Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 470 % Identity 25% Template c1jibA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:neopullulanase; PDBTitle: complex of alpha-amylase ii (tva ii) from thermoactinomyces2 vulgaris r-47 with maltotetraose based on a crystal soaked3 with maltohexaose. Resolution 3.30 Å

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		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.													.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	M	I	S	I	Q	N	A	A	E	P	V	A	S	L	V	R	E	C	P	K	W	D	G	L	P	L	T	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	A	T	F	P	E	G	A	A	V	R	D	Y	Y	S	Q	Q	I	A	I	V	K	N	G	Q	I	M	L	Q	P	A	A	T	S	N	G	L
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	R	A	K	K	G	D	V	V	R	C	E	V	L	Y	A	D	R	Y	A	S	P	E	E	E	L	A	H	A	L	A	G	K	A	G	S	D	E	R	F	D	Y	F	E	A	L	L	E	C	S	T	K	R	V	K	Y	V	F	L	L	T	G	P	Q	G	E	A	V	Y	F	G	E	T	G	F	S	A	E	R
Template Known Secondary structure							T	T	T		S									T	T			S	S	S														S	S											T	T	S											T	T								T	T				S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
		171	.	.	.	.	.								.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.			.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Query Sequence		L	L	L	E	R	A	.	.	.	.	.	.	.	E	T	D	T	S	A	P	F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	.	.	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	K	A	G	V	F	Q	Y	A	Y	I	H	R	S	E	V	F	T	T	P	E	W	A	K	E	A	V	I	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	P	P	G	T	E	Q	W	A	K	D	A	R	P	R	H	D	S	F	Y	G	G	D	L	K	G	V	I	D	R	L	P	Y	L	E	E	L
Template Known Secondary structure		T	T	T										G	G	G	S									T								G	G	G	T					T	T	T			T	T						T	T					T	T													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T	K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	T	A	L	Y	F	T	P	I	F	A	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	H	H	K	Y	D	T	A	D	Y	L	A	I	D	P	Q	F	G	D	L	P	T	F	R	R	L	V	D	E	A	H	R	R	G	I	K	I	I	L	D	A	V	F	N	H	A	G	D	Q	F	F
Template Known Secondary structure		T		S											S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S			S		S							T	T	T															T	T	T										S	B			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.																200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L	G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	R	D	V	L	Q	K	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	R	Y	K	D	W	F	F	I	E	D	F	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	T	S	R	T	N	Y	E	T	F	A	V	Q	V
Template Known Secondary structure										G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G		T	T	G	G	G	S		B		S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S		S	B		B	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260										.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N	K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																															.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																															.
Template Sequence		P	A	M	P	K	L	R	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	E	V	K	E	Y	L	F	D	V	A	R	F	W	M	.	E	Q	G	I	D	G	W	R	L	N	V	A	N	E	V	D	H	A	F	W	R	E	F	R	R	L	V	K	S	L	.
Template Known Secondary structure		T	T		B	B			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																.	T	T	T							T	T	G	G	G	S																.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																															.
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.																								300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.								.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	W	K	K	A	N	P	D	K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	.	.	.	.	.	.	.	D	C	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	D	A	L	I	V	G	E	I	W	H	D	A	S	G	.	.	W	L	M	G	D	Q	F	D	S	V	M	N	Y	L	F	R	E	S	V	I	R	F	F	A	T	G	E	I	H	A	E	R	F	D	A	E	L	T	R	A	R	M	L	Y	P	E	Q	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T								S	S			T	T	.	.	T	T	T	T	T	S		S			B													T	S			S														T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template SS confidence
															346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.			.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.								.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R	L	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	K	A	A	E	L	L	L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	V	S	G	K	S	A	A	S	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.									.
Template Sequence		Q	G	L	W	N	L	L	D	S	H	D	T	E	R	F	L	T	S	C	G	G	N	E	A	K	F	R	L	A	V	L	F	Q	M	T	Y	L	G	T	P	L	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	A	G	A	T	D	P	D	C	.	.	.	.	.	R	R	P	M	I	W	E	E	.	K	E	Q	N	R	G	L	F
Template Known Secondary structure		T	T					S			T	T	S							T	T	T													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	T	T	T	.	.	.	.	.								G	.	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.									.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.						.	470	.	.	.	.	.	.		.	.	.	480	.	.	.	.
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.				.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.
Query Sequence		A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K	Q	T	T	L	L	L	K	Q	.	.	.	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation																														.	.	.
Alig confidence																														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	Y	K	E	L	I	R	L	R	H	R	L	A	S	L	T	R	G	N	V	R	S	W	H	A	D	K	Q	A	N	L	Y	A	F	V	R	T	V	Q	D	Q	H	V	G	V	V	L	N
Template Known Secondary structure															T														T	T	T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.