Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 521 % Identity 18% Template c3k1dA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:1,4-alpha-glucan-branching enzyme; PDBTitle: crystal structure of glycogen branching enzyme synonym: 1,4-alpha-d-2 glucan:1,4-alpha-d-glucan 6-glucosyl-transferase from mycobacterium3 tuberculosis h37rv Resolution 2.33 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.		.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.		.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure																													.													.
Query SS confidence																													.													.
Query Sequence		A	V	A	A	S	W	T	S	P	G	F	P	A	F	S	E	Q	G	T	G	T	F	V	S	H	A	Q	.	L	P	K	G	T	R	P	L	T	L	N	F	.	D	Q	Q	C	W	Q	P	A	D	A	I	K	L	N	Q	M	L	S	L	Q	P	C	S	N	T	P	P	Q	W	R	L	F	R	D	G	E	Y	T	L
Query Conservation																													.													.
Alig confidence																			.										.													.
Template Conservation																			.
Template Sequence		E	V	V	A	L	V	G	K	D	R	F	S	L	Q	H	L	D	.	S	G	L	F	A	V	A	L	P	F	V	D	L	I	D	Y	R	L	Q	V	T	Y	E	G	C	E	P	H	T	V	A	D	A	Y	R	F	L	P	T	L	G	E	V	D	L	H	L	F	A	E	G	R	H	E	R	L	W	E	V	L	G	A
Template Known Secondary structure		B					B	T	T	B								T	.	T	S							S		S										B		T	T	S								G	G	G	S			S	S										T	T			T	T	G	G	G	T	S
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70		.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		93	.					.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.							.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	I	.	.	.	.	D	T	R	S	G	T	P	T	L	M	I	S	I	Q	N	A	A	E	P	V	A	S	L	V	R	E	C	P	K	W	D	G	L	P	L	T	V	.	.	.	.	.	.	D	V	S	A	T	F	P	E	G	A	A	V	R	D	Y	Y	S	Q	Q	I	A	I	V	K	N	G	Q	I	M	L	Q
Query Conservation				.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	P	R	S	F	T	T	A	D	G	V	V	S	G	V	S	F	A	V	W	A	P	N	A	K	G	V	S	L	I	G	E	F	N	G	W	N	G	H	E	A	P	M	R	V	L	G	P	S	G	V	W	E	L	F	W	P	D	F	P	C	D	G	L	Y	K	F	R	V	H	G	A	D	G	V	V	T	D	R	A
Template Known Secondary structure									S	S	S												T	T		S							G	G	G	T	T				S		B					G	G	G									T			T	T										T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	A	T	S	N	G	L	L	L	L	E	R	A	E	T	D	T	S	A	P	F	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	P	F	A	F	G	T	E	V	P	P	Q	T	A	S	R	V	T	S	S	D	Y	T	W	G	D	D	D	W	M	A	G	R	A	L	R	N	P	V	N	E	A	M	S	T	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	L
Template Known Secondary structure			T	T		S	S	B			T	T														S									T	T			G	G	G	S									T	T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
		227	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		D	L	R	G	L	T	N	K	L	.	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I
Query Conservation											.
Alig confidence											.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Y	R	Q	L	A	R	E	L	T	D	Y	I	V	D	Q	G	F	T	H	V	E	L	L	P	V	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	F	A	G	S	W	G	Y	Q	V	T	S	Y	Y	A	P	T	S	R	F	G	T	P	D	D	F	R	A	L	V	D	A	L	H	Q	A	G	I
Template Known Secondary structure																		T		S					S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		G	G	G	T	T		S		S							G	G	G																T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.														.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	I	V	D	W	V	P	A	H	F	P	K	D	A	W	A	L	G	R	F	D	G	T	P	L	Y	E	H	S	D	P	K	R	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T						T	T	T	T	T	T	T	T	S	S			S	B						S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	D	W	G	T	Y	V	F	D	F	G	R	P	E	V	R	N	F	L	V	A	N	A	L	Y	W	L	Q	E	F	H	I	D	G	L	R	V	D	A	V	A	S	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T							B		T	T	S																		S										T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																						373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
		466																									.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.				.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.
Query Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	.	.	.	G
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	L	D	Y	S	R	P	E	G	G	W	T	P	N	V	H	G	G	R	E	N	L	E	A	V	Q	F	L	Q	E	M	N	A	T	A	H	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	G	I	V	T	I	A	E	E	S	T	P	W	S	G	V	T	R	P	T	N	I	G	G	L	G
Template Known Secondary structure			B							S	S			S				S	S		S	B																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T									S	S				T	T	S		G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.															.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.				.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	.	.	.	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	F	R	E	G	G	D	K	A	A	E	L
Query Conservation																					.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	M	K	W	N	M	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	V	S	R	D	P	V	Y	R	S	Y	H	H	H	E	M	T	F	S	M	L	Y	A	F	S	E	N	Y	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	G	T	L	W	G	R	M	P	G	N	N	H	V	K	A	A	G	L	R	S	L	L	A	Y
Template Known Secondary structure			S																	S		G	G	G	G	G	G	G						G	G	G	G	T	T	T	S	S								G	G	G	S	S	T	T	S							S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.			620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	.	.	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T
Query Conservation																																										.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.										.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	W	A	H	P	G	K	Q	L	L	F	M	G	Q	E	F	G	Q	R	A	E	W	S	E	.	.	.	.	.	.	.	Q	R	G	L	D	W	F	Q	L	D	E	N	G	F	S	N	G	I	Q	R	L	V	R	D	I	N	D	I	Y	R	C	H	P	A	L	W	S	L	D	T	T	P	E	G	Y	S	W	I	D
Template Known Secondary structure					S	S	S						T	T	G	G	G	T			S				T	.	.	.	.	.	.	.	T	T				G	G	G	G	G	S	S	S	S																			G	G	G	T	T	T	T	T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.								.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
		650	.	.	.	.	.		.	.	.	.	660	.	.	.		.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure								.									.
Query SS confidence								.									.
Query Sequence		T	L	L	L	K	Q	.	G	Y	G	F	V	R	E	H	.	G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation								.									.
Alig confidence								.									.
Template Conservation
Template Sequence		A	N	D	S	A	N	N	V	L	S	F	M	R	Y	G	S	D	G	S	V	L	A	C	V	F	N
Template Known Secondary structure					T	T	T	T									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.