Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 42 Aligned Residues 394 % Identity 15% Template c3zt5D_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:putative glucanohydrolase pep1a; PDBTitle: glge isoform 1 from streptomyces coelicolor with maltose2 bound Resolution 2.09 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.
Template Sequence		P	L	R	D	L	V	T	S	S	D	P	L	P	L	L	V	E	R	E	R	A	L	Y	G	A	W	Y	E	F	F	P	R	S	E	G	T	P	H	T	P	H	.	.	.	.	G	T	F	R	T	A	A	R	R	L	P	A	I	A	A	M	G	F	D	V	V	Y	L	P	P	I	H	P	I	G	T	T	H	R	K
Template Known Secondary structure																																G	G	G	S			S	S			S	.	.	.	.							G	G	G							T	T										S		B			T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.					230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		261	.	.							.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	T	.	.	.	.	.	.	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L
Query Conservation					.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																																																							.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		G	R	N	N	T	L	S	A	T	G	D	D	V	G	V	P	W	A	I	G	S	P	E	G	G	H	D	S	I	H	P	A	L	G	T	L	D	D	F	D	H	F	V	T	E	A	G	K	L	G	L	E	I	A	L	D	F	A	L	Q	C	S	P	.	D	H	P	W	V	H	K	H	P	E	W	F	H	H	R	P
Template Known Secondary structure		B	G	G	G	B	S	S			T	T					T	T	S	B		B	T	T	B		T	T	S			G	G	G																T	T													T	.	T	S							G	G	G	S				T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	T	I	A	H	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	P	K	K	Y	Q	D	I	Y	P	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T				T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	A	D	P	D	G	L	A	T	E	T	V	R	I	L	R	H	W	M	.	D	H	G	V	R	I	F	R	V	D	N	P	H	T	K	P	V	A	F	W	E	R	V	I	A	D	I	N	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S																		.	T	T	T							S		G	G	G	S																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	D	V	I	F	L	A	E	A	F	T	R	P	A	M	M	A	T	L	A	Q	I	G	F	Q	Q	S	Y	T	Y	F	T	W	R	N	T	K	Q	E	L	.	.	.	.	.	T	E	Y	L	T	E	L	S	G	E	A	A	S	Y	M	R	P	N	F	F	A	N	T	P	D	I	L	H	A	Y	L	Q	H	G
Template Known Secondary structure			T	T									S												T		S					S	G	G	G			S					.	.	.	.	.									T	G	G	G	G	T							S		B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.						.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.						.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	E	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	.	.	.	.	.	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I
Query Conservation		.	.																																			.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	R	P	A	F	E	V	R	A	V	L	A	A	T	L	S	P	T	W	G	I	Y	S	G	Y	E	L	C	E	N	T	P	L	R	E	G	S	E	E	Y	L	D	S	E	K	Y	Q	L	K	P	R	D	W	T	R	A	A	R	E	G	T	T	I	A	P	L	V	T	R	L	N	T	I	R	R	E	N	P	A	L
Template Known Secondary structure																		S						T	T	T	T	T	T				B	S	S	T	T			S	B	T	T		T	T	S	S													T																		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		644	.	.	.		.	.	650	.	.	.	.	.			.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure						.									.	.
Query SS confidence						.									.	.
Query Sequence		G	A	G	K	.	Q	T	T	L	L	L	K	Q	.	.	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation						.									.	.
Alig confidence						.									.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	Q	L	R	D	L	H	F	H	P	T	D	K	E	E	V	I	A	Y	S	K	R	Q	G	S	N	T	V	L	V	V	V	N
Template Known Secondary structure		G		S	S							B	S		T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.