Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 366 % Identity 28% Template d1gvia3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 3.3

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		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		D	T	S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	.	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G
Query Conservation																																						.
Alig confidence																																						.																																										.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		L	F	Q	A	P	D	W	V	K	D	T	V	W	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	N	P	A	I	S	P	K	G	A	R	P	W	G	S	E	D	P	T	P	T	S	F	F	G	G	D	L	Q	G	I	I	D	H	L	D	Y	L	A	D	L	G	I	T	G	I	Y	L	T	P	I	F	R	A	P	.	.
Template Known Secondary structure							G	G	G	G	T								G	G	G	T				S					S	S			S				S	S				S	S													T								T										B	S		S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	H	K	Y	D	T	A	D	Y	F	E	I	D	P	H	F	G	D	K	E	T	L	K	T	L	V	K	R	C	H	E	K	G	I	R	V	M	L	D	A	V	F	N	H	C	G	Y	E	F	A	P	F	Q	D	V	L	K	N	G	A	A	S	R	Y	K	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	T	T	S		S		T	T	S	B		T	T	T																	T										S	B			T	T											G	G	G		T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	F	H	I	R	E	F	P	L	Q	T	E	P	R	P	N	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	A	F	V	P	H	M	P	K	L	N	T	A	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	B		B	S	S	S	S				S	S	S		S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S	S	S		T	T	S	B	B	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	E	V	K	R	Y	L	L	D	V	A	T	Y	W	I	R	E	F	D	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	I	D	H	Q	F	W	R	E	F	R	Q	A	V	K	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																		S								T	T	G	G	G	S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.															.	350	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.								.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.
Template Sequence		V	Y	I	L	G	L	I	W	H	D	A	M	P	.	.	W	L	R	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	L	A	D	A	A	L	R	F	F	A	K	E	D	M	S	A	S	E	F	A	D	R	L	M	H	V	L	H	S	Y	P	K	Q	V	N	E	A	A	F	N	L	L	G	S	H	D	T	P	R	L	L
Template Known Secondary structure									S	S			T	T	.	.	T	T	T	T	T	S		S			B													T	S			S														T	T	S							T		B		B	S			S	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.			.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		571								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.									.
Template Sequence		T	V	C	G	G	D	V	R	K	V	K	L	L	F	L	F	Q	L	T	F	T	G	S	P	C	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	T	G	G	N	D	P	E	C	.	.	.	.	.	R	K	C	M	V	W	D	P	.	E	K	Q	N	K	E	L	Y	E	H	V	K	Q	L	I	A	L	R	K	Q	Y	R	A	L
Template Known Secondary structure					T	T														T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	T	G	G	.	.	.	.	.	G							T	.	T	T	S																	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.						.	.	.	.	.	.	.	.		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
		644	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	R
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		504	.