Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 100 Aligned Residues 349 % Identity 20% Template d1hx0a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.38

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		227	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		D	L	R	G	L	T	N	K	L	.	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I
Query Conservation											.
Alig confidence											.																													.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.										.
Template Sequence		R	W	V	D	I	A	L	E	C	E	R	Y	L	G	P	K	G	F	G	G	V	Q	V	S	P	P	N	E	N	I	V	V	T	N	P	S	R	P	.	.	.	.	.	.	.	W	W	E	R	Y	Q	P	V	S	.	Y	K	L	C	T	R	S	G	N	E	N	E	F	R	D	M	V	T	R	C	N	N	V	G	V
Template Known Secondary structure													T	T	T	T	T	T										S		B	B			T	T	T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	S	B	S		.	S		S		B	T	T	B															T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.										.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.								.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	C	G	S	G	A	A	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	T	T	C	G	S	Y	C	N	P	G	N	R	E	F	P	A	V	P	Y	S	A	W	D	F	N	D	G	K	C	K	T	A	S	G	G	I	E	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S					T	T				B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B	S	S				B	B	G	G	G	T	B	B	T	T	T	T	B		G	G	G	B		T	T	T			S	T	T	S	B				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110												.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	N	D	P	Y	Q	V	R	D	C	Q	L	V	G	L	L	D	L	A	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	Y	V	R	S	M	I	A	D	Y	L	N	K	L	I	.	D	I	G	V	A	G	F	R	I	D	A	S	K	H	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	T								S	B	G	G	G				B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																.			T							T	T	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
							152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.		.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.					540
Predicted Secondary structure																																										.																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																										.																																			.	.	.	.
Query Sequence		E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	.	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	L	A	.	.	.	.	Q
Query Conservation																																										.																																			.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.																						.																																			.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	P	G	D	I	K	A	V	L	D	K	L	.	.	.	.	.	.	.	H	N	L	N	T	N	W	F	P	A	G	S	R	P	F	I	F	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	A	I	K	S	S	E	Y	F	G	N	G	R	V	T	E	F	K	Y	G	A	K	L	G	T	V	V	R	K	W	S	G	E	K	M	S
Template Known Secondary structure											T	T		.	.	.	.	.	.	.					T	T	T	S		T	T													S	S	S	S	S		G	G	G	G	T	T	T	S																T	T		T	T			G	G
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.								.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.														570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.		.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	.	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	K	N	W	G	E	G	W	G	F	M	P	S	D	R	A	L	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	G	H	G	A	G	G	S	S	I	L	T	F	W	D	A	R	L	Y	K	I	A	V	G	F	M	L	A	H	P	Y	G	F	T	R	V	M	S	S	Y	R	W	A	R	N	F	V	N	G	E	D	V	N
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	T	T	G	G	G	T				G	G	G					S			T	T	G	G	G	T		S	S		G	G	G				G	G	G														S		S	S								B								T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.						.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.
Query Sequence		G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	.	.	.	.	.	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R
Query Conservation																													.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	W	I	G	P	P	N	N	N	G	V	I	K	E	V	T	I	N	A	D	T	T	C	G	N	D	W	V	C	E	H	R	W	R	E	I	R	N	M	V	W	F	R	N	V
Template Known Secondary structure		T	T			S	S			T	T							B		T	T	S		B		T	T	B			G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400