Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 54 Aligned Residues 383 % Identity 27% Template c1wzaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-amylase a; PDBTitle: crystal structure of alpha-amylase from h.orenii Resolution 1.60 Å

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		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240									.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Sequence		F	E	K	H	G	T	Y	Y	E	I	F	V	R	S	F	Y	D	S	D	G	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	D	L	K	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	N	D	G	D	P	E	T	I	A	D	L	G	V	N	G	I	W	L	M	P	I	F	K	S	P	.
Template Known Secondary structure													G	G	G	S			S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T							S		T	T			S	S				S											S	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template SS confidence
		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	H	G	Y	D	V	T	D	Y	Y	K	I	N	P	D	Y	G	T	L	E	D	F	H	K	L	V	E	A	A	H	Q	R	G	I	K	V	I	I	D	L	P	I	N	H	T	S	E	R	H	P	W	F	L	K	A	S	R	D	K	N	S	E	Y	R	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S			S		S							G	G	G																T	T										S	B			T	T	S								T		T	T		T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Y	V	W	A	G	P	D	T	D	T	K	E	T	K	L	D	G	G	R	V	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	S	P	T	G	M	Y	Y	G	Y	F	W	S	G	M	P	D	L	N	Y	N	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	B		B			S						B		S	S	S		B		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T						S	S		T	T	S		B	B		T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.									.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	E	V	Q	E	K	V	I	G	I	A	K	Y	W	L	.	K	Q	G	V	D	G	F	R	L	D	G	A	M	H	I	F	P	P	A	Q	Y	D	K	N	F	T	W	W	E	K	F	R	Q	E	I	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																.		T	T											T	T	S		G	G	G	T	T														T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.									.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	V	K	P	V	Y	L	V	G	E	V	W	D	I	S	E	T	V	A	P	Y	F	K	Y	G	F	D	S	T	F	N	F	K	L	A	E	A	V	I	A	T	A	K	A	G	F	P	F	G	F	N	K	K	A	K	H	I	Y	G	V	Y	D	R	E	V	G	F	G	N	Y	I	D	A	P	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T	S										S						G	G	G	G	T	T	T		S			B															T		S																		T		T	T	S				B		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		561	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.
Template Sequence		L	T	N	H	D	Q	N	R	I	L	D	Q	L	G	Q	D	R	N	K	A	R	V	A	A	S	I	Y	L	T	L	P	G	N	P	F	I	Y	Y	G	E	E	I	G	M	R	G	Q	G	P	H	E	V	.	.	.	.	I	R	E	P	F	Q	W	Y	N	G	S	G	E	G	E	T	Y	W	E	P	A	M	Y	N
Template Known Secondary structure		S			T	T	S							T	T	T													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S				.	.	.	.		T						S	S	S			T	T				S	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.					.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
												621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.		.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	Q	T	T	L	L	L	K	Q	.	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	F	T	S	V	E	Q	E	E	K	N	L	D	S	L	L	N	H	Y	R	R	L	I	H	F	R	N	E	N	P	V	F	Y	T	G	K	I	E	I	I	N	G	G	L	N	V	V	A	F	R	R	Y	N	D	K	R	D	L	Y	V	Y	H	N
Template Known Secondary structure		T	T	T							T	T		T	T	S																T					S									T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.