Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 385 % Identity 26% Template c2z1kA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:(neo)pullulanase; PDBTitle: crystal structure of ttha1563 from thermus thermophilus hb8 Resolution 2.30 Å

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		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.				.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	.	.	.	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence																															.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		A	W	Y	E	G	A	F	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	F	R	A	G	P	P	G	R	P	A	P	A	G	P	F	E	P	W	E	A	P	P	T	L	R	G	F	K	G	G	T	L	W	G	V	A	E	K	L	P	Y	L	L	D	L	G	V	E	A	I	Y	L	N	P	V	F	A	S	T	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	S	S								G	G	G	S				S				S	S				S					T	T	S				S	S													T								T													S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	H	R	Y	H	T	V	D	Y	F	Q	V	D	P	I	L	G	G	N	E	A	L	R	H	L	L	E	V	A	H	A	H	G	V	R	V	I	L	D	G	V	F	N	H	T	G	R	G	F	F	A	F	Q	H	L	X	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T			S									G	G	G	T															T	T										S	B			T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	N	G	E	Q	S	P	Y	R	D	W	Y	H	V	K	G	F	P	L	K	A	Y	T	A	H	P	N	Y	E	A	W	W	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	E	L	P	K	L	K	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		G	G	G		T	T	G	G	G	B		B		S	S	S			T	T	S	S	S		S	B		B	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	B	B	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.		.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	.	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W
Query Conservation																																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	A	V	R	E	Y	L	L	A	V	A	E	H	W	I	.	R	F	G	V	D	G	W	R	L	D	V	P	N	E	I	P	D	P	T	F	W	R	E	F	R	Q	R	V	K	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	E	A	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																.			T							S	S	G	G	G																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.															.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.
Template Sequence		I	V	G	E	I	W	E	E	A	D	F	W	L	Q	.	.	G	D	X	F	D	A	V	X	N	Y	P	L	A	R	A	V	L	G	F	V	G	G	E	A	L	D	R	D	L	A	A	Q	T	G	L	G	R	I	E	P	L	Q	A	L	A	F	S	H	R	L	E	D	L	F	G	R	Y	R	P	E	V	V	R	A
Template Known Secondary structure							S	S			S	G	G	G	S	.	.	S	S	S		S			B														G	G	G	S						T	T	S	T	T		S																	T	T	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.			.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.									.
Template Sequence		Q	X	N	L	L	T	S	H	D	T	P	R	L	L	S	L	X	R	G	S	V	E	R	A	R	L	A	L	A	L	L	F	L	L	P	G	N	P	T	V	Y	Y	G	E	E	V	G	X	A	G	G	K	D	P	E	N	.	.	.	.	.	R	G	G	X	V	W	E	E	.	A	R	W	Q	K	D	L	R	E	T
Template Known Secondary structure						S			T	T	S							T	T	T													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	T	T	T	.	.	.	.	.								G	.	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.						.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.		.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	Q	T	T	L	.	L	L	K	Q	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.											.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.
Template Sequence		V	K	R	L	A	R	L	R	K	E	H	P	A	L	R	T	A	P	Y	L	R	I	Y	A	Q	D	G	H	L	A	F	A	R	.	.	.	.	G	P	Y	L	A	V	V	N
Template Known Secondary structure													T					S									T	T							.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.					.	.	.	.	.	.	420	.