Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 103 Aligned Residues 389 % Identity 19% Template c3hjeA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:704aa long hypothetical glycosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of sulfolobus tokodaii hypothetical2 maltooligosyl trehalose synthase Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	P	M	K	F	S	E	I	R	N	R	L	D	Y	F	V	E	L	G	V	T	H	L	Y	L	S	P	V	L	K	A	R	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	H	G	Y	D	V	V	D	Y	N	T	I	N	D	E	L	G	G	E	E	E	Y	I	R	L	I	D	E	A	K	S	K
Template Known Secondary structure			S								T	T								T		S											S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S		S									G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.														.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.
Template Sequence		G	L	G	I	I	Q	D	I	V	P	N	H	M	A	V	H	H	.	.	.	.	T	N	W	R	L	M	D	V	L	K	K	G	R	H	S	R	Y	Y	N	Y	F	D	F	Y	E	E	E	E	K	I	R	I	P	I	L	G	D	R	N	F	K	I	T	Y	V	N	D	E	P	Y	L	D	Y	Y	G	N	L	F	P
Template Known Secondary structure		T										S					S	T	.	.	.	.	T											G	G	G	S	G	G	G	G	G	B		B		T	T		S	S							S	S									T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.					.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.									.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	I	G	D	Y	D	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.											.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template Conservation																													.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template Sequence		I	N	D	E	G	R	N	Y	L	N	D	I	E	K	L	L	K	V	Q	Y	Y	E	L	V	D	W	R	.	.	D	Y	P	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	F	F	A	V	N	E	L	I	A	V	R	Q	E	L	E	W	V	F	E	D	S	H	S	.	.	.	.	K	I	L	S	F	E	V	D
Template Known Secondary structure				T	T	G	G	G		T	T								T	S	S						T	T	.	.	S			S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T							B		T	T	S									T	.	.	.	.	T	G	G	G	S			S
Template Predicted Secondary structure																													.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.			180	.	.	.	.										.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.					210	.	.	.	.	.	.	.
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.			.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.
Query SS confidence												.	.
Query Sequence		G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	.	.	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K
Query Conservation												.	.
Alig confidence												.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Sequence		G	Y	R	I	D	H	I	D	G	L	F	K	P	E	E	Y	L	R	R	L	K	N	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	K	H	I	F	V	E	K	I	L	S	I	G	E	K	L	R	W	D	F	.	.	I	D	G	T	T	G	Y	D	F	L	N	Y	S	N	L
Template Known Secondary structure						T	T	G	G	G		S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											T	T				S		T	T	.	.	S				S	S									T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.			.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		534	.		.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	F	T	D	N	E	D	K	M	T	E	I	Y	K	N	I	L	D	I	D	L	D	E	L	V	K	E	T	K	K	K	I	I	D	T	L	F	K	H	D	I	E	R	I	S	M	M	L	G	V	N	Y	E	E	I	K	E	F	L	S	C	L	K	V	Y	R	T	Y	I	T	E	N	D	F	R	D	E	E	I	I
Template Known Secondary structure		T	S													T	T																					S												T	S														S	S					B	T	T	B		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
																																																																					549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	C	S	Q	K	V	Y	E	S	M	K	K	N	V	T	A	F	M	K	L	Q	Q	Y	M	P	A	V	F	A	K	A	Y	E	D	T	V	L	F	I	Y	N	R	L	I	S	L	N	E	V	G	S	D	L	H	Y	Y	S	I	S	C	D	K	F	H	E	F	N	L	K	R	V	G	T	L	S	F	N	A	T
Template Known Secondary structure																								T	T									T	T	T	T	G	G	G	T			S		G	G	G		S	T	T			T	T		S													T	T	T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		562	.	.	.	.																																																												.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	S	H	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	L	F	R	E	G	G	D	K	A	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	T	H	D	T	K	F	S	E	D	V	R	M	R	I	S	A	I	S	E	I	P	D	E	W	A	K	K	V	N	E	W	H	N	I	L	N	P	N	I	D	K	N	D	E	Y	R	L	Y	Q	T	I	V	G	S	F	D	G	F	N	N	E	Y	K	E	R	L	K	A	H	M	I	K	A	L	R	E	A	K	V
Template Known Secondary structure				T	T		S	S												T	T	S																			S																			S	S																			T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
																																																				577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		H	T	D	W	V	N	V	N	T	E	Y	E	K	K	M	T	Y	L	I	D	K	M	F	N	N	E	K	F	M	E	S	F	L	E	F	E	S	K	I	D	K	M	G	K	V	K	S	L	S	L	V	A	L	K	I	T	S	P	G	V	A	D	F	Y	Q	G	L	E	N	F	R	Y	L	L	T	D	P	D	N	.
Template Known Secondary structure		S			S	S	S																	T	T																																	S	S	S						T	T	T	T	S						S	T	T	G	G	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.									.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.		.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.		.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.																			.													.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.																			.													.
Query Sequence		L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	.	G	A	G	K	Q	T	T	L	L	L	K	Q	.	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	V	L	V	V
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.																			.													.
Alig confidence		.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.																			.													.							.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																														.	.
Template Sequence		.	.	.	.	R	R	P	V	V	F	S	E	L	P	K	R	Y	E	E	G	L	F	N	N	G	R	I	K	A	Y	V	T	K	V	L	L	N	L	R	K	S	M	K	D	F	F	I	N	S	E	Y	K	P	L	K	L	Q	K	G	L	C	G	F	M	R	.	.	G	D	K	V	L	V	I	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	G	S										S			G	G	G	T	T	T	S	T																T	T	T					S									T	T							.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																														.	.
Template SS confidence
						597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.			.	.	660	.	.	.	.	.