								S		S	S					S			S	S		B		S	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																								.
Template SS confidence
					225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
																			538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	D	R	S	L	K	G	L	V	P	D	E	D	V	D	N	L	V	N	T	I	H	A	N	T	H	G	E	S	Q	A	A	T	G	A	A	A	S	N	L	D	L	Y	Q	V	N	S	T	Y	Y	S	A	L	G	N	D	Q	H	Y	I	A	A	R	A	V	Q	F	F	L	P	G	V	P	Q	V	Y	Y	V	G
Template Known Secondary structure		S	S		T	T	S			S	S																T	T	T						S	G	G	G	S	B		S		S	S	S	B		S						T																S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.					.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.		.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.																				.
Query SS confidence												.	.	.	.																				.
Query Sequence		E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	.	.	.	.	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	.	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R
Query Conservation												.	.	.	.																				.
Alig confidence												.	.	.	.																				.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	A	G	K	N	D	M	E	L	L	R	K	T	N	N	G	R	D	I	N	R	H	Y	Y	S	T	A	E	I	D	E	N	L	K	R	P	V	V	K	A	L	N	A	L	A	K	F	R	N	E
Template Known Secondary structure			T	T													B	G	G	G	G	G				B									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.