Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 354 % Identity 25% Template d1lwha2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.60

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		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	G	Y	Q	I	Y	V	R	S	F	R	D	G	N	L	D	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	F	R	G	L	K	N	A	V	S	Y	L	K	E	L	G	I	D	F	V	W	L	M	P	V	F	S	S	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T							T	T		S											S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D
Query Conservation
Alig confidence		.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	S	F	H	G	Y	D	V	V	D	F	Y	S	F	K	A	E	Y	G	S	E	R	E	F	K	E	M	I	E	A	F	H	D	S	G	I	K	V	V	L	D	L	P	I	H	H	T	G	F	L	H	T	W	F	Q	K	A	L	K	G	D	P	H	Y	R	D	Y	Y	V	W	A	N	K	E	T	D	L	D	E	R
Template Known Secondary structure		.	S	S	S			S		S							G	G	G																T	T									T	T	B			T	T	S								T	T						T	T	B		B			T	T			T	T		B
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	E	W	D	G	E	K	I	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	L	E	D	G	R	F	Y	R	G	L	F	G	P	F	S	P	D	L	N	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S			B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S						T	T		T	T	S		B	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	N	P	Q	V	F	D	E	M	K	R	L	V	L	H	L	L	.	D	M	G	V	D	G	F	R	F	D	A	A	K	H	M	R	D	T	I	E	Q	N	V	R	F	W	K	Y	F	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	L	K	G	I	F	L	A	E	I	W	A	E	A	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S																.			T							T	T	G	G	G	S	S	S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			S								S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.														.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.			.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.									570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	.	.	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	G	D	K	A	A	E	L
Query Conservation																														.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																							.	.												.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.																																				.
Template Sequence		M	V	D	E	H	.	G	R	I	F	G	Y	M	L	N	F	D	T	S	H	C	I	K	E	A	V	W	K	E	N	T	R	V	L	I	E	S	I	E	R	A	.	V	I	A	K	D	Y	L	P	V	N	F	T	S	N	H	D	M	S	R	L	A	S	F	E	G	G	F	S	K	E	K	I	K	L	S	I	S	I
Template Known Secondary structure		S					.																							T		T											.	T	S	S		S	S						S			T	T	S			G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure							.																																				.
Template SS confidence
		223	.	.	.	.		.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.		.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.
Template Sequence		L	F	T	L	P	G	V	P	L	V	F	Y	G	D	E	L	G	M	K	G	V	Y	Q	K	P	N	.	T	E	V	V	L	D	P	F	P	W	N	E	S	M	C	V	E	G	Q	T	F	W	K	W	P	A	Y	N	G	P	F	S	G	I	S	V	E	Y	Q	K	R	D	P	D	S	I	L	S	H	T	L	G	W
Template Known Secondary structure			T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S		.	G	G	G	G	S					S	S	T	T	S		S	T	T				S	S			S	S			S	S	S	S		S					T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																												.
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.		.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		634	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	R	F	R	K	E	N	Q	W	I	D	R
Template Known Secondary structure							T		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.