Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 371 % Identity 27% Template d1ji1a3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.60

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		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	T	S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	K	T	P	D	W	L	K	N	G	V	M	Y	Q	I	F	P	D	R	F	Y	N	G	D	S	S	N	D	V	Q	T	G	S	Y	T	Y	N	G	T	P	T	E	K	K	A	W	G	S	S	V	Y	A	D	P	G	Y	D	N	S	L	V	F	F	G	G	D	L	A	G	I	D	Q	K	L	G	Y	I	K	K
Template Known Secondary structure																			G	G	G	T			S		G	G	G				T	T	S				T	T								T	T	S			S			T	T	S		G	G	G													T						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
			241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.					.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																																.	.	.	.
Query SS confidence		.																																																																.	.	.	.
Query Sequence		.	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	.	.	.	.	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H
Query Conservation		.																																																																.	.	.	.
Alig confidence		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	G	A	N	I	L	Y	L	N	P	I	F	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	H	K	Y	D	T	Q	D	Y	M	A	V	D	P	A	F	G	D	N	S	T	L	Q	T	L	I	N	D	I	H	S	T	A	N	G	P	K	G	Y	L	I	L	D	G	V	F	N	H
Template Known Secondary structure		T	T								S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S			S		S							T	T	T																S	S	S	S	S											S	B
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.																.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	D	S	H	P	W	F	D	K	Y	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	S	Q	G	A	Y	E	S	Q	S	S	P	W	Y	N	Y	Y	T	F	Y	T	W	P	D	S	Y	A	S	F	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S	T	T	T		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S			T	T	T		T	T		T	T	G	G	G	B					T	T	T						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.						.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.																						.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.																						.	.	.
Query Sequence		D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	.	.	.	.	.	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	F	N	S	L	P	K	L	N	Y	G	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	A	V	R	G	V	I	Y	N	N	S	N	S	V	A	K	T	Y	L	N	P	P	Y	S	V	D	G	W	R	L	D	A	A	Q	Y	V	D	A	N	G	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.						B	B	B			S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								T	T	S	T	T	S							S	T	T	T								T	T	G	G	G		B	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
										468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																					.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																					.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																					.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.																			.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		N	G	S	D	V	T	N	H	Q	I	W	S	E	F	R	N	A	V	K	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	N	A	A	I	I	G	E	Y	W	G	N	A	N	P	W	T	A	Q	G	N	.	Q	W	D	A	A	T	N	F	D	G	F	T	Q	P	V	S	E	W	I	T	G	K
Template Known Secondary structure				S	S																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T								S	S			G	G	G	T	T	T	S	S	.	S		S			B		T	T	T	T									T	S	B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.															.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
													536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	Q	N	N	S	A	S	I	S	T	T	Q	F	D	S	W	L	R	G	T	R	A	N	Y	P	T	N	V	Q	Q	S	M	M	N	F	L	S	N	H	D	I	T	R	F	A	T	R	S	G	G	D	L	W	K	T	Y	L	A	L	I	F	Q	M	T	Y	V	G	T	P	T	I	Y	Y	G	D	E	Y	G	M
Template Known Secondary structure			T	T	S		B																	T	T	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
		598	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.									.
Template Conservation										.	.	.	.	.									.
Template Sequence		Q	G	G	A	D	P	D	N	.	.	.	.	.	R	R	S	F	D	W	S	Q	.	A	T	P	S	N	S	A	V	A	L	T	Q	K	L	I	T	I	R	N	Q	Y	P	A	L	R	T	G
Template Known Secondary structure					S	T	T	G	G	.	.	.	.	.	G					T	T	S	.	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		512	.	.	.	.	.	.	.						520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.