Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 36 Aligned Residues 367 % Identity 29% Template d1ea9c3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 3.2

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.
Query SS confidence																																					.
Query Sequence		T	S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	.	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W
Query Conservation																																					.
Alig confidence																																					.																																										.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		F	Q	P	P	A	W	V	K	D	A	I	F	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	T	R	N	D	P	E	G	T	L	P	W	G	S	A	D	P	T	P	S	C	F	F	G	G	D	L	Q	G	V	I	D	H	L	D	H	L	S	K	L	G	V	N	A	V	Y	F	T	P	L	F	K	A	T	.	.	.
Template Known Secondary structure						T												S	T	T	S					S		S		S	S			S				S	S	S				S	S												T								T		S								S	S		S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	H	K	Y	D	T	E	D	Y	F	Q	I	D	P	Q	F	G	D	K	D	T	L	K	K	L	V	D	L	C	H	E	R	G	I	R	V	L	L	D	A	V	F	N	H	S	G	R	T	F	P	P	F	V	D	V	L	K	N	G	E	K	S	K	Y	K	D	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	T	T	S		S		T	T				T	T	T														T	T	T	T										S	B			T	T	T								T	T	T	T	T		T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	H	I	R	S	L	P	L	E	V	V	D	G	I	P	T	Y	D	T	F	A	F	E	P	L	M	P	K	L	N	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B		S	S	S				T	T	S			S	B		B	S	S	S		T	T	S	B	B			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																										267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	D	V	K	E	Y	L	L	K	A	A	E	Y	W	I	R	E	T	G	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	V	S	H	Q	F	W	R	E	F	R	R	V	V	K	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																					S					T	T		T	T	S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.															.	.	.	.
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.								.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.
Template Sequence		Y	I	L	G	E	V	W	H	E	S	S	I	W	L	E	.	.	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	F	T	N	A	V	L	D	F	F	I	H	Q	I	A	D	A	E	K	F	S	F	M	L	G	K	Q	L	A	G	Y	P	R	Q	A	S	E	V	M	F	N	L	L	D	S	H	D	T	A	R	L	L	T
Template Known Secondary structure									S			T	T	T	T	T	.	.	T	T	S		S			B												T	T	S			S												T	T	T	T	S							T					S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.			.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
									572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.									.
Template Sequence		Q	A	D	G	D	K	R	K	M	K	L	A	V	L	F	Q	F	T	Y	F	G	T	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	G	H	D	P	G	C	.	.	.	.	.	R	K	C	M	E	W	D	E	.	T	K	H	D	K	D	L	F	A	F	Y	Q	T	V	I	R	L	R	Q	A	H	A	A	L	R
Template Known Secondary structure					S													T	T	S	S	S						S	S		S	S						S					.	.	.	.	.	T							T	.	T	S																				S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.						.	470	.	.	.	.	.	.		.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
		645	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	G
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		502	.