Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 475 % Identity 19% Template c3faxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:reticulocyte binding protein; PDBTitle: the crystal structure of gbs pullulanase sap in complex with2 maltotetraose Resolution 2.40 Å

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		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.									.	.	.	.	.	.	.	.				140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query Sequence		D	G	E	Y	T	L	Q	I	D	T	R	S	G	T	P	T	L	M	I	S	I	Q	N	A	A	E	P	V	A	S	L	V	R	E	C	P	K	W	D	G	L	P	L	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	S	A	T	F	P	E	.	.	.	G	A	A	V	R	D	Y	Y	S	Q	Q	I	A	I	V	K
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Alig confidence														.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation														.	.
Template Sequence		S	G	N	L	G	A	V	L	N	Q	D	G	.	.	S	K	V	E	A	S	L	W	S	P	S	A	D	S	V	T	M	I	I	Y	D	K	D	N	Q	N	R	V	V	A	T	T	P	L	V	K	N	N	K	G	V	W	Q	T	I	L	D	T	K	L	G	I	K	N	Y	T	G	Y	Y	Y	L	Y	E	I	K	R
Template Known Secondary structure			S								T	T	S	.	.	S									T	T		S									T	T															T	T	S								G	G	G	T		S			T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.			.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	Q	I	M	L	Q	P	A	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	G	L	L	L	L	E	R	A	E	T	D	T	S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		G	D	K	V	K	I	L	D	P	Y	A	K	S	L	A	E	W	D	S	N	T	V	N	D	D	I	K	T	A	K	A	A	F	V	N	P	S	Q	L	G	P	Q	N	L	S	F	A	K	I	A	N	F	K	G	R	Q	D	A	V	I	Y	E	A	H	V	R	D	F	T	S	D	Q	S	L	D	G	K	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T		S		B				B	G	G	G			S	S			S								G	G	G	S	S		T	T							T	T			S	G	G	G															G	G	G				.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.					260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.
Query Sequence		R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	.	.	.	.	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M
Query Conservation																																																		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	L	G	T	F	A	A	F	S	E	K	L	D	Y	L	Q	K	L	G	V	T	H	I	Q	L	L	P	V	L	S	Y	F	Y	V	N	E	M	D	K	S	R	S	T	A	Y	T	S	S	D	N	N	Y	N	W	G	Y	D	P	Q	S	Y	F	A	L	S	G	M	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S							T								T		S					S			B		B	S	S		B	T	T							S			S	S	S		S				S		S	B	S		S	S	S	B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
		288	.									290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	K	P	K	D	P	S	A	R	I	A	E	L	K	Q	L	I	H	D	I	H	K	R	G	M	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	T	A	K	T	Y	L	F	E	D	I	E	P	N	Y	Y	H	F	M	N	E	D	G	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S		T	T	S																		T	T										S			S		T					T	T	S	T	T	T	S	B		B		T	T	S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		704	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	S	F	G	G	G	R	L	G	T	T	H	A	M	S	R	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B	S	S	S	S	B		B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																764	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	V
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	V	D	S	I	K	Y	L	T	S	E	F	K	V	D	G	F	R	F	D	M	M	G	D	H	D	A	A	A	I	E	L	A	Y	K	E	A	K	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	N	M	I	M	I	G	E	G	W	R	T	F	Q	G	D	Q	G	K	P	V	K	P	A
Template Known Secondary structure														S								T	T	G	G	G	S	B															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T									S					B	T	T	B				B	S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		782	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.															.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Query Sequence		M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Q	D	W	M	K	S	T	D	T	V	G	V	F	S	D	D	I	R	N	S	L	K	S	G	F	P	N	E	G	T	P	A	F	I	T	G	G	P	Q	S	L	Q	G	I	F	K	N	I	K	A	Q	P	G	N	F	E	A	D	S	P	G	D	V	V	Q	Y	I	A	A	H	D	N	L	T	L	H	D	V	I
Template Known Secondary structure		S	G	G	G	G	G	G		S	S																T	T	S	T	T				T	T	T	T													T	T			T	T	S			S	S	G	G	G					S			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		848	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.
																	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	K	S	I	N	K	D	P	K	V	A	E	E	D	I	H	R	R	L	R	L	G	N	V	M	I	L	T	S	Q	G	T	A	F	I	H	S	G	Q	E	Y	G	R	T	K	R	L	L	N	P	D	Y	M	T	K	V	S	D	K	L	P	N	K	A	T	L	I	E	A	V	K	E	Y	P	Y	F	I	H	D	S
Template Known Secondary structure						T			T	T	T	T																	T	S	S	S						T	T	T	T	T	T				B				G	G	G	S	S								T	T					S	S			S	S					S		G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		928	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.
					608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620						.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.														.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.														.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	.	.	.	.	.	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	Q	T	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	K	Q	G	Y	G	F	V	R	E	H
Query Conservation		.	.	.														.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.														.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	S	S	D	A	I	N	H	F	D	W	A	A	A	T	D	N	N	K	H	P	I	S	T	K	T	Q	A	Y	T	A	G	L	I	T	L	R	R	S	T	D	A	F	R	K	L	S	K	A	E	I	D	R	E	V	S	L	I	T	E	V	G	Q	G	D	I	K	E	K	D	L	V	I	A	Y	Q	T	I	D
Template Known Secondary structure		G	G																T	T	T																				T		T	T	S	S														S	S		T	T	S	T	T			S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1009	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.
		664	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	G	D	I	Y	A	V	F	V	N
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1089	1090	.	.	.	.	.	.	.	.