Job Description P25718 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:17 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 390 % Identity 20% Template c1jgiA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:amylosucrase; PDBTitle: crystal structure of the active site mutant glu328gln of2 amylosucrase from neisseria polysaccharea in complex with3 the natural substrate sucrose Resolution 2.00 Å

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		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	D	W	H	N	A	T	V	Y	F	V	L	T	D	R	F	E	N	G	D	P	S	N	D	Q	S	Y	G	R	H	K	D	G	M	A	E	I	G	T	F	H	G	G	D	L	R	G	L	T	N	K	L	D	Y	L	Q	Q	L	G	V	N	A	L	W	I	S	A	P	F	E	Q	I	H	G	W	V	G	G	G	T
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	S	N	K	Q	V	G	G	V	C	Y	V	D	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	D	L	K	G	L	K	D	K	I	P	Y	F	Q	E	L	G	L	T	Y	L	Y	L	M	P	L	F	K	C	P	E	G	K	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G		T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S							T								T		S								B				S	S		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	G	D	F	P	H	Y	A	Y	H	G	Y	Y	T	Q	D	W	T	N	L	D	A	N	M	G	N	E	A	D	L	R	T	L	V	D	S	A	H	Q	R	G	I	R	I	L	F	D	V	V	M	N	H	T	G	Y	A	T	L	A	D	M	Q	E	Y	Q	F	G	A	L	Y	L	S	G	D	E	V	K	K	S	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	S	D	G	G	Y	A	V	S	S	Y	R	D	V	N	P	A	L	G	T	I	G	D	L	R	E	V	I	A	A	L	H	E	A	G	I	S	A	V	V	D	F	I	F	N	H	T	S	N	E	H	E	W	A	Q	R	C	A	A	G	D	P	L	F	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	T	S		S		S	S	S	B		T	T	T																T	T										S				T	T	S									T		G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	R	W	S	D	W	K	P	A	A	G	Q	T	W	H	S	F	N	D	Y	I	N	F	S	D	K	T	G	W	D	K	W	W	G	K	N	W	I	R	T	D	I	G	D	Y	D	N	P	G	F	D	D	L	T	M	S	L	A	F	L	P	D	I	K	T	E	S	T	T	A	S	G	L	P	V	F	Y	K	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	N	F	Y	Y	I	F	P	D	R	R	M	P	D	Q	Y	D	R	T	L	R	E	I	F	P	D	Q	H	P	G	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	L	E	D	G	R	W	V	W	T	T	F	N	S	F	Q	W	D	L	N	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	T	S	B				S	S	S								T	S				S		T	T	T		S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S						S	S		T	T				B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.												.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.														.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	M	D	T	H	A	K	A	I	D	G	Y	T	P	R	D	Y	L	T	H	W	L	S	Q	W	V	R	D	Y	G	I	D	G	F	R	V	D	T	A	K	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	P	A	W	Q	Q	L	K	T	E	A	S	A	A	L	R	E	W	K	K	A	N	P	D
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	W	V	F	R	A	M	A	G	E	M	L	F	L	A	.	N	L	G	V	D	I	L	R	M	D	A	V	A	F	I	W	K	Q	M	G	T	S	C	E	N	L	P	Q	A	H	A	L	I	R	A	F	N	A	V	M	R	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																.	T	T	T								T	G	G	G	S				T	T	S		S	S	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.		.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.			.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																							.	.
Query SS confidence																											.																							.	.
Query Sequence		K	A	L	D	D	K	P	F	W	M	T	G	E	A	W	G	H	G	V	M	Q	S	D	Y	Y	.	R	H	G	F	D	A	M	I	N	F	D	Y	Q	E	Q	A	A	K	A	V	D	C	.	.	L	A	Q	M	D	T	T	W	Q	Q	M	A	E	K	L	Q	G	F	N	V	L	S	Y	L	S	S	H	D	T	R
Query Conservation																											.																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.																						.																							.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	A	P	A	V	F	F	K	S	Q	A	I	V	H	P	D	Q	V	V	Q	Y	I	G	Q	D	E	C	Q	I	G	Y	N	P	L	Q	M	A	L	L	W	N	T	L	A	T	R	E	V	N	L	L	H	Q	A	L	T	Y	R	H	N	L	P	E	H	T	A	W	V	N	Y	V	R	S	H	D	D	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		T	T									S						G	G	G	B	S	T	T	S	B	S																														S					T	T							S			S	S		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		568	.																																																																				570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	G	D	K	A	A	E	L	L
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	W	T	F	A	D	E	D	A	A	Y	L	G	I	S	G	Y	D	H	R	Q	F	L	N	R	F	F	V	N	R	F	D	G	S	F	A	R	G	V	P	F	Q	Y	N	P	S	T	G	D	C	R	V	S	G	T	A	A	A	L	V	G	L	A	Q	D	D	P	H	A	V	D	R	I	K	L	L	Y	S	I	A
Template Known Secondary structure													T	T															T	T		S	T	T												T	T	T														T	T	T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.								.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.							.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	A	P	G	A	V	Q	I	F	Y	G	D	E	S	S	R	P	F	G	P	.	.	.	.	.	.	.	T	G	S	D	P	L	Q	G	T	R	S	D	M	N	W	Q	D	.	.	.	.	.	.	V	S	G	K	S	A	A	S	V	A	H	W	Q	K	I	S	Q	F	R	A	R	H	P	A	I	G	A	G	K
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	T	G	G	L	P	L	I	Y	L	G	D	E	V	G	T	L	N	D	D	D	W	S	Q	D	S	N	K	S	D	D	S	R	W	A	H	R	P	R	Y	N	E	A	L	Y	A	Q	R	N	D	P	S	T	A	A	G	Q	I	Y	Q	D	L	R	H	M	I	A	V	R	Q	S	N	P	R	F	D	G	G	R
Template Known Secondary structure				S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S	G	G	G		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G										T	T	T	T		T	T	S																				G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.
		648	.	650	.	.	.	.	.			.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.
Query SS confidence										.	.
Query Sequence		Q	T	T	L	L	L	K	Q	.	.	G	Y	G	F	V	R	E	H	G	D	D	K	V	L	V	V	W	A
Query Conservation										.	.
Alig confidence										.	.							.	.	.
Template Conservation																		.	.	.
Template Sequence		L	V	T	F	N	T	N	N	K	H	I	I	G	Y	I	R	.	.	.	N	N	A	L	L	A	F	G	N
Template Known Secondary structure								S		T	T							.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.
Template SS confidence
		556	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.				.	.	.	.	.	.	.	.	580